More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4259 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008752  Aave_4259  ABC transporter-related protein  100 
 
 
315 aa  632  1e-180  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3711  ABC transporter related  80.75 
 
 
323 aa  502  1e-141  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3573  ABC transporter related  76.92 
 
 
313 aa  487  1e-136  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4964  ABC transporter related  80.06 
 
 
327 aa  483  1e-135  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0633  ABC transporter related  77.32 
 
 
314 aa  476  1e-133  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3558  ABC transporter related  75.96 
 
 
307 aa  463  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0440586  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1144  ABC transporter related  75.56 
 
 
312 aa  452  1.0000000000000001e-126  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  59.43 
 
 
320 aa  360  2e-98  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  58.44 
 
 
320 aa  357  9.999999999999999e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4160  ABC transporter related  59.02 
 
 
314 aa  353  1e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  59.09 
 
 
304 aa  349  3e-95  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  58.97 
 
 
304 aa  348  9e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2457  nodulation ABC transporter NodI  57.88 
 
 
303 aa  348  9e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0229805  normal  0.246765 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  57.86 
 
 
321 aa  347  2e-94  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  57.96 
 
 
373 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1218  nodulation ABC transporter NodI  58.47 
 
 
306 aa  342  5e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.513325  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2008  nodulation ABC transporter NodI  59.15 
 
 
351 aa  341  9e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0360  nodulation ABC transporter NodI  59.15 
 
 
351 aa  341  9e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146737  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2485  nodulation ABC transporter NodI  58.77 
 
 
344 aa  340  1e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1840  nodulation ABC transporter NodI  59.15 
 
 
304 aa  341  1e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1855  nodulation ABC transporter NodI  59.15 
 
 
304 aa  341  1e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0801  nodulation ABC transporter NodI  59.15 
 
 
304 aa  341  1e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.485655  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1703  nodulation ABC transporter NodI  59.15 
 
 
304 aa  341  1e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  57.47 
 
 
304 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  57.79 
 
 
326 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  57.79 
 
 
304 aa  337  9.999999999999999e-92  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2475  nodulation ABC transporter NodI  59.74 
 
 
304 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  57.79 
 
 
304 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  57.79 
 
 
304 aa  336  2.9999999999999997e-91  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  57.14 
 
 
320 aa  334  1e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4919  nodulation factor exporter subunit NodI  55.45 
 
 
342 aa  328  1.0000000000000001e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5039  nodulation factor exporter subunit NodI  54.46 
 
 
345 aa  325  6e-88  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2295  nodulation ABC transporter NodI  57.23 
 
 
325 aa  322  4e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6187  nodulation factor exporter subunit NodI  53.57 
 
 
355 aa  310  2e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7720  nodulation ABC transporter NodI  52.7 
 
 
304 aa  308  9e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948879  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  52.24 
 
 
322 aa  302  5.000000000000001e-81  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4029  nodulation ABC transporter NodI  52.24 
 
 
304 aa  301  8.000000000000001e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3829  nodulation ABC transporter NodI  53.82 
 
 
308 aa  301  1e-80  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.889948  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0277  ABC-2 type transporter ATPase  54.05 
 
 
301 aa  299  5e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.449682  normal  0.943388 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  49.68 
 
 
315 aa  294  2e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1092  ABC transporter related  53.47 
 
 
310 aa  293  3e-78  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.291374  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1484  nodulation ABC transporter NodI  48.71 
 
 
309 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.374303  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3306  ABC transporter related  51.32 
 
 
302 aa  278  8e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0240  ABC transporter related  52.58 
 
 
311 aa  277  1e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0491819  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  49.05 
 
 
310 aa  272  7e-72  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3236  ABC transporter, ATP-binding protein, NodI family  50.8 
 
 
309 aa  271  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2837  ABC transporter related  50.8 
 
 
309 aa  271  1e-71  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.140237  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  49.37 
 
 
311 aa  269  4e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  47.15 
 
 
310 aa  260  3e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  47.2 
 
 
312 aa  257  2e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1864  ABC transporter related  46.33 
 
 
303 aa  252  6e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.319064 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  45.4 
 
 
306 aa  241  9e-63  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  42.12 
 
 
305 aa  240  2e-62  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  44.63 
 
 
339 aa  239  4e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  45.94 
 
 
311 aa  239  5e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  43.79 
 
 
326 aa  238  6.999999999999999e-62  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  44.34 
 
 
293 aa  238  8e-62  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0874  ABC transporter related  43.03 
 
 
312 aa  238  8e-62  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.468306  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25200  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.9 
 
 
317 aa  235  6e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  45.69 
 
 
332 aa  235  6e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  45.82 
 
 
328 aa  235  9e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1117  ABC transporter related  47.21 
 
 
317 aa  232  5e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4128  ABC transporter related protein  42.99 
 
 
313 aa  231  8.000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.927584  hitchhiker  0.00834769 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2518  ABC transporter related  41.14 
 
 
310 aa  229  3e-59  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0818783  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0667  ABC transporter related  41.59 
 
 
307 aa  225  6e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.201988 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1802  ABC transporter related  43.41 
 
 
340 aa  222  7e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3796  ABC transporter related  40.13 
 
 
323 aa  217  2e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0987  ABC transporter related  42.52 
 
 
305 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  41.47 
 
 
282 aa  206  5e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  41.18 
 
 
319 aa  204  1e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.87 
 
 
328 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4649  ABC transporter related protein  40.13 
 
 
300 aa  200  3e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14569  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  39.43 
 
 
305 aa  199  6e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  40.79 
 
 
301 aa  199  7e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  39.25 
 
 
305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  39.56 
 
 
305 aa  196  5.000000000000001e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.81 
 
 
323 aa  195  8.000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  35.02 
 
 
312 aa  194  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.76 
 
 
324 aa  195  1e-48  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  34.16 
 
 
312 aa  194  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  34.7 
 
 
312 aa  194  1e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.42 
 
 
312 aa  194  2e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  34.78 
 
 
312 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  34.78 
 
 
312 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  34.47 
 
 
312 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3064  ABC transporter, ATPase subunit  37.65 
 
 
315 aa  194  2e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  34.78 
 
 
312 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  38.63 
 
 
304 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  34.78 
 
 
312 aa  193  3e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  34.78 
 
 
312 aa  193  3e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  34.47 
 
 
312 aa  193  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  34.8 
 
 
308 aa  193  3e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.03 
 
 
324 aa  193  4e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.67 
 
 
329 aa  192  9e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  38.67 
 
 
310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.46 
 
 
322 aa  190  2.9999999999999997e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0056  ABC transporter related  39.06 
 
 
311 aa  187  3e-46  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1742  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  38.01 
 
 
319 aa  186  5e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0557624  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0428  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.33 
 
 
326 aa  186  6e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160514  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4576  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.58 
 
 
343 aa  186  6e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885138  normal  0.505174 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>