More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_1768 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  100 
 
 		 304 aa  615  1e-175  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  91.78 
 
 		 304 aa  571  1.0000000000000001e-162  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2475  nodulation ABC transporter NodI  97.37 
 
 		 304 aa  570  1.0000000000000001e-162  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1218  nodulation ABC transporter NodI  83.55 
 
 		 306 aa  521  1e-147  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.513325  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0360  nodulation ABC transporter NodI  83.55 
 
 		 351 aa  521  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146737  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2008  nodulation ABC transporter NodI  83.55 
 
 		 351 aa  521  1e-147  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0801  nodulation ABC transporter NodI  83.55 
 
 		 304 aa  521  1e-147  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.485655  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1840  nodulation ABC transporter NodI  83.55 
 
 		 304 aa  521  1e-147  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1703  nodulation ABC transporter NodI  83.55 
 
 		 304 aa  521  1e-147  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1855  nodulation ABC transporter NodI  83.22 
 
 		 304 aa  519  1e-146  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2485  nodulation ABC transporter NodI  82.57 
 
 		 344 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  81.91 
 
 		 373 aa  513  1e-144  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  81.25 
 
 		 304 aa  507  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  80.92 
 
 		 304 aa  504  9.999999999999999e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  80.59 
 
 		 320 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  81.25 
 
 		 326 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  80.92 
 
 		 304 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  80.92 
 
 		 304 aa  503  1e-141  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  74.33 
 
 		 320 aa  454  1e-127  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  74.33 
 
 		 321 aa  449  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  73.67 
 
 		 320 aa  449  1e-125  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2457  nodulation ABC transporter NodI  71.1 
 
 		 303 aa  439  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0229805  normal  0.246765 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7720  nodulation ABC transporter NodI  70.39 
 
 		 304 aa  436  1e-121  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6187  nodulation factor exporter subunit NodI  68.75 
 
 		 355 aa  427  1e-119  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4029  nodulation ABC transporter NodI  70.63 
 
 		 304 aa  426  1e-118  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5039  nodulation factor exporter subunit NodI  67.33 
 
 		 345 aa  415  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2295  nodulation ABC transporter NodI  69.44 
 
 		 325 aa  412  1e-114  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4919  nodulation factor exporter subunit NodI  68.79 
 
 		 342 aa  413  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3829  nodulation ABC transporter NodI  64.69 
 
 		 308 aa  399  9.999999999999999e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.889948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4160  ABC transporter related  61.72 
 
 		 314 aa  369  1e-101  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3558  ABC transporter related  58.69 
 
 		 307 aa  362  6e-99  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0440586  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4964  ABC transporter related  59.14 
 
 		 327 aa  355  5e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3711  ABC transporter related  58.96 
 
 		 323 aa  355  7.999999999999999e-97  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0277  ABC-2 type transporter ATPase  62.33 
 
 		 301 aa  353  2e-96  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.449682  normal  0.943388 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0633  ABC transporter related  56.41 
 
 		 314 aa  353  2e-96  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3573  ABC transporter related  55.31 
 
 		 313 aa  348  5e-95  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1144  ABC transporter related  57.67 
 
 		 312 aa  344  1e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  56.48 
 
 		 322 aa  335  5e-91  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4259  ABC transporter-related protein  58.44 
 
 		 315 aa  333  2e-90  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  53.77 
 
 		 315 aa  321  8e-87  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1092  ABC transporter related  56.25 
 
 		 310 aa  315  6e-85  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.291374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0240  ABC transporter related  56.66 
 
 		 311 aa  313  2.9999999999999996e-84  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0491819  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1484  nodulation ABC transporter NodI  52.36 
 
 		 309 aa  306  3e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.374303  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3306  ABC transporter related  51 
 
 		 302 aa  305  6e-82  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2837  ABC transporter related  49.51 
 
 		 309 aa  296  4e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.140237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3236  ABC transporter, ATP-binding protein, NodI family  49.51 
 
 		 309 aa  296  4e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  48.69 
 
 		 326 aa  285  7e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  50.5 
 
 		 311 aa  285  8e-76  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  48.68 
 
 		 311 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  47.83 
 
 		 339 aa  273  3e-72  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1864  ABC transporter related  47.37 
 
 		 303 aa  272  4.0000000000000004e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.319064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  48.53 
 
 		 306 aa  271  1e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  47.46 
 
 		 293 aa  271  1e-71  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  46.1 
 
 		 305 aa  270  2e-71  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  46.08 
 
 		 312 aa  268  8e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  47.02 
 
 		 328 aa  268  8e-71  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2518  ABC transporter related  45.25 
 
 		 310 aa  266  2e-70  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0818783  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25200  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.99 
 
 		 317 aa  264  1e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  46.2 
 
 		 310 aa  262  4e-69  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  46.56 
 
 		 310 aa  262  4.999999999999999e-69  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1117  ABC transporter related  50.67 
 
 		 317 aa  260  2e-68  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0874  ABC transporter related  47.16 
 
 		 312 aa  258  1e-67  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.468306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  47.51 
 
 		 332 aa  254  1.0000000000000001e-66  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3796  ABC transporter related  43.19 
 
 		 323 aa  249  4e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0667  ABC transporter related  44.59 
 
 		 307 aa  245  6.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.201988 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1802  ABC transporter related  44.94 
 
 		 340 aa  243  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0987  ABC transporter related  42.57 
 
 		 305 aa  232  6e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4128  ABC transporter related protein  42.43 
 
 		 313 aa  229  4e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.927584  hitchhiker  0.00834769 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  40.97 
 
 		 304 aa  219  7e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4649  ABC transporter related protein  42.76 
 
 		 300 aa  217  2e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14569  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.16 
 
 		 339 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.71 
 
 		 279 aa  210  3e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1526  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.61 
 
 		 330 aa  208  8e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00601366  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1213  ABC transporter related  41.25 
 
 		 309 aa  208  9e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.715047  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0520  daunorubicin resistance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  39.34 
 
 		 316 aa  207  2e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0170038  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  40.39 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0389  ABC transporter related  39.4 
 
 		 305 aa  207  2e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4576  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.58 
 
 		 343 aa  207  3e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885138  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0557  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.48 
 
 		 279 aa  205  6e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0461  ABC-type multidrug transport system ATPase component  40.46 
 
 		 320 aa  205  7e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0747  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.02 
 
 		 345 aa  204  1e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30720  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  39.69 
 
 		 353 aa  204  1e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.933735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3064  ABC transporter, ATPase subunit  41.61 
 
 		 315 aa  204  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  41.1 
 
 		 319 aa  205  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4701  ABC transporter related protein  40.45 
 
 		 311 aa  204  1e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483925  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.03 
 
 		 328 aa  204  2e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.42 
 
 		 328 aa  204  2e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3588  putative ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.87 
 
 		 322 aa  204  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1698  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.92 
 
 		 338 aa  203  3e-51  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  38.46 
 
 		 330 aa  202  4e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_002936  DET0410  nodulation ATP-binding protein I  40.4 
 
 		 305 aa  202  6e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  38.13 
 
 		 282 aa  202  6e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.06 
 
 		 312 aa  202  6e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  40.72 
 
 		 312 aa  202  7e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.21 
 
 		 322 aa  202  7e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1776  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.06 
 
 		 319 aa  202  8e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179608 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  36.72 
 
 		 310 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  37.1 
 
 		 327 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  38.98 
 
 		 308 aa  201  9.999999999999999e-51  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0553  ABC transporter related  40 
 
 		 279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>