More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_1723 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014165  Tbis_1723  ABC transporter-like protein  100 
 
 
295 aa  573  1.0000000000000001e-163  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.14632  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0192  ABC transporter related  55.44 
 
 
329 aa  292  4e-78  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0760  ABC transporter related  51.84 
 
 
326 aa  280  1e-74  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3003  ABC transporter related  52.05 
 
 
309 aa  274  1.0000000000000001e-72  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000662652  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1940  ABC transporter related  53.36 
 
 
306 aa  262  4e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0289  ABC transporter related  49.5 
 
 
343 aa  254  1.0000000000000001e-66  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.22367 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06310  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.55 
 
 
323 aa  238  1e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.52931  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  39.8 
 
 
300 aa  230  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3497  ABC transporter related protein  46.86 
 
 
323 aa  227  1e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0187  ABC transporter related  45.05 
 
 
299 aa  226  3e-58  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.852326  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  39.46 
 
 
300 aa  226  3e-58  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  38.44 
 
 
300 aa  224  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  39.19 
 
 
300 aa  223  2e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  38.44 
 
 
300 aa  224  2e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  38.1 
 
 
300 aa  222  7e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  38.1 
 
 
300 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  38.33 
 
 
300 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  38.1 
 
 
300 aa  220  3e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1638  ABC transporter related protein  49.14 
 
 
299 aa  218  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.374187  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0652  ABC transporter related  42.95 
 
 
307 aa  217  2e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.673494  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1267  ABC transporter-like protein  44.06 
 
 
303 aa  217  2e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5203  ABC transporter ATP-binding protein  38.1 
 
 
299 aa  216  2.9999999999999998e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  37.76 
 
 
300 aa  216  5e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0115  ABC transporter related  43.24 
 
 
302 aa  213  2.9999999999999995e-54  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.478521  normal  0.0830163 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16220  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.56 
 
 
323 aa  212  5.999999999999999e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.4304  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  41.26 
 
 
303 aa  206  3e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2548  ABC transporter related protein  42.96 
 
 
293 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0653313  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  35.74 
 
 
305 aa  193  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1905  ABC transporter related  42.01 
 
 
300 aa  193  3e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.256972 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4025  ABC transporter related  40.41 
 
 
320 aa  192  7e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.426784 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  35.4 
 
 
301 aa  191  2e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  41.44 
 
 
284 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  42.24 
 
 
315 aa  189  4e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3449  ABC transporter related protein  42.36 
 
 
325 aa  189  4e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.102969 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4201  ABC transporter related  40.78 
 
 
305 aa  188  1e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6187  nodulation factor exporter subunit NodI  39.8 
 
 
355 aa  187  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  32.67 
 
 
308 aa  187  2e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  37.62 
 
 
319 aa  186  5e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  33.9 
 
 
295 aa  186  5e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  35.1 
 
 
310 aa  185  7e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  37.71 
 
 
285 aa  185  8e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  39.1 
 
 
280 aa  185  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4029  nodulation ABC transporter NodI  38.82 
 
 
304 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1906  ABC transporter related protein  39.6 
 
 
306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01020  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.72 
 
 
339 aa  183  3e-45  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0255  ABC transporter related  40 
 
 
298 aa  182  5.0000000000000004e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.339403 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  38.28 
 
 
304 aa  181  1e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  41.78 
 
 
276 aa  180  2e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  35.57 
 
 
304 aa  180  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7720  nodulation ABC transporter NodI  37.09 
 
 
304 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948879  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  37.86 
 
 
304 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  37.79 
 
 
320 aa  178  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  37.86 
 
 
326 aa  178  8e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  37.37 
 
 
301 aa  178  1e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  35.53 
 
 
305 aa  177  2e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  35.2 
 
 
305 aa  177  2e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  37.29 
 
 
304 aa  176  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  37.72 
 
 
300 aa  176  5e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  37.34 
 
 
304 aa  176  6e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  39.06 
 
 
301 aa  175  8e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0240  ABC transporter related  37.46 
 
 
311 aa  175  8e-43  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0491819  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  46.26 
 
 
310 aa  175  9e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3829  nodulation ABC transporter NodI  37.83 
 
 
308 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.889948  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  36.96 
 
 
304 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  36.96 
 
 
304 aa  174  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  34.64 
 
 
305 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5039  nodulation factor exporter subunit NodI  35.97 
 
 
345 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  38.44 
 
 
322 aa  172  6.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2585  ABC transporter related  37.76 
 
 
308 aa  172  7.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345311  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4919  nodulation factor exporter subunit NodI  37 
 
 
342 aa  172  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  37.91 
 
 
309 aa  171  9e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2147  ABC transporter, ATP-binding protein  35.4 
 
 
294 aa  171  2e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.387571  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  36.57 
 
 
373 aa  170  2e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2475  nodulation ABC transporter NodI  38.28 
 
 
304 aa  169  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  38.96 
 
 
308 aa  169  4e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  40.4 
 
 
310 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  40.4 
 
 
310 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  40.4 
 
 
310 aa  169  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  37.75 
 
 
321 aa  169  5e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  38.26 
 
 
741 aa  169  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  32.18 
 
 
283 aa  169  7e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2430  ABC transporter related  36.73 
 
 
303 aa  169  8e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0400473  normal  0.675282 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  34.95 
 
 
293 aa  168  1e-40  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  37.83 
 
 
320 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36180  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.78 
 
 
311 aa  168  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  37.86 
 
 
305 aa  168  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  39.22 
 
 
320 aa  168  1e-40  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  36.89 
 
 
324 aa  168  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02230  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.04 
 
 
320 aa  167  2e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  39.83 
 
 
308 aa  167  2e-40  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2316  ABC transporter related  37.09 
 
 
307 aa  166  4e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001403  ABC-type multidrug transport system ATPase component  35.6 
 
 
308 aa  166  5.9999999999999996e-40  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  37.67 
 
 
310 aa  165  8e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2760  ABC transporter related  37.66 
 
 
318 aa  165  8e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  39.4 
 
 
338 aa  165  9e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2940  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.26 
 
 
335 aa  164  1.0000000000000001e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.121696 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  37.1 
 
 
313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2008  nodulation ABC transporter NodI  35.08 
 
 
351 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.21 
 
 
305 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0801  nodulation ABC transporter NodI  35.08 
 
 
304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.485655  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>