More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_3829 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_3829  nodulation ABC transporter NodI  100 
 
 		 308 aa  624  1e-178  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.889948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4029  nodulation ABC transporter NodI  79.93 
 
 		 304 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6187  nodulation factor exporter subunit NodI  70.96 
 
 		 355 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4919  nodulation factor exporter subunit NodI  72.82 
 
 		 342 aa  446  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5039  nodulation factor exporter subunit NodI  71.05 
 
 		 345 aa  443  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7720  nodulation ABC transporter NodI  67.33 
 
 		 304 aa  424  1e-117  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2485  nodulation ABC transporter NodI  64.03 
 
 		 344 aa  413  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1218  nodulation ABC transporter NodI  63.91 
 
 		 306 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.513325  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0801  nodulation ABC transporter NodI  63.91 
 
 		 304 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.485655  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2008  nodulation ABC transporter NodI  63.91 
 
 		 351 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  63.04 
 
 		 320 aa  410  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  64.69 
 
 		 304 aa  410  1e-113  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  63.37 
 
 		 304 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  63.7 
 
 		 304 aa  410  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  63.04 
 
 		 373 aa  408  1e-113  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  63.37 
 
 		 326 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1840  nodulation ABC transporter NodI  63.91 
 
 		 304 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1703  nodulation ABC transporter NodI  63.91 
 
 		 304 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1855  nodulation ABC transporter NodI  63.91 
 
 		 304 aa  409  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0360  nodulation ABC transporter NodI  63.91 
 
 		 351 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146737  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  65.02 
 
 		 304 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  63.04 
 
 		 304 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  63.04 
 
 		 304 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2475  nodulation ABC transporter NodI  65.02 
 
 		 304 aa  391  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  61.72 
 
 		 320 aa  381  1e-105  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  62.05 
 
 		 320 aa  382  1e-105  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  61.72 
 
 		 321 aa  380  1e-104  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2457  nodulation ABC transporter NodI  60.47 
 
 		 303 aa  370  1e-101  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0229805  normal  0.246765 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2295  nodulation ABC transporter NodI  59.8 
 
 		 325 aa  357  9.999999999999999e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4160  ABC transporter related  55.45 
 
 		 314 aa  339  4e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4964  ABC transporter related  53.72 
 
 		 327 aa  315  6e-85  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3558  ABC transporter related  51.16 
 
 		 307 aa  311  9e-84  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0440586  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3573  ABC transporter related  51.17 
 
 		 313 aa  309  2.9999999999999997e-83  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3711  ABC transporter related  53.33 
 
 		 323 aa  307  1.0000000000000001e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1144  ABC transporter related  51.94 
 
 		 312 aa  308  1.0000000000000001e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  52.17 
 
 		 322 aa  305  5.0000000000000004e-82  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0633  ABC transporter related  49.5 
 
 		 314 aa  304  9.000000000000001e-82  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0277  ABC-2 type transporter ATPase  54.7 
 
 		 301 aa  301  1e-80  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.449682  normal  0.943388 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4259  ABC transporter-related protein  52.82 
 
 		 315 aa  294  2e-78  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3306  ABC transporter related  51.03 
 
 		 302 aa  290  2e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  46.26 
 
 		 315 aa  286  2.9999999999999996e-76  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1092  ABC transporter related  51.67 
 
 		 310 aa  281  8.000000000000001e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.291374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0240  ABC transporter related  51.51 
 
 		 311 aa  281  1e-74  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0491819  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1484  nodulation ABC transporter NodI  49.66 
 
 		 309 aa  278  6e-74  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.374303  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  49.17 
 
 		 311 aa  271  1e-71  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  46.58 
 
 		 293 aa  262  6e-69  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  43.97 
 
 		 305 aa  262  6e-69  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2837  ABC transporter related  46.49 
 
 		 309 aa  260  3e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.140237  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  46.86 
 
 		 326 aa  259  3e-68  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3236  ABC transporter, ATP-binding protein, NodI family  46.49 
 
 		 309 aa  260  3e-68  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2518  ABC transporter related  44 
 
 		 310 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0818783  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1864  ABC transporter related  46.36 
 
 		 303 aa  252  7e-66  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.319064 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  45.72 
 
 		 339 aa  249  3e-65  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  44.05 
 
 		 310 aa  249  6e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0874  ABC transporter related  43.09 
 
 		 312 aa  246  4e-64  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.468306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  43.73 
 
 		 310 aa  244  9.999999999999999e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  43.09 
 
 		 312 aa  244  1.9999999999999999e-63  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3796  ABC transporter related  43 
 
 		 323 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1117  ABC transporter related  47.65 
 
 		 317 aa  240  2e-62  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  45.03 
 
 		 332 aa  239  5e-62  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0987  ABC transporter related  43.14 
 
 		 305 aa  238  6.999999999999999e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  43.31 
 
 		 328 aa  237  2e-61  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25200  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.79 
 
 		 317 aa  234  1.0000000000000001e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  42.58 
 
 		 311 aa  231  8.000000000000001e-60  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  43.93 
 
 		 306 aa  231  1e-59  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0667  ABC transporter related  41.61 
 
 		 307 aa  229  5e-59  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.201988 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1802  ABC transporter related  41.95 
 
 		 340 aa  226  4e-58  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4128  ABC transporter related protein  39.53 
 
 		 313 aa  220  3e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.927584  hitchhiker  0.00834769 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4649  ABC transporter related protein  43.42 
 
 		 300 aa  219  5e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14569  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0389  ABC transporter related  38.87 
 
 		 305 aa  208  1e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  40.52 
 
 		 304 aa  208  1e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1526  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.72 
 
 		 330 aa  205  8e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00601366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  39.47 
 
 		 282 aa  205  9e-52  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4701  ABC transporter related protein  40.78 
 
 		 311 aa  205  9e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483925  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0392  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.66 
 
 		 347 aa  204  1e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0461  ABC-type multidrug transport system ATPase component  41.2 
 
 		 320 aa  204  2e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  38.78 
 
 		 310 aa  204  2e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0410  nodulation ATP-binding protein I  40.07 
 
 		 305 aa  202  4e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3064  ABC transporter, ATPase subunit  40.63 
 
 		 315 aa  202  4e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_353  ABC-2 type transport system, ATP-binding protein  38.87 
 
 		 305 aa  199  3.9999999999999996e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.761814  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0520  daunorubicin resistance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.03 
 
 		 316 aa  198  7.999999999999999e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0170038  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.25 
 
 		 324 aa  198  9e-50  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  38.44 
 
 		 310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4655  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.38 
 
 		 449 aa  196  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  40.27 
 
 		 305 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1698  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.3 
 
 		 338 aa  196  6e-49  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1352  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.14 
 
 		 331 aa  196  6e-49  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.467202  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  38.67 
 
 		 301 aa  194  1e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  39.06 
 
 		 300 aa  194  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_461  ABC-type transport system, ATPase component  37.79 
 
 		 316 aa  194  2e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00512826  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.51 
 
 		 328 aa  194  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  39.93 
 
 		 301 aa  194  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.8 
 
 		 279 aa  194  2e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0043  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.53 
 
 		 337 aa  194  2e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0056  ABC transporter related  37.25 
 
 		 311 aa  193  3e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.576476 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1742  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  40.76 
 
 		 319 aa  192  5e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0557624  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.26 
 
 		 322 aa  192  5e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2623  ABC transporter related  38.2 
 
 		 321 aa  192  6e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2020  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  41.1 
 
 		 359 aa  192  6e-48  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.197661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0496  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.02 
 
 		 316 aa  192  8e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.516721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>