More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hhal_0240 on replicon NC_008789
Organism: Halorhodospira halophila SL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008789  Hhal_0240  ABC transporter related  100 
 
 		 311 aa  626  1e-178  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0491819  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  64.74 
 
 		 322 aa  400  9.999999999999999e-111  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1092  ABC transporter related  63.79 
 
 		 310 aa  351  8e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.291374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  57.81 
 
 		 311 aa  338  5e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  55.31 
 
 		 315 aa  335  7.999999999999999e-91  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  57.14 
 
 		 304 aa  333  3e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  57.14 
 
 		 320 aa  332  4e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  56.27 
 
 		 320 aa  332  4e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  57.14 
 
 		 304 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  57.14 
 
 		 304 aa  332  6e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  56.8 
 
 		 304 aa  330  1e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  56.8 
 
 		 326 aa  330  1e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  56.27 
 
 		 320 aa  330  2e-89  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0360  nodulation ABC transporter NodI  57.04 
 
 		 351 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146737  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2008  nodulation ABC transporter NodI  57.04 
 
 		 351 aa  328  5.0000000000000004e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  56.66 
 
 		 304 aa  328  6e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  55.31 
 
 		 321 aa  328  8e-89  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1855  nodulation ABC transporter NodI  57.04 
 
 		 304 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1218  nodulation ABC transporter NodI  57.04 
 
 		 306 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.513325  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1703  nodulation ABC transporter NodI  57.04 
 
 		 304 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2485  nodulation ABC transporter NodI  56.66 
 
 		 344 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1840  nodulation ABC transporter NodI  57.04 
 
 		 304 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0801  nodulation ABC transporter NodI  57.04 
 
 		 304 aa  328  1.0000000000000001e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.485655  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  56.66 
 
 		 304 aa  327  1.0000000000000001e-88  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  55.97 
 
 		 373 aa  326  3e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0277  ABC-2 type transporter ATPase  58.67 
 
 		 301 aa  325  4.0000000000000003e-88  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.449682  normal  0.943388 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2457  nodulation ABC transporter NodI  55.29 
 
 		 303 aa  312  5.999999999999999e-84  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0229805  normal  0.246765 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1484  nodulation ABC transporter NodI  53.31 
 
 		 309 aa  311  1e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.374303  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4160  ABC transporter related  54.28 
 
 		 314 aa  310  2.9999999999999997e-83  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7720  nodulation ABC transporter NodI  52.96 
 
 		 304 aa  309  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948879  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4964  ABC transporter related  53.14 
 
 		 327 aa  306  3e-82  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2475  nodulation ABC transporter NodI  56.31 
 
 		 304 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5039  nodulation factor exporter subunit NodI  52.16 
 
 		 345 aa  301  1e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2837  ABC transporter related  52.96 
 
 		 309 aa  300  2e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.140237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3236  ABC transporter, ATP-binding protein, NodI family  52.96 
 
 		 309 aa  300  2e-80  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  52.43 
 
 		 310 aa  300  2e-80  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  52.43 
 
 		 310 aa  299  3e-80  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3306  ABC transporter related  52.49 
 
 		 302 aa  299  4e-80  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2295  nodulation ABC transporter NodI  56.31 
 
 		 325 aa  299  5e-80  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6187  nodulation factor exporter subunit NodI  52.65 
 
 		 355 aa  295  5e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4919  nodulation factor exporter subunit NodI  51.84 
 
 		 342 aa  293  2e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4029  nodulation ABC transporter NodI  52.3 
 
 		 304 aa  292  6e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3829  nodulation ABC transporter NodI  51.83 
 
 		 308 aa  287  2e-76  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.889948  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  51.77 
 
 		 311 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3573  ABC transporter related  48.05 
 
 		 313 aa  286  2.9999999999999996e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0874  ABC transporter related  52.29 
 
 		 312 aa  284  1.0000000000000001e-75  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.468306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0633  ABC transporter related  47.57 
 
