More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3387 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3387  ABC transporter related  100 
 
 
324 aa  637    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.0912472 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3162  ABC transporter related  86.96 
 
 
324 aa  551  1e-156  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0228051 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4302  ABC transporter related protein  68.33 
 
 
312 aa  424  1e-117  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3144  ABC transporter related  67.47 
 
 
304 aa  379  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000906796  normal  0.0406724 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0144  ABC transporter related protein  60.55 
 
 
300 aa  330  2e-89  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7156  ABC transporter related protein  59.07 
 
 
281 aa  305  6e-82  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.023596 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33070  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  52.22 
 
 
286 aa  280  3e-74  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.468184  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  50.68 
 
 
301 aa  258  8e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  50.88 
 
 
301 aa  253  2.0000000000000002e-66  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7343  ABC transporter related  50.17 
 
 
284 aa  251  1e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991324 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  48.03 
 
 
280 aa  248  1e-64  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  48.08 
 
 
290 aa  238  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  49.47 
 
 
284 aa  236  4e-61  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  51.04 
 
 
317 aa  236  5.0000000000000005e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  48.43 
 
 
282 aa  235  6e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  49.47 
 
 
301 aa  235  8e-61  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3171  ABC transporter related  51.97 
 
 
294 aa  233  3e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0428846 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2680  ABC transporter related protein  50.51 
 
 
297 aa  232  5e-60  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  47.16 
 
 
276 aa  222  8e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29910  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.28 
 
 
313 aa  214  1.9999999999999998e-54  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.880888  normal  0.697642 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  43.69 
 
 
285 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0672  ABC transporter related  49.66 
 
 
289 aa  212  5.999999999999999e-54  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422494  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  48.74 
 
 
309 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  44.3 
 
 
299 aa  187  2e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  38.34 
 
 
308 aa  187  2e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.19 
 
 
304 aa  187  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  46.72 
 
 
338 aa  187  3e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  45.53 
 
 
319 aa  185  1.0000000000000001e-45  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  35.44 
 
 
283 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  38.51 
 
 
312 aa  183  3e-45  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  46.64 
 
 
302 aa  179  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  39.94 
 
 
313 aa  178  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  44.87 
 
 
309 aa  177  2e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  45.29 
 
 
308 aa  177  2e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  44.02 
 
 
308 aa  176  5e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1138  ABC transporter related  43.86 
 
 
311 aa  176  6e-43  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.129025  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  35.6 
 
 
310 aa  176  6e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  34.84 
 
 
310 aa  175  9e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  43.67 
 
 
313 aa  175  9e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1677  ABC transporter, ATPase subunit  38.1 
 
 
353 aa  175  9.999999999999999e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  42.69 
 
 
310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  45.26 
 
 
314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0191  ABC transporter related  38.71 
 
 
305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.668087  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  47.53 
 
 
308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2101  ABC transporter related  46.73 
 
 
322 aa  173  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  38.44 
 
 
303 aa  172  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  39.27 
 
 
330 aa  172  5.999999999999999e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  43.35 
 
 
310 aa  172  5.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  38.21 
 
 
388 aa  172  5.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  43.35 
 
 
310 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  43.35 
 
 
310 aa  172  6.999999999999999e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  38.69 
 
 
326 aa  171  1e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  41.29 
 
 
314 aa  171  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  44.64 
 
 
315 aa  171  1e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  41.77 
 
 
322 aa  171  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1191  ABC transporter related protein  38.7 
 
 
333 aa  170  3e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1843  ABC transporter related  45.97 
 
 
322 aa  170  3e-41  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000163971 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  33.33 
 
 
304 aa  170  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  33.55 
 
 
308 aa  170  3e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1585  ABC transporter related  46.4 
 
 
321 aa  169  5e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.719287  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0187  ABC transporter related  38.59 
 
 
299 aa  169  6e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.852326  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  38.56 
 
 
300 aa  168  9e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  37.62 
 
 
319 aa  168  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  35.03 
 
 
295 aa  168  1e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  46.88 
 
 
374 aa  167  2e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  35.59 
 
 
305 aa  167  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  34.85 
 
 
305 aa  167  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  35.25 
 
 
301 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14590  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.12 
 
 
331 aa  165  8e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.294178  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.48 
 
 
324 aa  165  8e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  38.08 
 
 
322 aa  165  9e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2919  ABC transporter related  48.44 
 
 
334 aa  165  9e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.748186  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  36.21 
 
 
303 aa  165  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  43.81 
 
 
319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  31.91 
 
 
300 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  39.01 
 
 
300 aa  163  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  34.2 
 
 
305 aa  164  3e-39  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  32.46 
 
 
300 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5630  ABC transporter related protein  45.27 
 
 
302 aa  163  4.0000000000000004e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.694537  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4255  ABC transporter related  36.25 
 
 
312 aa  163  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  39.01 
 
 
300 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  37.12 
 
 
301 aa  162  7e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  33.55 
 
 
305 aa  162  8.000000000000001e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0057  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.38 
 
 
362 aa  162  9e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  32.25 
 
 
300 aa  162  9e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3848  ABC transporter related protein  31.4 
 
 
325 aa  162  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  36.65 
 
 
254 aa  161  1e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  32 
 
 
300 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  41 
 
 
328 aa  161  1e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  38.82 
 
 
741 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1668  ABC transporter related protein  47.3 
 
 
329 aa  160  2e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0326508  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  33.33 
 
 
300 aa  160  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  35.43 
 
 
306 aa  160  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2342  ABC transporter related  40.13 
 
 
319 aa  160  3e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.2832 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  35.62 
 
 
339 aa  160  3e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  31.27 
 
 
300 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1683  ABC transporter related  40.89 
 
 
253 aa  160  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  38.12 
 
 
300 aa  159  6e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03830  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.94 
 
 
347 aa  159  7e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112396  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3299  ABC transporter related protein  42.42 
 
 
342 aa  159  7e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>