More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_25200 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_25200  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  100 
 
 		 317 aa  637    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  77.96 
 
 		 326 aa  494  1e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  75.16 
 
 		 339 aa  487  1e-137  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  66.56 
 
 		 328 aa  424  1e-118  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  69.06 
 
 		 306 aa  420  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  64.4 
 
 		 310 aa  402  1e-111  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  60.69 
 
 		 332 aa  404  1e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  62.46 
 
 		 310 aa  398  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1802  ABC transporter related  61.14 
 
 		 340 aa  393  1e-108  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.398486 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  60.45 
 
 		 312 aa  390  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  61.94 
 
 		 311 aa  385  1e-106  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1117  ABC transporter related  53.31 
 
 		 317 aa  303  2.0000000000000002e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  47.37 
 
 		 305 aa  294  1e-78  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0874  ABC transporter related  49.34 
 
 		 312 aa  293  3e-78  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.468306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2121  ABC transporter related protein  49.19 
 
 		 315 aa  291  1e-77  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  49.66 
 
 		 293 aa  289  5.0000000000000004e-77  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1864  ABC transporter related  48.01 
 
 		 303 aa  288  1e-76  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.319064 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3796  ABC transporter related  45.28 
 
 		 323 aa  279  4e-74  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0633  ABC transporter related  46.47 
 
 		 314 aa  277  1e-73  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1484  nodulation ABC transporter NodI  48.54 
 
 		 309 aa  277  2e-73  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.374303  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  47.34 
 
 		 321 aa  276  2e-73  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3306  ABC transporter related  48.37 
 
 		 302 aa  275  6e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4964  ABC transporter related  47.04 
 
 		 327 aa  275  8e-73  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4128  ABC transporter related protein  49.04 
 
 		 313 aa  273  2.0000000000000002e-72  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.927584  hitchhiker  0.00834769 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3558  ABC transporter related  47.87 
 
 		 307 aa  273  3e-72  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0440586  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1768  nodulation ABC transporter NodI  48.99 
 
 		 304 aa  271  1e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.733108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2518  ABC transporter related  45.02 
 
 		 310 aa  270  2e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0818783  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2457  nodulation ABC transporter NodI  46.38 
 
 		 303 aa  270  2e-71  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0229805  normal  0.246765 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0240  ABC transporter related  50.16 
 
 		 311 aa  270  2.9999999999999997e-71  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0491819  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1144  ABC transporter related  46.96 
 
 		 312 aa  270  2.9999999999999997e-71  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0360  nodulation ABC transporter NodI  46.73 
 
 		 351 aa  269  4e-71  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.146737  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2008  nodulation ABC transporter NodI  46.73 
 
 		 351 aa  269  4e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2485  nodulation ABC transporter NodI  47.04 
 
 		 344 aa  269  4e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1218  nodulation ABC transporter NodI  48.22 
 
 		 306 aa  268  7e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.513325  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1840  nodulation ABC transporter NodI  48.22 
 
 		 304 aa  268  8e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0801  nodulation ABC transporter NodI  48.22 
 
 		 304 aa  268  8e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.485655  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0667  ABC transporter related  45.31 
 
 		 307 aa  268  8e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.201988 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1703  nodulation ABC transporter NodI  48.22 
 
 		 304 aa  268  8e-71  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1855  nodulation ABC transporter NodI  48.22 
 
 		 304 aa  268  1e-70  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4160  ABC transporter related  48.12 
 
 		 314 aa  267  2e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1634  nodulation ABC transporter NodI  47.73 
 
 		 304 aa  267  2e-70  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.770331  normal  0.764361 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3573  ABC transporter related  45.66 
 
 		 313 aa  267  2e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1573  nodulation ABC transporter NodI  47.57 
 
 		 304 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4734  nodulation ABC transporter NodI  46.08 
 
 		 320 aa  266  4e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00531442  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1116  nodulation ABC transporter NodI  47.57 
 
 		 304 aa  265  8e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1596  nodulation ABC transporter NodI  47.57 
 
 		 304 aa  265  8e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.993965  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0277  ABC-2 type transporter ATPase  47.37 
 