 		 314 aa  283  3.0000000000000004e-75  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3711  ABC transporter related  50.63 
 
 		 323 aa  282  5.000000000000001e-75  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2518  ABC transporter related  47.45 
 
 		 310 aa  281  1e-74  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0818783  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3558  ABC transporter related  50.51 
 
 		 307 aa  281  1e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0440586  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1144  ABC transporter related  49.01 
 
 		 312 aa  279  5e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  49.01 
 
 		 326 aa  278  6e-74  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  47.71 
 
 		 305 aa  277  2e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  49.49 
 
 		 293 aa  277  2e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  48.87 
 
 		 312 aa  276  3e-73  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  50 
 
 		 339 aa  276  3e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  50.16 
 
 		 328 aa  273  2.0000000000000002e-72  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4259  ABC transporter-related protein  52.26 
 
 		 315 aa  273  3e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1802  ABC transporter related  46.44 
 
 		 340 aa  272  7e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  50.49 
 
 		 306 aa  268  7e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25200  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  50.5 
 
 		 317 aa  264  2e-69  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  48.71 
 
 		 332 aa  262  6e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3796  ABC transporter related  43.4 
 
 		 323 aa  262  6.999999999999999e-69  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0667  ABC transporter related  44.41 
 
 		 307 aa  257  2e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.201988 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4128  ABC transporter related protein  46.23 
 
 		 313 aa  254  1.0000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.927584  hitchhiker  0.00834769 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0987  ABC transporter related  46.05 
 
 		 305 aa  248  7e-65  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1864  ABC transporter related  46.53 
 
 		 303 aa  248  1e-64  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.319064 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1117  ABC transporter related  50.17 
 
 		 317 aa  243  1.9999999999999999e-63  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0389  ABC transporter related  41.39 
 
 		 305 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0410  nodulation ATP-binding protein I  42.62 
 
 		 305 aa  231  1e-59  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  44.34 
 
 		 319 aa  228  7e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  41.04 
 
 		 304 aa  228  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_353  ABC-2 type transport system, ATP-binding protein  41.83 
 
 		 305 aa  227  2e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.761814  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3064  ABC transporter, ATPase subunit  45.78 
 
 		 315 aa  227  2e-58  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.745541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0461  ABC-type multidrug transport system ATPase component  42.09 
 
 		 320 aa  222  6e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  43.46 
 
 		 301 aa  222  6e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  45.45 
 
 		 300 aa  220  1.9999999999999999e-56  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4649  ABC transporter related protein  42.35 
 
 		 300 aa  218  7e-56  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14569  normal  0.426386 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1213  ABC transporter related  42.96 
 
 		 309 aa  214  1.9999999999999998e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.715047  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  42.72 
 
 		 308 aa  213  2.9999999999999995e-54  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  41.75 
 
 		 310 aa  212  5.999999999999999e-54  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  42.43 
 
 		 308 aa  208  8e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  36.18 
 
 		 310 aa  207  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4576  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.96 
 
 		 343 aa  207  1e-52  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885138  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.26 
 
 		 308 aa  207  2e-52  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.516397  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0260  ABC transporter related protein  42.9 
 
 		 329 aa  207  2e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.723146  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.13 
 
 		 308 aa  206  4e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  39.68 
 
 		 305 aa  206  5e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  39.35 
 
 		 305 aa  204  1e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.83 
 
 		 334 aa  205  1e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  39.66 
 
 		 282 aa  204  1e-51  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0290  ABC transporter related protein  39.06 
 
 		 341 aa  204  1e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  39.1 
 
 		 310 aa  204  1e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.48 
 
 		 321 aa  204  2e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1776  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.63 
 
 		 319 aa  204  2e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179608 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.5 
 
 		 322 aa  203  3e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  38.59 
 
 		 305 aa  203  3e-51  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  36.65 
 
 		 328 aa  202  5e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  34.91 
 
 		 327 aa  202  6e-51  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0894  ABC transporter related  47.75 
 
 		 298 aa  202  6e-51  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.230749  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>