More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_0260 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_0260  ABC transporter related protein  100 
 
 		 329 aa  636    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.723146  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  47 
 
 		 308 aa  249  6e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1213  ABC transporter related  47.02 
 
 		 309 aa  246  3e-64  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.715047  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  47.02 
 
 		 308 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  46.37 
 
 		 308 aa  244  9.999999999999999e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  46.37 
 
 		 308 aa  243  3e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5171  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  48.56 
 
 		 329 aa  243  3.9999999999999997e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  47.02 
 
 		 308 aa  243  5e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.516397  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.14 
 
 		 328 aa  239  5e-62  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2408  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.34 
 
 		 325 aa  238  2e-61  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000647943  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3573  ABC transporter, ATP-binding protein  42.95 
 
 		 330 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.366392  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.07 
 
 		 328 aa  233  4.0000000000000004e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4576  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.51 
 
 		 343 aa  231  1e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885138  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.63 
 
 		 325 aa  229  4e-59  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1126  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.17 
 
 		 326 aa  229  5e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1381  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.19 
 
 		 327 aa  227  2e-58  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000774362  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.74 
 
 		 324 aa  226  3e-58  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  40.88 
 
 		 328 aa  226  4e-58  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.25 
 
 		 339 aa  225  6e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.13 
 
 		 279 aa  225  8e-58  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.88 
 
 		 327 aa  225  8e-58  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.41 
 
 		 329 aa  225  1e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0475  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.95 
 
 		 333 aa  224  1e-57  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0408472 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.42 
 
 		 324 aa  224  2e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2057  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.13 
 
 		 308 aa  224  2e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0061  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.51 
 
 		 338 aa  222  6e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00188149  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  38.99 
 
 		 330 aa  222  7e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1257  ABC transporter related  39.5 
 
 		 330 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0560  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.98 
 
 		 324 aa  221  9.999999999999999e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  39.31 
 
 		 327 aa  220  3e-56  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  42.81 
 
 		 310 aa  220  3e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1508  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.36 
 
 		 323 aa  219  7e-56  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  43.44 
 
 		 311 aa  218  8.999999999999998e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1594  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.32 
 
 		 323 aa  218  1e-55  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.658594  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2486  ATP-binding protein  37.58 
 
 		 318 aa  217  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  41.9 
 
 		 326 aa  218  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  43.61 
 
 		 312 aa  216  2.9999999999999998e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2158  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.86 
 
 		 325 aa  216  5e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.76 
 
 		 334 aa  215  5.9999999999999996e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.89 
 
 		 324 aa  214  9.999999999999999e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0010745  normal  0.559357 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  41.88 
 
 		 310 aa  213  2.9999999999999995e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.3 
 
 		 323 aa  213  3.9999999999999995e-54  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0967  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.71 
 
 		 348 aa  213  4.9999999999999996e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0428  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39 
 
 		 326 aa  213  4.9999999999999996e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.160514  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.36 
 
 		 318 aa  211  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0194342 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.61 
 
 		 322 aa  209  7e-53  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  42.95 
 
 		 301 aa  209  8e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0379  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.61 
 
 		 321 aa  208  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3735  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.43 
 
 		 446 aa  208  1e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.76 
 
 		 309 aa  208  1e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1802  ABC transporter related  39.82 
 
 		 340 aa  207  1e-52  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0907  ABC transporter related  44.84 
 
 		 260 aa  207  2e-52  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000299465 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  41.51 
 
 		 311 aa  207  3e-52  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1891  ABC transporter related  37.19 
 
 		 320 aa  206  3e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572686  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0520  daunorubicin resistance ABC transporter, ATP-binding protein, putative  38.87 
 
 		 316 aa  206  4e-52  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0170038  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.31 
 
 		 317 aa  206  4e-52  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4032  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.3 
 
 		 338 aa  206  4e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.631221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3548  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.26 
 
 		 335 aa  206  5e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.381902 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0529  ABC transporter related  40.37 
 
 		 307 aa  206  5e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0717858  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  37.26 
 
 		 310 aa  206  6e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0557  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.85 
 
 		 279 aa  205  7e-52  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2297  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  41.64 
 
 		 325 aa  205  9e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.422878  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  42.37 
 
 		 319 aa  205  9e-52  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0243  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.62 
 
 		 316 aa  205  9e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0708774  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  41.96 
 
 		 306 aa  204  1e-51  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  41.8 
 
 		 339 aa  204  1e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0632  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.68 
 
 		 318 aa  205  1e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.51 
 
 		 321 aa  204  1e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0191  ABC transporter-like  39.5 
 
 		 339 aa  204  2e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0494849 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6125  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.34 
 
 		 403 aa  204  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.555099  normal  0.897652 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1864  ABC transporter related  40.51 
 
 		 303 aa  203  3e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.319064 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7720  nodulation ABC transporter NodI  40.99 
 
 		 304 aa  203  3e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  36.62 
 
 		 312 aa  203  3e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  41.48 
 
 		 293 aa  203  4e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  43.67 
 
 		 322 aa  203  4e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25200  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.15 
 
 		 317 aa  202  5e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0410  nodulation ATP-binding protein I  41.01 
 
 		 305 aa  202  6e-51  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_461  ABC-type transport system, ATPase component  38.56 
 
 		 316 aa  202  9e-51  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00512826  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2865  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.14 
 
 		 333 aa  201  9.999999999999999e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0686  ABC transporter, ATP-binding protein  36.28 
 
 		 345 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.541745  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0418  ABC transporter-like  37.73 
 
 		 300 aa  201  9.999999999999999e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.307879  normal  0.0288734 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.18 
 
 		 312 aa  201  9.999999999999999e-51  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4093  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.95 
 
 		 312 aa  201  9.999999999999999e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132087  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.74 
 
 		 305 aa  201  9.999999999999999e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  41.54 
 
 		 332 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2108  ABC transporter related  40.74 
 
 		 325 aa  200  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.947862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0240  ABC transporter related  42.46 
 
 		 311 aa  200  1.9999999999999998e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0491819  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  41.37 
 
 		 322 aa  199  5e-50  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1117  ABC transporter related  42.81 
 
 		 317 aa  199  5e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2587  ABC transporter related  40 
 
 		 339 aa  199  6e-50  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  45.07 
 
 		 266 aa  199  6e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3519  ABC transporter related  40 
 
 		 339 aa  199  6e-50  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3246  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.8 
 
 		 321 aa  199  7e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0614  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.79 
 
 		 374 aa  199  7.999999999999999e-50  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.668059 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  40.49 
 
 		 321 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0389  ABC transporter related  38.92 
 
 		 305 aa  197  1.0000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1767  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  42.68 
 
 		 255 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  42.04 
 
 		 328 aa  198  1.0000000000000001e-49  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.59 
 
 		 316 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  36.67 
 
 		 305 aa  197  1.0000000000000001e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>