More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_4201 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_4201  ABC transporter related  100 
 
 		 305 aa  599  1e-170  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2548  ABC transporter related protein  64.21 
 
 		 293 aa  341  1e-92  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0653313  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4025  ABC transporter related  59.72 
 
 		 320 aa  323  2e-87  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.426784 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1267  ABC transporter-like protein  58.27 
 
 		 303 aa  309  4e-83  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3449  ABC transporter related protein  59.23 
 
 		 325 aa  307  2.0000000000000002e-82  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.102969 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  54.32 
 
 		 303 aa  293  2e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36180  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  55.44 
 
 		 311 aa  282  4.0000000000000003e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0255  ABC transporter related  44.33 
 
 		 298 aa  215  7e-55  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339403 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0187  ABC transporter related  43.34 
 
 		 299 aa  215  7e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.852326  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  34.49 
 
 		 300 aa  203  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  34.15 
 
 		 300 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  34.15 
 
 		 300 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  33.45 
 
 		 300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0652  ABC transporter related  38.03 
 
 		 307 aa  200  3e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.673494  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  33.45 
 
 		 300 aa  200  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  33.45 
 
 		 300 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  33.45 
 
 		 300 aa  198  7e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  34.15 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  33.1 
 
 		 300 aa  196  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  33.1 
 
 		 300 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5203  ABC transporter ATP-binding protein  33.45 
 
 		 299 aa  192  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0192  ABC transporter related  39.53 
 
 		 329 aa  192  8e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  41.7 
 
 		 282 aa  189  7e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1723  ABC transporter-like protein  40.78 
 
 		 295 aa  188  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.14632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  48.42 
 
 		 299 aa  188  1e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0289  ABC transporter related  42.05 
 
 		 343 aa  187  1e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.22367 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  48.83 
 
 		 276 aa  187  2e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  46.01 
 
 		 280 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  41.55 
 
 		 290 aa  186  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  39.93 
 
 		 284 aa  185  7e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  50 
 
 		 310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0760  ABC transporter related  36.27 
 
 		 326 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  50 
 
 		 310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  50 
 
 		 310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02230  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.16 
 
 		 320 aa  184  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  49.09 
 
 		 301 aa  183  3e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  39.93 
 
 		 303 aa  182  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  38.28 
 
 		 310 aa  182  9.000000000000001e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  39.55 
 
 		 317 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3003  ABC transporter related  38.05 
 
 		 309 aa  179  4e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000662652  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  34.47 
 
 		 326 aa  179  4e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  47.47 
 
 		 313 aa  179  4e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  45.54 
 
 		 322 aa  179  4.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  38.94 
 
 		 319 aa  178  9e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  46.67 
 
 		 308 aa  178  9e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06310  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.24 
 
 		 323 aa  178  1e-43  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.52931  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1638  ABC transporter related protein  37.98 
 
 		 299 aa  178  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.374187  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  38.03 
 
 		 285 aa  177  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  38.71 
 
 		 309 aa  177  2e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1855  ABC transporter related  36.1 
 
 		 319 aa  177  2e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152779  normal  0.374801 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1940  ABC transporter related  40.62 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1905  ABC transporter related  40.29 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.256972 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.58 
 
 		 304 aa  176  4e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  38.73 
 
 		 301 aa  176  4e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  35.05 
 
 		 339 aa  176  4e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3531  ABC transporter related protein  38.39 
 
 		 319 aa  176  4e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  39.51 
 
 		 300 aa  176  5e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  46.41 
 
 		 308 aa  176  5e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18350  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.05 
 
 		 313 aa  176  5e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0286  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.93 
 
 		 307 aa  176  6e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  41.55 
 
 		 301 aa  175  7e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5717  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.07 
 
 		 332 aa  175  8e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04731  putative multidrug efflux ABC transporter  33.46 
 
 		 338 aa  174  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  47.14 
 
 		 319 aa  174  9.999999999999999e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  44.98 
 
 		 301 aa  174  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  35.37 
 
 		 304 aa  174  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1926  ABC transporter related  37.58 
 
 		 326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  39.66 
 
 		 326 aa  173  2.9999999999999996e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2923  ABC transporter, ATP-binding protein  34.22 
 
 		 308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 311 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2288  ABC transporter related  47.32 
 
 		 304 aa  173  3.9999999999999995e-42  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  40.83 
 
 		 741 aa  172  5e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0673  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.75 
 
 		 338 aa  172  5e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  46.08 
 
 		 309 aa  172  5e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  37.24 
 
 		 306 aa  172  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4093  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.26 
 
 		 312 aa  172  7.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132087  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  46.38 
 
 		 310 aa  171  9e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.5 
 
 		 308 aa  171  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05041  putative multidrug efflux ABC transporter  32.84 
 
 		 338 aa  171  1e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  32.98 
 
 		 305 aa  171  2e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0672  ABC transporter related  40.99 
 
 		 289 aa  169  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422494  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  43.4 
 
 		 313 aa  169  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  38.51 
 
 		 328 aa  169  6e-41  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0392  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.6 
 
 		 347 aa  169  6e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0448  multidrug ABC transporter  32.96 
 
 		 338 aa  169  7e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.380616  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.42 
 
 		 323 aa  169  7e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54604  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  32.63 
 
 		 301 aa  169  7e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  34.54 
 
 		 339 aa  168  8e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.98 
 
 		 308 aa  168  8e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  34.54 
 
 		 339 aa  168  8e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  42.57 
 
 		 322 aa  168  1e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7343  ABC transporter related  47.8 
 
 		 284 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991324 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0256  heme exporter protein CcmA  42.74 
 
 		 291 aa  167  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.197051  normal  0.658869 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  39.72 
 
 		 295 aa  168  1e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0639  multidrug ABC transporter ATPase  36.24 
 
 		 327 aa  168  1e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  43.98 
 
 		 250 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  41.74 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.76 
 
 		 308 aa  167  2e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.516397  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2680  ABC transporter related protein  42.29 
 
 		 297 aa  167  2e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4302  ABC transporter related protein  39.3 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>