More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fnod_0713 on replicon NC_009718
Organism: Fervidobacterium nodosum Rt17-B1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  100 
 
 
295 aa  597  1e-170  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  56.84 
 
 
283 aa  303  3.0000000000000004e-81  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  54.64 
 
 
305 aa  296  2e-79  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  54.3 
 
 
301 aa  294  1e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  50.16 
 
 
308 aa  280  2e-74  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  48.53 
 
 
310 aa  266  4e-70  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  46.84 
 
 
304 aa  263  3e-69  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  47.68 
 
 
305 aa  251  7e-66  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  47.35 
 
 
305 aa  251  1e-65  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  45.75 
 
 
305 aa  249  5e-65  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  42.86 
 
 
301 aa  230  2e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  42.72 
 
 
310 aa  230  3e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  41.04 
 
 
319 aa  229  6e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  43.01 
 
 
300 aa  217  2e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  38.51 
 
 
299 aa  212  4.9999999999999996e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  38.01 
 
 
285 aa  211  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  36.96 
 
 
331 aa  211  1e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  47.11 
 
 
256 aa  208  9e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2147  ABC transporter, ATP-binding protein  39.86 
 
 
294 aa  206  3e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.387571  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  40.13 
 
 
306 aa  206  4e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  46.98 
 
 
254 aa  204  1e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  45 
 
 
322 aa  204  2e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  41.95 
 
 
293 aa  202  5e-51  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4255  ABC transporter related  36.77 
 
 
312 aa  199  6e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  35.03 
 
 
312 aa  198  7.999999999999999e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  37.42 
 
 
303 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  38.36 
 
 
326 aa  198  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  38.69 
 
 
741 aa  197  2.0000000000000003e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.51 
 
 
304 aa  197  2.0000000000000003e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  36.69 
 
 
310 aa  197  2.0000000000000003e-49  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  46.45 
 
 
322 aa  196  3e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  35.79 
 
 
280 aa  196  3e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  37.17 
 
 
338 aa  196  4.0000000000000005e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  37.7 
 
 
310 aa  196  4.0000000000000005e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  38.03 
 
 
302 aa  195  6e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  35.44 
 
 
284 aa  195  7e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  35.29 
 
 
301 aa  195  9e-49  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  42.61 
 
 
300 aa  194  1e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  36.36 
 
 
339 aa  194  1e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0925  ABC transporter related  38.75 
 
 
256 aa  194  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  36.18 
 
 
311 aa  194  1e-48  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  42.61 
 
 
300 aa  194  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1267  ABC transporter-like protein  36.18 
 
 
303 aa  194  2e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0672  ABC transporter related  36.33 
 
 
289 aa  194  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422494  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7343  ABC transporter related  34.84 
 
 
284 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991324 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  36.57 
 
 
310 aa  193  2e-48  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2430  ABC transporter related  39.26 
 
 
303 aa  194  2e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0400473  normal  0.675282 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  36.57 
 
 
310 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  36.57 
 
 
310 aa  193  3e-48  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  35.81 
 
 
308 aa  193  3e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  42.61 
 
 
300 aa  192  4e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  36.04 
 
 
310 aa  193  4e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  42.17 
 
 
300 aa  192  5e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  36.39 
 
 
303 aa  192  6e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  43.72 
 
 
300 aa  192  7e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  37.11 
 
 
300 aa  192  8e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  35.82 
 
 
301 aa  192  8e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2585  ABC transporter related  39.66 
 
 
308 aa  191  9e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.345311  normal  0.0961797 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  37.86 
 
 
311 aa  191  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  37.86 
 
 
313 aa  190  2e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  41.74 
 
 
300 aa  190  2e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2518  ABC transporter related  37.66 
 
 
310 aa  191  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0818783  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  34.97 
 
 
314 aa  190  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  34.49 
 
 
317 aa  190  2.9999999999999997e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  36.57 
 
 
308 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2680  ABC transporter related protein  36.27 
 
 
297 aa  189  4e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  42.61 
 
 
300 aa  189  4e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  37.54 
 
 
300 aa  189  4e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1117  ABC transporter related  40 
 
 
317 aa  189  4e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  34.87 
 
 
306 aa  189  4e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  37.58 
 
 
309 aa  189  5e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  36.57 
 
 
308 aa  189  5e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  34.87 
 
 
314 aa  189  5e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  42.17 
 
 
300 aa  189  5e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4160  ABC transporter related  38.21 
 
 
314 aa  189  5.999999999999999e-47  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0192  ABC transporter related  34.26 
 
 
329 aa  189  7e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  36.91 
 
 
326 aa  188  8e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0667  ABC transporter related  34.85 
 
 
307 aa  187  1e-46  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.201988 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  35.92 
 
 
301 aa  188  1e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  36.33 
 
 
282 aa  187  1e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  35.4 
 
 
290 aa  187  1e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  35.53 
 
 
302 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  35.6 
 
 
312 aa  187  2e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3171  ABC transporter related  36.93 
 
 
294 aa  187  2e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0428846 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29910  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.88 
 
 
313 aa  187  2e-46  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.880888  normal  0.697642 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0612  ABC transporter related protein  37.09 
 
 
314 aa  186  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.787595  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3694  ABC transporter related  42.15 
 
 
756 aa  186  3e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  35.92 
 
 
309 aa  187  3e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  36.54 
 
 
328 aa  186  4e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3573  ABC transporter related  35.58 
 
 
313 aa  186  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3711  ABC transporter related  35.95 
 
 
323 aa  186  4e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  36.98 
 
 
313 aa  186  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0747  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.89 
 
 
345 aa  186  5e-46  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1723  ABC transporter-like protein  33.9 
 
 
295 aa  186  5e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.14632  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  34.41 
 
 
330 aa  185  7e-46  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4919  ABC transporter related protein  34.98 
 
 
302 aa  185  8e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0999062  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7720  nodulation ABC transporter NodI  36.91 
 
 
304 aa  185  8e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948879  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  36.55 
 
 
388 aa  185  9e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  37.12 
 
 
299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1138  ABC transporter related  34.74 
 
 
311 aa  184  1.0000000000000001e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.129025  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>