More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_2548 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_2548  ABC transporter related protein  100 
 
 		 293 aa  558  1e-158  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0653313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4201  ABC transporter related  64.21 
 
 		 305 aa  357  1.9999999999999998e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4025  ABC transporter related  60.68 
 
 		 320 aa  341  8e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.426784 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1267  ABC transporter-like protein  56.74 
 
 		 303 aa  311  7.999999999999999e-84  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3449  ABC transporter related protein  58.89 
 
 		 325 aa  302  5.000000000000001e-81  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.102969 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  56.41 
 
 		 303 aa  293  2e-78  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36180  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  55.21 
 
 		 311 aa  288  6e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0255  ABC transporter related  44.95 
 
 		 298 aa  225  7e-58  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339403 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0187  ABC transporter related  45.07 
 
 		 299 aa  221  9.999999999999999e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.852326  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  38.15 
 
 		 300 aa  208  9e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  37.05 
 
 		 300 aa  208  1e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 		 300 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  37.05 
 
 		 300 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  36.69 
 
 		 300 aa  206  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  37.63 
 
 		 300 aa  205  7e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0760  ABC transporter related  40 
 
 		 326 aa  205  7e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  35.97 
 
 		 300 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0652  ABC transporter related  40.62 
 
 		 307 aa  203  2e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.673494  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1638  ABC transporter related protein  45.26 
 
 		 299 aa  203  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.374187  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  35.97 
 
 		 300 aa  202  5e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  36.33 
 
 		 300 aa  202  5e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5203  ABC transporter ATP-binding protein  37.63 
 
 		 299 aa  201  8e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1723  ABC transporter-like protein  42.96 
 
 		 295 aa  198  7.999999999999999e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.14632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  36.67 
 
 		 300 aa  196  3e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0289  ABC transporter related  40.89 
 
 		 343 aa  189  5e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.22367 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  39.18 
 
 		 303 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0192  ABC transporter related  38.79 
 
 		 329 aa  182  4.0000000000000006e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0563  ABC transporter related  35.57 
 
 		 311 aa  180  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06310  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.1 
 
 		 323 aa  179  2.9999999999999997e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.52931  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1905  ABC transporter related  40.49 
 
 		 300 aa  179  4e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.256972 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0639  multidrug ABC transporter ATPase  33.67 
 
 		 327 aa  178  8e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2147  ABC transporter, ATP-binding protein  35.71 
 
 		 294 aa  178  1e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.387571  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  38.57 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  38.57 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  38.57 
 
 		 310 aa  178  1e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0411  ABC transporter related  40.34 
 
 		 335 aa  177  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0242  ABC transporter related  37.72 
 
 		 297 aa  177  2e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.197006 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0799  ABC transporter related  39.93 
 
 		 319 aa  177  3e-43  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  40.4 
 
 		 319 aa  177  3e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  37.42 
 
 		 300 aa  176  6e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  48.74 
 
 		 284 aa  175  6e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  40.48 
 
 		 302 aa  175  7e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2941  ABC transporter related  41.43 
 
 		 325 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1940  ABC transporter related  40.14 
 
 		 306 aa  174  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  40.42 
 
 		 299 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  42.14 
 
 		 276 aa  174  1.9999999999999998e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  33.68 
 
 		 305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  38.01 
 
 		 306 aa  172  3.9999999999999995e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1160  ABC transporter related  39.22 
 
 		 315 aa  173  3.9999999999999995e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  37.41 
 
 		 301 aa  172  5e-42  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.38 
 
 		 316 aa  172  5e-42  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  39.26 
 
 		 319 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  39.93 
 
 		 322 aa  171  1e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  40.91 
 
 		 282 aa  171  1e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  33.33 
 
 		 301 aa  171  1e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  41.71 
 
 		 254 aa  171  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  37.75 
 
 		 339 aa  170  2e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3003  ABC transporter related  38.33 
 
 		 309 aa  171  2e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000662652  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1906  ABC transporter related protein  37.98 
 
 		 306 aa  170  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.16 
 
 		 339 aa  171  2e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0691  ABC transporter related  37.68 
 
 		 319 aa  170  3e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.711895  normal  0.844705 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0393  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  38.51 
 
 		 310 aa  169  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2764  ABC transporter related  39.04 
 
 		 308 aa  169  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0722  ABC transporter related  39.45 
 
 		 305 aa  169  6e-41  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0115  ABC transporter related  38.59 
 
 		 302 aa  169  7e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.478521  normal  0.0830163 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0342  ABC transporter related  39.44 
 
 		 306 aa  169  7e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.568895  normal  0.812009 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0163  ABC transporter, ATP-binding protein  39.44 
 
 		 306 aa  169  7e-41  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.138257  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0755  ABC transporter related  39.45 
 
 		 305 aa  169  7e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7343  ABC transporter related  49.28 
 
 		 284 aa  169  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991324 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  32.67 
 
 		 312 aa  168  1e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3565  ABC transporter related  39.06 
 
 		 310 aa  168  1e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.162027  hitchhiker  0.0000528496 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  31 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.04 
 
 		 329 aa  167  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  30.67 
 
 		 312 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1503  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.13 
 
 		 343 aa  167  2e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.59692  normal  0.310998 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  36.42 
 
 		 310 aa  167  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1033  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.03 
 
 		 317 aa  167  2e-40  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.100021 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1911  ABC transporter related  35.81 
 
 		 319 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562875  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  31 
 
 		 312 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02230  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.81 
 
 		 320 aa  167  2.9999999999999998e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  47.47 
 
 		 290 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  31 
 
 		 312 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  36.3 
 
 		 326 aa  166  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  39.32 
 
 		 308 aa  167  2.9999999999999998e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_461  ABC-type transport system, ATPase component  33.22 
 
 		 316 aa  166  4e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00512826  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  31 
 
 		 312 aa  166  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  34.59 
 
 		 298 aa  166  4e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1582  ABC transporter-related protein  40.56 
 
 		 325 aa  166  4e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.060873 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  31 
 
 		 312 aa  166  5e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0496  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.08 
 
 		 316 aa  166  5e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.516721  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  30.33 
 
 		 312 aa  166  5e-40  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  31 
 
 		 312 aa  166  5e-40  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  31.13 
 
 		 311 aa  166  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.22 
 
 		 334 aa  166  5e-40  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  44.93 
 
 		 310 aa  166  5e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4093  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.48 
 
 		 312 aa  166  5.9999999999999996e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132087  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  30.33 
 
 		 312 aa  165  5.9999999999999996e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0746  ABC transporter related  37.58 
 
 		 310 aa  165  6.9999999999999995e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5530  ABC transporter related  38.03 
 
 		 309 aa  165  6.9999999999999995e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.506571  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1698  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.83 
 
 		 338 aa  165  8e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>