More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_2342 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2342  ABC transporter related  100 
 
 		 319 aa  619  1e-176  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.2832 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  57.81 
 
 		 304 aa  327  2.0000000000000001e-88  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  56.51 
 
 		 308 aa  316  3e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1668  ABC transporter related protein  60.63 
 
 		 329 aa  313  2.9999999999999996e-84  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0326508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  56.19 
 
 		 299 aa  302  6.000000000000001e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  51.11 
 
 		 308 aa  292  4e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  51.56 
 
 		 302 aa  288  7e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1138  ABC transporter related  52.06 
 
 		 311 aa  284  1.0000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.129025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  48.73 
 
 		 315 aa  278  9e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  51.26 
 
 		 308 aa  278  1e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  52 
 
 		 309 aa  275  7e-73  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  50.79 
 
 		 312 aa  273  2.0000000000000002e-72  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.65 
 
 		 308 aa  271  9e-72  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  52.84 
 
 		 374 aa  270  2e-71  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2919  ABC transporter related  52.85 
 
 		 334 aa  270  2e-71  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.748186  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  49.69 
 
 		 313 aa  269  5e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  49.84 
 
 		 338 aa  265  8.999999999999999e-70  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  52.01 
 
 		 388 aa  263  2e-69  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  48.41 
 
 		 309 aa  260  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  47.48 
 
 		 319 aa  259  5.0000000000000005e-68  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  47.47 
 
 		 314 aa  254  2.0000000000000002e-66  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  46.82 
 
 		 310 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  46.82 
 
 		 310 aa  253  3e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  46.5 
 
 		 310 aa  251  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  47.34 
 
 		 313 aa  249  3e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  47.96 
 
 		 310 aa  248  1e-64  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2101  ABC transporter related  50 
 
 		 322 aa  243  1.9999999999999999e-63  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1843  ABC transporter related  46.77 
 
 		 322 aa  242  5e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000163971 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  44.41 
 
 		 300 aa  240  2e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14590  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  54.26 
 
 		 331 aa  238  8e-62  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.294178  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  53.74 
 
 		 317 aa  206  5e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11470  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.78 
 
 		 321 aa  202  6e-51  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.160218  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  37.74 
 
 		 303 aa  202  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  38.24 
 
 		 304 aa  200  1.9999999999999998e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  34.08 
 
 		 308 aa  199  3.9999999999999996e-50  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  37.81 
 
 		 319 aa  199  5e-50  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  37.78 
 
 		 310 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  38.22 
 
 		 306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  47.98 
 
 		 301 aa  194  2e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4919  ABC transporter related protein  39.94 
 
 		 302 aa  192  5e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0999062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  39.03 
 
 		 285 aa  192  7e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  33.44 
 
 		 305 aa  191  2e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  47.2 
 
 		 301 aa  189  4e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  47.2 
 
 		 290 aa  189  4e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  33.12 
 
 		 301 aa  188  1e-46  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5630  ABC transporter related protein  46.98 
 
 		 302 aa  187  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.694537  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  42.68 
 
 		 299 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  38.34 
 
 		 331 aa  186  5e-46  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4747  ABC transporter related protein  48.17 
 
 		 237 aa  186  5e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.667529 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  46.73 
 
 		 282 aa  186  5e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  38.29 
 
 		 301 aa  186  5e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  45.02 
 
 		 322 aa  186  5e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  40.82 
 
 		 741 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  32.8 
 
 		 310 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  33.44 
 
 		 295 aa  183  3e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  42.5 
 
 		 301 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2680  ABC transporter related protein  50 
 
 		 297 aa  182  8.000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29910  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  50.47 
 
 		 313 aa  181  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.880888  normal  0.697642 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  33.23 
 
 		 305 aa  181  2e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  37.61 
 
 		 283 aa  180  2e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0191  ABC transporter related  39.49 
 
 		 305 aa  179  4e-44  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.668087  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3107  ABC transporter related protein  45.78 
 
 		 323 aa  178  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000248355 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7343  ABC transporter related  45.79 
 
 		 284 aa  178  1e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991324 
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  32.91 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3387  ABC transporter related  41.38 
 
 		 324 aa  177  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.0912472 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  33.23 
 
 		 305 aa  177  2e-43  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1974  nodulation ABC transporter NodI  38.75 
 
 		 321 aa  176  3e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.167166  normal  0.202305 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.46 
 
 		 324 aa  177  3e-43  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  36.98 
 
 		 330 aa  176  6e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  38.51 
 
 		 311 aa  176  7e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  36.08 
 
 		 322 aa  175  8e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3150  ABC transporter related  37.04 
 
 		 247 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13320  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  52.02 
 
 		 241 aa  174  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  43.93 
 
 		 280 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  35.99 
 
 		 293 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3171  ABC transporter related  47.25 
 
 		 294 aa  173  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0428846 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  38.79 
 
 		 256 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  38.32 
 
 		 254 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3694  ABC transporter related  39.62 
 
 		 756 aa  173  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  38.71 
 
 		 300 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  36.98 
 
 		 326 aa  172  5e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  39.72 
 
 		 302 aa  172  5e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1776  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.41 
 
 		 319 aa  172  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179608 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1677  ABC transporter, ATPase subunit  33.62 
 
 		 353 aa  172  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4160  ABC transporter related  35.56 
 
 		 314 aa  170  2e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  42.52 
 
 		 284 aa  171  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0672  ABC transporter related  45.58 
 
 		 289 aa  171  2e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0612  ABC transporter related protein  43.26 
 
 		 314 aa  170  3e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.787595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1508  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  30.15 
 
 		 323 aa  170  3e-41  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1804  nodulation ABC transporter NodI  39.13 
 
 		 320 aa  169  7e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1167  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  29.72 
 
 		 324 aa  169  7e-41  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2128  nodulation ABC transporter NodI  38.82 
 
 		 320 aa  169  8e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.226763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0260  ABC transporter related protein  39.51 
 
 		 329 aa  168  1e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.723146  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  38.2 
 
 		 311 aa  168  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3796  ABC transporter related  33.33 
 
 		 323 aa  167  2e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0919  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.76 
 
 		 342 aa  167  2e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  33.12 
 
 		 339 aa  167  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  41.64 
 
 		 315 aa  167  2e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4964  ABC transporter related  37.22 
 
 		 327 aa  167  2e-40  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  37.2 
 
 		 328 aa  167  2.9999999999999998e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>