More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0510 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  100 
 
 		 276 aa  533  1e-150  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  64.62 
 
 		 280 aa  344  8.999999999999999e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7343  ABC transporter related  64.62 
 
 		 284 aa  332  5e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991324 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  63.5 
 
 		 290 aa  328  6e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  64.23 
 
 		 282 aa  327  1.0000000000000001e-88  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  65.58 
 
 		 284 aa  325  4.0000000000000003e-88  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  64.39 
 
 		 301 aa  321  7e-87  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  64.73 
 
 		 301 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  61.82 
 
 		 301 aa  314  9.999999999999999e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0672  ABC transporter related  60.22 
 
 		 289 aa  292  4e-78  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29910  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  60 
 
 		 313 aa  281  9e-75  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.880888  normal  0.697642 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3171  ABC transporter related  61.09 
 
 		 294 aa  280  2e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0428846 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2680  ABC transporter related protein  59.21 
 
 		 297 aa  276  4e-73  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  53.05 
 
 		 285 aa  275  5e-73  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7156  ABC transporter related protein  53.6 
 
 		 281 aa  275  8e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.023596 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  56.36 
 
 		 317 aa  264  1e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33070  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  49.27 
 
 		 286 aa  234  1.0000000000000001e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.468184  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0144  ABC transporter related protein  50.18 
 
 		 300 aa  234  1.0000000000000001e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  41.22 
 
 		 283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4302  ABC transporter related protein  47.16 
 
 		 312 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3144  ABC transporter related  47.46 
 
 		 304 aa  227  2e-58  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000906796  normal  0.0406724 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3162  ABC transporter related  48.59 
 
 		 324 aa  223  2e-57  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0228051 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3387  ABC transporter related  47.16 
 
 		 324 aa  222  6e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.0912472 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  48.53 
 
 		 314 aa  216  5e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  46.46 
 
 		 331 aa  207  1e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1585  ABC transporter related  51.06 
 
 		 321 aa  206  2e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.719287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  42.92 
 
 		 254 aa  203  2e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  42.37 
 
 		 301 aa  202  4e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  38.64 
 
 		 304 aa  202  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  40.88 
 
 		 310 aa  202  4e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3531  ABC transporter related protein  42.76 
 
 		 319 aa  201  9.999999999999999e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  51.69 
 
 		 322 aa  200  1.9999999999999998e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  39.27 
 
 		 305 aa  200  3e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0291  ABC-type multidrug transport system ATPase component  50 
 
 		 324 aa  199  5e-50  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  38.91 
 
 		 301 aa  197  1.0000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  49.05 
 
 		 322 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1677  ABC transporter, ATPase subunit  48.09 
 
 		 353 aa  197  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1188  ABC transporter related protein  52.07 
 
 		 262 aa  196  4.0000000000000005e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000880668 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  36.15 
 
 		 300 aa  195  5.000000000000001e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  46.72 
 
 		 306 aa  195  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  49.06 
 
 		 303 aa  194  9e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  36.15 
 
 		 300 aa  194  1e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  42.01 
 
 		 310 aa  194  1e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  36.15 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0505  ABC transporter related protein  50.45 
 
 		 323 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  42.46 
 
 		 303 aa  193  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  48.58 
 
 		 302 aa  192  6e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  37.16 
 
 		 300 aa  192  7e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  35.93 
 
 		 300 aa  192  7e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  35.93 
 
 		 300 aa  192  7e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  35.59 
 
 		 300 aa  191  8e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1807  ABC transporter, ATP-binding protein  48.39 
 
 		 253 aa  191  8e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3439  ABC transporter, ATP-binding protein  48.13 
 
 		 253 aa  191  9e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0214  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.47 
 
 		 312 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4025  ABC transporter related  49.11 
 
 		 320 aa  191  1e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.426784 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5477  ABC transporter related protein  52.86 
 
 		 330 aa  191  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  40.27 
 
 		 326 aa  191  1e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  43.69 
 
 		 326 aa  191  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  43.06 
 
 		 256 aa  191  1e-47  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.34 
 
 		 304 aa  191  1e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  37.27 
 
 		 300 aa  191  2e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  39.26 
 
 		 306 aa  190  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  40.45 
 
 		 328 aa  190  2e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1926  ABC transporter related  40.47 
 
 		 326 aa  190  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  35.93 
 
 		 300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  33.55 
 
 		 308 aa  189  2.9999999999999997e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3148  ABC transporter related  47.93 
 
 		 253 aa  188  7e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0680393  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  40.47 
 
 		 308 aa  188  7e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  46.45 
 
 		 308 aa  188  8e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1683  ABC transporter related  45.83 
 
 		 253 aa  188  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  38.93 
 
 		 311 aa  188  1e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  36.58 
 
 		 305 aa  188  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0925  ABC transporter related  44.39 
 
 		 256 aa  187  1e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4201  ABC transporter related  48.83 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  35.81 
 
 		 300 aa  186  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  47.66 
 
 		 300 aa  186  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2147  ABC transporter, ATP-binding protein  37.24 
 
 		 294 aa  186  4e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.387571  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.36 
 
 		 310 aa  186  5e-46  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.317764  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  48.85 
 
 		 323 aa  186  5e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54604  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4839  ABC transporter related protein  55.39 
 
 		 314 aa  186  5e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0814661  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25200  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.39 
 
 		 317 aa  185  8e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  46.51 
 
 		 312 aa  185  8e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5203  ABC transporter ATP-binding protein  35.93 
 
 		 299 aa  184  9e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0686  ABC transporter, ATP-binding protein  39.73 
 
 		 345 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.541745  normal  0.147814 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2837  ABC transporter related  47.47 
 
 		 309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.140237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3236  ABC transporter, ATP-binding protein, NodI family  47.47 
 
 		 309 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  41.22 
 
 		 319 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8872  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  50 
 
 		 321 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.892714  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0967  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.89 
 
 		 348 aa  184  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  43.37 
 
 		 299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0785  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.83 
 
 		 324 aa  184  1.0000000000000001e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  47.98 
 
 		 319 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4189  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.05 
 
 		 307 aa  184  2.0000000000000003e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0104  ABC transporter related  41.45 
 
 		 333 aa  183  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.233279 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  40.17 
 
 		 305 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3468  ABC transporter, ATP-binding protein  46.54 
 
 		 253 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000910882  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  40.61 
 
 		 305 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3240  ABC transporter ATP-binding protein  46.54 
 
 		 253 aa  183  3e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0255  ABC transporter related  47.39 
 
 		 298 aa  182  3e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.339403 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  40.55 
 
 		 302 aa  183  3e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>