More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0760 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_0760  ABC transporter related  100 
 
 		 326 aa  659    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3003  ABC transporter related  50.5 
 
 		 309 aa  288  6e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000662652  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0289  ABC transporter related  48.78 
 
 		 343 aa  285  1.0000000000000001e-75  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.22367 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0192  ABC transporter related  46.6 
 
 		 329 aa  281  8.000000000000001e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1723  ABC transporter-like protein  51.84 
 
 		 295 aa  280  2e-74  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.14632  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1940  ABC transporter related  46.86 
 
 		 306 aa  264  2e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0115  ABC transporter related  43.05 
 
 		 302 aa  239  5e-62  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.478521  normal  0.0830163 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  41.78 
 
 		 303 aa  231  2e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3497  ABC transporter related protein  40.85 
 
 		 323 aa  229  4e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  39.14 
 
 		 300 aa  229  7e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  38.16 
 
 		 300 aa  226  4e-58  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06310  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.79 
 
 		 323 aa  226  5.0000000000000005e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.52931  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  37.83 
 
 		 300 aa  226  6e-58  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  38 
 
 		 300 aa  225  7e-58  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  37.83 
 
 		 300 aa  225  8e-58  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  38.06 
 
 		 300 aa  224  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  37.83 
 
 		 300 aa  224  1e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  37.72 
 
 		 300 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0652  ABC transporter related  41 
 
 		 307 aa  221  9.999999999999999e-57  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.673494  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  37.72 
 
 		 300 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  37.17 
 
 		 300 aa  219  6e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1638  ABC transporter related protein  44.33 
 
 		 299 aa  219  7e-56  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.374187  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5203  ABC transporter ATP-binding protein  36.54 
 
 		 299 aa  216  5e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16220  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.86 
 
 		 323 aa  214  1.9999999999999998e-54  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.4304  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1906  ABC transporter related protein  39.06 
 
 		 306 aa  205  1e-51  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01020  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.44 
 
 		 339 aa  201  9.999999999999999e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1267  ABC transporter-like protein  37.92 
 
 		 303 aa  196  3e-49  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2548  ABC transporter related protein  40 
 
 		 293 aa  196  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0653313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0187  ABC transporter related  38.82 
 
 		 299 aa  194  2e-48  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.852326  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4025  ABC transporter related  36.91 
 
 		 320 aa  192  7e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.426784 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0255  ABC transporter related  36.09 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339403 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4201  ABC transporter related  36.27 
 
 		 305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  35.08 
 
 		 310 aa  177  3e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3449  ABC transporter related protein  37.54 
 
 		 325 aa  177  3e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.102969 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  34.92 
 
 		 319 aa  176  7e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1905  ABC transporter related  39.62 
 
 		 300 aa  175  8e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.256972 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  38.13 
 
 		 319 aa  171  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36180  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35 
 
 		 311 aa  164  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  35.4 
 
 		 310 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02230  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  35 
 
 		 320 aa  162  8.000000000000001e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1503  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.23 
 
 		 343 aa  161  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.59692  normal  0.310998 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1585  ABC transporter related  36.03 
 
 		 321 aa  162  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.719287  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3531  ABC transporter related protein  34.43 
 
 		 319 aa  161  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  38.53 
 
 		 285 aa  160  3e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  30.85 
 
 		 305 aa  159  7e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  39.18 
 
 		 314 aa  158  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  38.53 
 
 		 320 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  36.97 
 
 		 374 aa  157  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  40 
 
 		 284 aa  157  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  31.17 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  30.5 
 
 		 301 aa  156  4e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0043  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.75 
 
 		 337 aa  155  7e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  34.65 
 
 		 299 aa  155  7e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0722  ABC transporter related  32.45 
 
 		 305 aa  155  9e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  35.05 
 
 		 309 aa  155  1e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  38.36 
 
 		 304 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  38.36 
 
 		 304 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  33.45 
 
 		 388 aa  155  1e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2008  nodulation ABC transporter NodI  37.73 
 
 		 351 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5589  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.62 
 
 		 327 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0360  nodulation ABC transporter NodI  37.73 
 
 		 351 aa  154  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146737  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  33.55 
 
 		 331 aa  154  2e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1218  nodulation ABC transporter NodI  37.73 
 
 		 306 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.513325  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0291  ABC-type multidrug transport system ATPase component  36.86 
 
 		 324 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1703  nodulation ABC transporter NodI  37.73 
 
 		 304 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1840  nodulation ABC transporter NodI  37.73 
 
 		 304 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1855  nodulation ABC transporter NodI  37.73 
 
 		 304 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1698  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.74 
 
 		 338 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0801  nodulation ABC transporter NodI  37.73 
 
 		 304 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.485655  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2485  nodulation ABC transporter NodI  37.27 
 
 		 344 aa  153  4e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0505  ABC transporter related protein  35.23 
 
 		 323 aa  153  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0755  ABC transporter related  32.45 
 
 		 305 aa  152  5e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  37.44 
 
 		 373 aa  152  7e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  37.21 
 
 		 280 aa  152  7e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  37.23 
 
 		 304 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0582  ABC transporter related protein  33.78 
 
 		 310 aa  152  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  33.56 
 
 		 315 aa  152  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2147  ABC transporter, ATP-binding protein  37.31 
 
 		 294 aa  151  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.387571  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1776  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.35 
 
 		 319 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179608 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3246  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.39 
 
 		 321 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.61 
 
 		 310 aa  151  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.317764  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  34.41 
 
 		 308 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  37.66 
 
 		 326 aa  150  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  32.34 
 
 		 304 aa  151  2e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  37.66 
 
 		 304 aa  150  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3883  ABC transporter related  34.62 
 
 		 321 aa  149  5e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  0.151879 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0096  putative ATP-binding component of a transport system  35.48 
 
 		 312 aa  149  6e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.546673  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1019  ABC transporter-related protein  32.89 
 
 		 343 aa  149  7e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0392  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.74 
 
 		 347 aa  149  9e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  32.68 
 
 		 308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  35.02 
 
 		 313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22040  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  36.25 
 
 		 345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  36.91 
 
 		 304 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.57 
 
 		 305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  34.23 
 
 		 315 aa  148  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0345  ABC transporter related  34.14 
 
 		 302 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0599235  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2774  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.14 
 
 		 320 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0106615  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.41 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54604  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0505  ABC transporter related  36.22 
 
 		 308 aa  147  2.0000000000000003e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.509772  normal  0.852772 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  37.27 
 
 		 276 aa  147  2.0000000000000003e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>