More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0461 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0461  ABC-type multidrug transport system ATPase component  100 
 
 		 320 aa  638    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4649  ABC transporter related protein  61.41 
 
 		 300 aa  343  2e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14569  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  41.08 
 
 		 305 aa  236  6e-61  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  41.14 
 
 		 315 aa  233  3e-60  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0557  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.95 
 
 		 279 aa  223  2e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  42.02 
 
 		 320 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.78 
 
 		 279 aa  221  1.9999999999999999e-56  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  40.07 
 
 		 311 aa  219  6e-56  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  42.35 
 
 		 308 aa  218  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  41.77 
 
 		 326 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  42.38 
 
 		 304 aa  215  8e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  42.57 
 
 		 304 aa  214  9.999999999999999e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0240  ABC transporter related  42.09 
 
 		 311 aa  215  9.999999999999999e-55  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0491819  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1484  nodulation ABC transporter NodI  41.14 
 
 		 309 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.374303  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5039  nodulation factor exporter subunit NodI  40.85 
 
 		 345 aa  213  2.9999999999999995e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  42.05 
 
 		 304 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  42.05 
 
 		 304 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  40.06 
 
 		 321 aa  213  4.9999999999999996e-54  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  41.37 
 
 		 373 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6187  nodulation factor exporter subunit NodI  39.27 
 
 		 355 aa  212  7.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7720  nodulation ABC transporter NodI  40.52 
 
 		 304 aa  211  1e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948879  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  39.53 
 
 		 293 aa  211  1e-53  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  39.74 
 
 		 326 aa  211  2e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  39.68 
 
 		 310 aa  210  3e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  40.19 
 
 		 332 aa  209  4e-53  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  40.13 
 
 		 306 aa  209  5e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1213  ABC transporter related  40.18 
 
 		 309 aa  209  5e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.715047  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  40.07 
 
 		 308 aa  208  1e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  40.19 
 
 		 328 aa  208  1e-52  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  39.22 
 
 		 320 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  39.06 
 
 		 322 aa  207  2e-52  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4029  nodulation ABC transporter NodI  39.87 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  42.17 
 
 		 266 aa  207  2e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  39.22 
 
 		 320 aa  207  2e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4919  nodulation factor exporter subunit NodI  40.45 
 
 		 342 aa  207  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4576  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.29 
 
 		 343 aa  207  2e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885138  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3796  ABC transporter related  38.11 
 
 		 323 aa  206  3e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2457  nodulation ABC transporter NodI  40.88 
 
 		 303 aa  207  3e-52  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0229805  normal  0.246765 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0667  ABC transporter related  37.87 
 
 		 307 aa  206  3e-52  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.201988 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0553  ABC transporter related  40.88 
 
 		 279 aa  206  4e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  39.87 
 
 		 311 aa  206  5e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  40.46 
 
 		 304 aa  205  7e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  38.19 
 
 		 339 aa  205  8e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.02 
 
 		 308 aa  204  1e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0874  ABC transporter related  39.53 
 
 		 312 aa  204  2e-51  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.468306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4128  ABC transporter related protein  41.64 
 
 		 313 aa  204  2e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.927584  hitchhiker  0.00834769 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1802  ABC transporter related  39.64 
 
 		 340 aa  203  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  39.47 
 
 		 304 aa  202  4e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2485  nodulation ABC transporter NodI  40 
 
 		 344 aa  202  7e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  39.37 
 
 		 310 aa  202  7e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2518  ABC transporter related  36.42 
 
 		 310 aa  202  8e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0818783  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  37.13 
 
 		 327 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1827  ABC transporter related  37.71 
 
 		 279 aa  200  1.9999999999999998e-50  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.215935  normal  0.111086 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1218  nodulation ABC transporter NodI  40.6 
 
 		 306 aa  199  3.9999999999999996e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.513325  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3829  nodulation ABC transporter NodI  40.2 
 
 		 308 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.889948  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0801  nodulation ABC transporter NodI  40.6 
 
 		 304 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.485655  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1703  nodulation ABC transporter NodI  40.6 
 
 		 304 aa  199  5e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1855  nodulation ABC transporter NodI  40.6 
 
 		 304 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1840  nodulation ABC transporter NodI  40.6 
 
 		 304 aa  199  5e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2008  nodulation ABC transporter NodI  40.6 
 
 		 351 aa  199  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0360  nodulation ABC transporter NodI  40.6 
 
 		 351 aa  199  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146737  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0987  ABC transporter related  37.63 
 
 		 305 aa  198  7.999999999999999e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37 
 
 		 339 aa  198  9e-50  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  39.26 
 
 		 282 aa  198  1.0000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  35.69 
 
 		 328 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1092  ABC transporter related  42.28 
 
 		 310 aa  198  1.0000000000000001e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.291374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.86 
 
 		 328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  37.69 
 
 		 312 aa  196  3e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2295  nodulation ABC transporter NodI  41.22 
 
 		 325 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25200  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.22 
 
 		 317 aa  196  5.000000000000001e-49  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.36 
 
 		 329 aa  195  9e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2408  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.74 
 
 		 325 aa  195  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000647943  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  36.63 
 
 		 310 aa  195  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1864  ABC transporter related  37.5 
 
 		 303 aa  194  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.319064 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06358  ABC transporter component  38.69 
 
 		 308 aa  193  3e-48  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0277  ABC-2 type transporter ATPase  40.73 
 
 		 301 aa  193  4e-48  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.449682  normal  0.943388 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2158  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.26 
 
 		 325 aa  193  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1351  ABC transporter related  38.24 
 
 		 320 aa  192  5e-48  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.000123717  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.74 
 
 		 328 aa  192  6e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24930  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  39.74 
 
 		 325 aa  192  7e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.961926  normal  0.37663 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3306  ABC transporter related  37.2 
 
 		 302 aa  192  7e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1926  ABC transporter related  37.35 
 
 		 326 aa  192  9e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0936  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.06 
 
 		 332 aa  191  1e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2475  nodulation ABC transporter NodI  40.46 
 
 		 304 aa  191  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4032  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.06 
 
 		 338 aa  191  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.631221  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4160  ABC transporter related  38.67 
 
 		 314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0389  ABC transporter related  38.26 
 
 		 305 aa  190  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4151  ABC transporter-like  39.41 
 
 		 275 aa  189  4e-47  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000107642  normal  0.126355 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  38.32 
 
 		 301 aa  189  5e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3558  ABC transporter related  37.33 
 
 		 307 aa  189  5e-47  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0440586  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  42.04 
 
 		 330 aa  189  5.999999999999999e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3236  ABC transporter, ATP-binding protein, NodI family  38.89 
 
 		 309 aa  189  7e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2837  ABC transporter related  38.89 
 
 		 309 aa  189  7e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.140237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  39.71 
 
 		 350 aa  188  1e-46  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.44 
 
 		 308 aa  187  2e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.516397  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0973  ABC transporter related  37.74 
 
 		 319 aa  187  2e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  37.58 
 
 		 320 aa  186  4e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0919  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.07 
 
 		 342 aa  186  4e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2057  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.7 
 
 		 308 aa  186  4e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  46.12 
 
 		 325 aa  186  4e-46  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>