More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_36180 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_36180  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  100 
 
 		 311 aa  608  1e-173  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4025  ABC transporter related  59.73 
 
 		 320 aa  335  5e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.426784 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3449  ABC transporter related protein  63.01 
 
 		 325 aa  327  1.0000000000000001e-88  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.102969 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4201  ABC transporter related  55.44 
 
 		 305 aa  297  1e-79  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1267  ABC transporter-like protein  52.86 
 
 		 303 aa  296  3e-79  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2548  ABC transporter related protein  55.21 
 
 		 293 aa  285  7e-76  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0653313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  48.61 
 
 		 303 aa  271  1e-71  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0187  ABC transporter related  44.44 
 
 		 299 aa  217  2e-55  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.852326  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0652  ABC transporter related  38.61 
 
 		 307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.673494  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0255  ABC transporter related  42.4 
 
 		 298 aa  204  1e-51  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339403 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  35.49 
 
 		 300 aa  201  1.9999999999999998e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  34.81 
 
 		 300 aa  200  3e-50  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  35.49 
 
 		 300 aa  199  5e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  35.49 
 
 		 300 aa  199  6e-50  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  35.49 
 
 		 300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  34.81 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  35.15 
 
 		 300 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  34.47 
 
 		 300 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  48.82 
 
 		 322 aa  195  7e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  35.47 
 
 		 300 aa  194  1e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  38.29 
 
 		 322 aa  194  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5203  ABC transporter ATP-binding protein  35.15 
 
 		 299 aa  192  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1905  ABC transporter related  39.8 
 
 		 300 aa  187  1e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.256972 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  40.13 
 
 		 284 aa  188  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  32.88 
 
 		 308 aa  186  3e-46  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  34.47 
 
 		 300 aa  186  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3003  ABC transporter related  38.49 
 
 		 309 aa  186  5e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000662652  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1723  ABC transporter-like protein  38.78 
 
 		 295 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.14632  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  40.59 
 
 		 330 aa  182  6e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0192  ABC transporter related  37.5 
 
 		 329 aa  181  1e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0760  ABC transporter related  35 
 
 		 326 aa  181  2e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1638  ABC transporter related protein  39.93 
 
 		 299 aa  178  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.374187  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  37.76 
 
 		 306 aa  178  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1940  ABC transporter related  39.14 
 
 		 306 aa  177  2e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3122  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.46 
 
 		 334 aa  176  4e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  34.53 
 
 		 332 aa  176  5e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  45.71 
 
 		 303 aa  175  8e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0279  ABC transporter related protein  42.08 
 
 		 262 aa  174  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.619097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0722  ABC transporter related  38.24 
 
 		 305 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  37.42 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  37.82 
 
 		 314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0191  ABC transporter-like  41.28 
 
 		 339 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0494849 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06310  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.38 
 
 		 323 aa  173  2.9999999999999996e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.52931  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2941  ABC transporter related  38.39 
 
 		 325 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0799  ABC transporter related  37.62 
 
 		 319 aa  173  3.9999999999999995e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.114621  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  37.62 
 
 		 319 aa  173  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0102  ABC transporter related  43.44 
 
 		 250 aa  173  3.9999999999999995e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.85955  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0925  ABC transporter related  39.63 
 
 		 256 aa  172  5.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  33.67 
 
 		 304 aa  172  7.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  33.67 
 
 		 305 aa  171  1e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0242  ABC transporter related  39.32 
 
 		 297 aa  171  1e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.197006 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4456  ABC transporter related  38.83 
 
 		 319 aa  171  1e-41  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.146608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  36.42 
 
 		 310 aa  170  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  36.25 
 
 		 308 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  33.22 
 
 		 305 aa  171  2e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0755  ABC transporter related  37.58 
 
 		 305 aa  171  2e-41  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.96491 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1160  ABC transporter related  35.56 
 
 		 315 aa  170  3e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  33.89 
 
 		 305 aa  170  3e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  38.36 
 
 		 301 aa  170  3e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3389  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.48 
 
 		 334 aa  170  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.491348  normal  0.26323 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2288  ABC transporter related  44.26 
 
 		 304 aa  169  6e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  39.13 
 
 		 302 aa  169  8e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0984  ABC transporter related  37.95 
 
 		 308 aa  169  8e-41  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2923  ABC transporter, ATP-binding protein  33.99 
 
 		 308 aa  168  8e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2147  ABC transporter, ATP-binding protein  38.74 
 
 		 294 aa  169  8e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.387571  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1019  ABC transporter-related protein  36.02 
 
 		 343 aa  169  8e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.884497  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  37.11 
 
 		 319 aa  168  9e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  31.54 
 
 		 295 aa  167  1e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25200  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.73 
 
 		 317 aa  168  1e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  35.39 
 
 		 300 aa  168  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1894  ABC-type multidrug transporter ATPase  44.34 
 
 		 302 aa  167  2e-40  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3283  ABC transporter related  33.22 
 
 		 306 aa  167  2e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.576419 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  39.37 
 
 		 299 aa  167  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0323  ABC transporter related  36.63 
 
 		 308 aa  166  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0286844  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1582  ABC transporter-related protein  38.61 
 
 		 325 aa  166  4e-40  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.060873 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  40.26 
 
 		 339 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1906  ABC transporter related protein  37.12 
 
 		 306 aa  166  5e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0835  ABC transporter, ATPase subunit  36.33 
 
 		 309 aa  166  5e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.594095  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  40.26 
 
 		 339 aa  166  5e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  39.46 
 
 		 301 aa  166  5.9999999999999996e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  35.74 
 
 		 309 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0347  ABC transporter related  36.63 
 
 		 308 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.50256  normal  0.164756 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2014  ABC transporter related  35.44 
 
 		 309 aa  166  5.9999999999999996e-40  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0673  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.81 
 
 		 338 aa  165  8e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0897  ABC transporter related  37.25 
 
 		 309 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3518  ABC transporter, ATPase subunit  36.54 
 
 		 308 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.461095  normal  0.297301 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  31.99 
 
 		 327 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  37.88 
 
 		 328 aa  164  1.0000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2860  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.35 
 
 		 366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.162842  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  33.01 
 
 		 339 aa  164  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2831  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  35.35 
 
 		 366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.116733  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2715  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.28 
 
 		 322 aa  164  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.832052 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0338  ABC transporter related  36.3 
 
 		 308 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.892099  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2875  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.35 
 
 		 366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.211431 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06461  putative multidrug efflux ABC transporter  40.6 
 
 		 337 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.645354 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0826  putative ATP-binding ABC transporter protein  38.85 
 
 		 334 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  32.57 
 
 		 311 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  33.66 
 
 		 326 aa  163  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02230  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.87 
 
 		 320 aa  163  3e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0894  ABC transporter related  42.99 
 
 		 298 aa  163  3e-39  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.230749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>