 		 301 aa  265  1e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.449682  normal  0.943388 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  45.51 
 
 		 320 aa  264  1e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1641  nodulation ABC transporter NodI  47.27 
 
 		 373 aa  263  2e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0987  ABC transporter related  45.37 
 
 		 305 aa  262  4e-69  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.174355 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3711  ABC transporter related  45.91 
 
 		 323 aa  261  8.999999999999999e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2475  nodulation ABC transporter NodI  49.33 
 
 		 304 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.907427  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  45.66 
 
 		 320 aa  259  3e-68  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1512  nodulation ABC transporter NodI  46.43 
 
 		 304 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0976577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1492  nodulation ABC transporter NodI  46.43 
 
 		 326 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4919  nodulation factor exporter subunit NodI  47.21 
 
 		 342 aa  258  8e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  45.34 
 
 		 311 aa  258  1e-67  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5039  nodulation factor exporter subunit NodI  45.93 
 
 		 345 aa  257  2e-67  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6187  nodulation factor exporter subunit NodI  46.62 
 
 		 355 aa  256  4e-67  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7720  nodulation ABC transporter NodI  46.75 
 
 		 304 aa  256  5e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948879  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1937  ABC transporter related  45.91 
 
 		 322 aa  254  1.0000000000000001e-66  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2837  ABC transporter related  48.51 
 
 		 309 aa  252  5.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.140237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3236  ABC transporter, ATP-binding protein, NodI family  48.51 
 
 		 309 aa  252  5.000000000000001e-66  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4029  nodulation ABC transporter NodI  46.6 
 
 		 304 aa  250  2e-65  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2295  nodulation ABC transporter NodI  44.05 
 
 		 325 aa  244  9.999999999999999e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4259  ABC transporter-related protein  44.62 
 
 		 315 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.493495  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2057  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.38 
 
 		 308 aa  239  2.9999999999999997e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.690355  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1092  ABC transporter related  46.2 
 
 		 310 aa  239  4e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.291374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3829  nodulation ABC transporter NodI  43.52 
 
 		 308 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.889948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1594  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.83 
 
 		 323 aa  227  2e-58  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.658594  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.17 
 
 		 334 aa  226  5.0000000000000005e-58  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1381  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.01 
 
 		 327 aa  224  2e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000774362  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4576  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.56 
 
 		 343 aa  223  3e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0885138  normal  0.505174 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  41.69 
 
 		 308 aa  222  6e-57  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  42.49 
 
 		 328 aa  222  6e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  41.27 
 
 		 327 aa  222  6e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.01 
 
 		 327 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.67 
 
 		 339 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  42.62 
 
 		 308 aa  219  5e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.39 
 
 		 324 aa  219  6e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0010745  normal  0.559357 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  39.35 
 
 		 310 aa  219  6e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.44 
 
 		 324 aa  218  8.999999999999998e-56  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40 
 
 		 308 aa  218  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1776  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.27 
 
 		 319 aa  216  2.9999999999999998e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179608 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1122  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.14 
 
 		 320 aa  216  2.9999999999999998e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.69 
 
 		 308 aa  216  2.9999999999999998e-55  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.516397  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43 
 
 		 279 aa  216  4e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5171  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.25 
 
 		 329 aa  216  5e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4701  ABC transporter related protein  40.38 
 
 		 311 aa  216  5e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.483925  normal  0.440975 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2158  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.65 
 
 		 325 aa  214  9.999999999999999e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.22 
 
 		 329 aa  213  2.9999999999999995e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3883  ABC transporter related  39.31 
 
 		 321 aa  213  2.9999999999999995e-54  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.837023  normal  0.151879 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.85 
 
 		 328 aa  212  7e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  40.97 
 
 		 310 aa  212  7e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.18 
 
 		 322 aa  212  7e-54  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0012  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.54 
 
 		 308 aa  211  1e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.46 
 
 		 324 aa  211  1e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  37.83 
 
 		 283 aa  211  1e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2865  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.19 
 
 		 333 aa  211  2e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0260  ABC transporter related protein  42.5 
 
 		 329 aa  210  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.723146  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>