More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0289 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0289  ABC transporter related  100 
 
 
343 aa  669    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.22367 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3003  ABC transporter related  50.49 
 
 
309 aa  288  9e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000662652  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1906  ABC transporter related protein  52.96 
 
 
306 aa  288  1e-76  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0115  ABC transporter related  54.39 
 
 
302 aa  286  5e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.478521  normal  0.0830163 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0760  ABC transporter related  48.78 
 
 
326 aa  285  1.0000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3497  ABC transporter related protein  53.09 
 
 
323 aa  285  1.0000000000000001e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0192  ABC transporter related  52.98 
 
 
329 aa  283  2.0000000000000002e-75  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1940  ABC transporter related  52.3 
 
 
306 aa  258  7e-68  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1723  ABC transporter-like protein  49.5 
 
 
295 aa  254  2.0000000000000002e-66  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.14632  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01020  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.83 
 
 
339 aa  241  1e-62  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16220  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.08 
 
 
323 aa  236  6e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.4304  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06310  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.21 
 
 
323 aa  227  2e-58  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.52931  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  40 
 
 
300 aa  221  9.999999999999999e-57  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  40.88 
 
 
300 aa  219  6e-56  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  40.88 
 
 
300 aa  218  8.999999999999998e-56  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  43.62 
 
 
303 aa  218  1e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  39.29 
 
 
300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  42.34 
 
 
300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  39.78 
 
 
300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  40.15 
 
 
300 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  40.15 
 
 
300 aa  213  2.9999999999999995e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  40.15 
 
 
300 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0652  ABC transporter related  44.25 
 
 
307 aa  212  5.999999999999999e-54  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.673494  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  40.15 
 
 
300 aa  212  7.999999999999999e-54  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1638  ABC transporter related protein  46.85 
 
 
299 aa  210  3e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.374187  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5203  ABC transporter ATP-binding protein  39.78 
 
 
299 aa  205  7e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4025  ABC transporter related  40.97 
 
 
320 aa  196  4.0000000000000005e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.426784 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1267  ABC transporter-like protein  39.22 
 
 
303 aa  193  4e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  39.16 
 
 
319 aa  188  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4201  ABC transporter related  42.05 
 
 
305 aa  187  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3449  ABC transporter related protein  42.01 
 
 
325 aa  186  6e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.102969 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2548  ABC transporter related protein  40.89 
 
 
293 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0653313  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0255  ABC transporter related  37.89 
 
 
298 aa  180  2.9999999999999997e-44  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.339403 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0187  ABC transporter related  40.13 
 
 
299 aa  176  4e-43  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.852326  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  38.65 
 
 
301 aa  176  6e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  33.1 
 
 
310 aa  176  7e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  38.94 
 
 
305 aa  176  7e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  39.27 
 
 
319 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  43.64 
 
 
276 aa  173  5e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  40 
 
 
306 aa  172  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  33.67 
 
 
304 aa  172  7.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  30.74 
 
 
305 aa  171  1e-41  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  37.11 
 
 
280 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  45.37 
 
 
374 aa  170  3e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02230  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.46 
 
 
320 aa  170  3e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  41.33 
 
 
284 aa  170  4e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  30.41 
 
 
301 aa  169  5e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  35.41 
 
 
309 aa  169  8e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  33.33 
 
 
295 aa  168  1e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  38.49 
 
 
310 aa  168  1e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  37.33 
 
 
283 aa  168  1e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  36.15 
 
 
301 aa  166  5e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1776  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.46 
 
 
319 aa  166  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.179608 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0291  ABC-type multidrug transport system ATPase component  36.88 
 
 
324 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  32.99 
 
 
308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  42.22 
 
 
290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  42.67 
 
 
282 aa  164  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  37.29 
 
 
312 aa  162  8.000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2774  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.53 
 
 
320 aa  162  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0106615  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  45.54 
 
 
388 aa  161  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  40.95 
 
 
285 aa  161  2e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2940  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.42 
 
 
335 aa  161  2e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.121696 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1484  nodulation ABC transporter NodI  41.23 
 
 
309 aa  160  3e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.374303  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  35.5 
 
 
335 aa  160  3e-38  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  37.41 
 
 
373 aa  160  3e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2008  nodulation ABC transporter NodI  37.41 
 
 
351 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0360  nodulation ABC transporter NodI  37.41 
 
 
351 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146737  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1855  nodulation ABC transporter NodI  37.28 
 
 
304 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0747  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.42 
 
 
345 aa  160  4e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1703  nodulation ABC transporter NodI  37.28 
 
 
304 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1840  nodulation ABC transporter NodI  37.28 
 
 
304 aa  159  4e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0801  nodulation ABC transporter NodI  37.28 
 
 
304 aa  159  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.485655  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  35.46 
 
 
310 aa  160  4e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1208  ABC transporter related  34.91 
 
 
339 aa  159  4e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697219  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1218  nodulation ABC transporter NodI  37.28 
 
 
306 aa  159  5e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.513325  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.08 
 
 
305 aa  159  5e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3453  ABC transporter related  36.04 
 
 
323 aa  159  9e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.155551  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1720  ABC transporter, ATPase subunit  34.48 
 
 
315 aa  158  1e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.062047  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1911  ABC transporter related  35.05 
 
 
319 aa  158  1e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.562875  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  38.21 
 
 
322 aa  158  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2969  ABC transporter related protein  39.41 
 
 
373 aa  157  2e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.297443  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  38.69 
 
 
318 aa  157  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2485  nodulation ABC transporter NodI  36.33 
 
 
344 aa  157  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3531  ABC transporter related protein  41.12 
 
 
319 aa  157  3e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  37.23 
 
 
326 aa  157  3e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  37.68 
 
 
320 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2288  ABC transporter related  36.04 
 
 
304 aa  156  5.0000000000000005e-37  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  37.23 
 
 
304 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  41.18 
 
 
309 aa  155  7e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2042  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.42 
 
 
328 aa  155  7e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.025568  hitchhiker  0.00730149 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1036  ABC transporter related  38.18 
 
 
328 aa  155  7e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  40.5 
 
 
311 aa  155  7e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  37.21 
 
 
337 aa  155  8e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0672  ABC transporter related  37.1 
 
 
289 aa  155  8e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422494  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0191  ABC transporter-like  34.16 
 
 
339 aa  155  9e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0494849 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1742  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  36.51 
 
 
319 aa  155  9e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0557624  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  39.83 
 
 
301 aa  155  9e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1585  ABC transporter related  37.58 
 
 
321 aa  155  9e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.719287  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  33.96 
 
 
339 aa  155  1e-36  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
305 aa  155  1e-36  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>