More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_4029 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_4029  nodulation ABC transporter NodI  100 
 
 		 304 aa  614  1e-175  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6187  nodulation factor exporter subunit NodI  81.19 
 
 		 355 aa  506  9.999999999999999e-143  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3829  nodulation ABC transporter NodI  79.93 
 
 		 308 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.889948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5039  nodulation factor exporter subunit NodI  76.64 
 
 		 345 aa  480  1e-134  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4919  nodulation factor exporter subunit NodI  75.66 
 
 		 342 aa  477  1e-133  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7720  nodulation ABC transporter NodI  76.24 
 
 		 304 aa  474  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  70.3 
 
 		 320 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  70.63 
 
 		 304 aa  445  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  69.97 
 
 		 304 aa  441  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  69.97 
 
 		 304 aa  441  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  70.96 
 
 		 304 aa  437  9.999999999999999e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2485  nodulation ABC transporter NodI  69.97 
 
 		 344 aa  440  9.999999999999999e-123  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  69.97 
 
 		 304 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  69.97 
 
 		 326 aa  439  9.999999999999999e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1218  nodulation ABC transporter NodI  69.54 
 
 		 306 aa  434  1e-121  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.513325  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2008  nodulation ABC transporter NodI  69.54 
 
 		 351 aa  434  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  70.63 
 
 		 304 aa  437  1e-121  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0360  nodulation ABC transporter NodI  69.54 
 
 		 351 aa  434  1e-121  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146737  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1840  nodulation ABC transporter NodI  69.54 
 
 		 304 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  69.31 
 
 		 373 aa  433  1e-120  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1855  nodulation ABC transporter NodI  69.54 
 
 		 304 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0801  nodulation ABC transporter NodI  69.54 
 
 		 304 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.485655  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1703  nodulation ABC transporter NodI  69.54 
 
 		 304 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2475  nodulation ABC transporter NodI  71.29 
 
 		 304 aa  418  1e-116  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  62.87 
 
 		 321 aa  391  1e-108  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  63.84 
 
 		 320 aa  393  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  63.19 
 
 		 320 aa  390  1e-107  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2457  nodulation ABC transporter NodI  61 
 
 		 303 aa  382  1e-105  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0229805  normal  0.246765 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2295  nodulation ABC transporter NodI  61.67 
 
 		 325 aa  371  1e-102  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4160  ABC transporter related  55.81 
 
 		 314 aa  337  9.999999999999999e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0633  ABC transporter related  50.65 
 
 		 314 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4964  ABC transporter related  53.74 
 
 		 327 aa  313  2.9999999999999996e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3558  ABC transporter related  51.15 
 
 		 307 aa  310  2e-83  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0440586  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3573  ABC transporter related  49.19 
 
 		 313 aa  308  9e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  54.27 
 
 		 322 aa  307  1.0000000000000001e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1144  ABC transporter related  52.33 
 
 		 312 aa  303  3.0000000000000004e-81  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0277  ABC-2 type transporter ATPase  56.7 
 
 		 301 aa  302  5.000000000000001e-81  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.449682  normal  0.943388 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3711  ABC transporter related  51.79 
 
 		 323 aa  300  1e-80  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1484  nodulation ABC transporter NodI  52.4 
 
 		 309 aa  300  2e-80  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.374303  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4259  ABC transporter-related protein  51.28 
 
 		 315 aa  297  1e-79  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3306  ABC transporter related  49.5 
 
 		 302 aa  290  2e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  47.49 
 
 		 315 aa  288  1e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0240  ABC transporter related  52.3 
 
 		 311 aa  285  7e-76  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0491819  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1092  ABC transporter related  54.17 
 
 		 310 aa  282  4.0000000000000003e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.291374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2837  ABC transporter related  47.39 
 
 		 309 aa  276  3e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.140237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3236  ABC transporter, ATP-binding protein, NodI family  47.39 
 
 		 309 aa  276  3e-73  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  49.5 
 
 		 311 aa  273  3e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  47.02 
 
 		 326 aa  266  2e-70  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  45.48 
 
 		 312 aa  260  3e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  48.37 
 
 		 339 aa  259  3e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  42.86 
 
 		 305 aa  257  1e-67  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1864  ABC transporter related  45.9 
 
 		 303 aa  256  3e-67  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.319064 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  44.86 
 
 		 293 aa  256  3e-67  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2518  ABC transporter related  43.56 
 
 		 310 aa  255  6e-67  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0818783  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1117  ABC transporter related  49.49 
 
 		 317 aa  251  1e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  46.77 
 
 		 328 aa  251  1e-65  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0874  ABC transporter related  45.92 
 
 		 312 aa  251  2e-65  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.468306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3796  ABC transporter related  43.19 
 
 		 323 aa  250  2e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  45.9 
 
 		 306 aa  250  3e-65  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  43.91 
 
 		 310 aa  249  3e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  45.15 
 
 		 311 aa  247  2e-64  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  43.91 
 
 		 310 aa  246  4.9999999999999997e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0667  ABC transporter related  43.67 
 
 		 307 aa  245  6.999999999999999e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.201988 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25200  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.78 
 
 		 317 aa  245  8e-64  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0987  ABC transporter related  44.82 
 
 		 305 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1802  ABC transporter related  44.26 
 
 		 340 aa  241  9e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0389  ABC transporter related  40.73 
 
 		 305 aa  228  1e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  42.86 
 
 		 332 aa  227  2e-58  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4128  ABC transporter related protein  41.33 
 
 		 313 aa  225  9e-58  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.927584  hitchhiker  0.00834769 
 
 
-
 
NC_002936  DET0410  nodulation ATP-binding protein I  41.39 
 
 		 305 aa  218  7e-56  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4649  ABC transporter related protein  41.88 
 
 		 300 aa  216  4e-55  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14569  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_353  ABC-2 type transport system, ATP-binding protein  40.07 
 
 		 305 aa  214  9.999999999999999e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.761814  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  40.72 
 
 		 304 aa  212  5.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0461  ABC-type multidrug transport system ATPase component  41.18 
 
 		 320 aa  211  9e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  40.33 
 
 		 282 aa  208  7e-53  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1526  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40 
 
 		 330 aa  204  2e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00601366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  39.09 
 
 		 310 aa  199  3e-50  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0290  ABC transporter related protein  41.4 
 
 		 341 aa  199  3e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0520  daunorubicin resistance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  37.29 
 
 		 316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0170038  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3064  ABC transporter, ATPase subunit  39.81 
 
 		 315 aa  196  3e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1213  ABC transporter related  40.13 
 
 		 309 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.715047  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0214  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.01 
 
 		 312 aa  195  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4655  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.42 
 
 		 449 aa  194  1e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2802  ABC transporter related  40.27 
 
 		 312 aa  194  2e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.474892  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.66 
 
 		 279 aa  194  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  38.87 
 
 		 301 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1698  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.3 
 
 		 338 aa  193  3e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_461  ABC-type transport system, ATPase component  36.72 
 
 		 316 aa  193  3e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00512826  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  38.74 
 
 		 305 aa  193  3e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.48 
 
 		 308 aa  193  3e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4701  ABC transporter related protein  38.24 
 
 		 311 aa  193  3e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483925  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0617  ABC transporter related  39.67 
 
 		 319 aa  192  4e-48  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.366594 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  39.2 
 
 		 310 aa  192  4e-48  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0496  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.29 
 
 		 316 aa  191  9e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.516721  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0686  ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 		 345 aa  191  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.541745  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  36.57 
 
 		 308 aa  191  1e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.66 
 
 		 339 aa  191  1e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  38.41 
 
 		 301 aa  191  1e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0243  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.01 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0708774  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  39.02 
 
 		 319 aa  191  2e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>