More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2251 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  100 
 
 
308 aa  608  1e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  65.15 
 
 
308 aa  385  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  61.24 
 
 
304 aa  364  1e-99  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  59.8 
 
 
312 aa  361  8e-99  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  61.04 
 
 
302 aa  361  9e-99  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  62.37 
 
 
388 aa  353  2e-96  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  59.42 
 
 
308 aa  353  2.9999999999999997e-96  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  61.18 
 
 
338 aa  352  5.9999999999999994e-96  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  59.41 
 
 
309 aa  349  3e-95  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  59.62 
 
 
309 aa  345  5e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  58.09 
 
 
310 aa  345  7e-94  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  58.09 
 
 
310 aa  345  8e-94  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  58.09 
 
 
310 aa  345  8e-94  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  62.17 
 
 
308 aa  343  2e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  59.22 
 
 
319 aa  341  7e-93  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  63.67 
 
 
374 aa  337  9.999999999999999e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  60.54 
 
 
313 aa  333  2e-90  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  56.91 
 
 
310 aa  332  4e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  58.36 
 
 
315 aa  330  2e-89  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  58.23 
 
 
313 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  54.75 
 
 
314 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1668  ABC transporter related protein  58.39 
 
 
329 aa  317  2e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0326508  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2919  ABC transporter related  57.52 
 
 
334 aa  306  4.0000000000000004e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.748186  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  55.23 
 
 
299 aa  301  7.000000000000001e-81  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1138  ABC transporter related  50.16 
 
 
311 aa  285  7e-76  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.129025  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2342  ABC transporter related  50.63 
 
 
319 aa  274  2.0000000000000002e-72  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.2832 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2101  ABC transporter related  49.84 
 
 
322 aa  272  5.000000000000001e-72  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1843  ABC transporter related  47.65 
 
 
322 aa  271  1e-71  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000163971 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  47.35 
 
 
300 aa  261  1e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  48.51 
 
 
303 aa  252  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  46.38 
 
 
306 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4919  ABC transporter related protein  46.05 
 
 
302 aa  238  5.999999999999999e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0999062  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  45.7 
 
 
302 aa  234  1.0000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  46.08 
 
 
331 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2680  ABC transporter related protein  48.84 
 
 
297 aa  229  3e-59  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  45.82 
 
 
322 aa  229  4e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  43.46 
 
 
305 aa  228  1e-58  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  43.14 
 
 
305 aa  226  3e-58  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  47.02 
 
 
299 aa  224  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  42.53 
 
 
305 aa  224  2e-57  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0612  ABC transporter related protein  47.19 
 
 
314 aa  221  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.787595  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  40.13 
 
 
304 aa  218  7.999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29910  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  55.5 
 
 
313 aa  214  9.999999999999999e-55  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.880888  normal  0.697642 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  44.22 
 
 
330 aa  214  9.999999999999999e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  43.14 
 
 
285 aa  214  1.9999999999999998e-54  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  42.54 
 
 
301 aa  213  2.9999999999999995e-54  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  41.61 
 
 
319 aa  213  3.9999999999999995e-54  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  50.44 
 
 
301 aa  213  3.9999999999999995e-54  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14590  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  52.15 
 
 
331 aa  212  7e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.294178  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  37.46 
 
 
308 aa  211  1e-53  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  53.92 
 
 
317 aa  210  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  42.57 
 
 
314 aa  208  9e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  44 
 
 
301 aa  207  2e-52  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  43.32 
 
 
301 aa  207  2e-52  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  39.55 
 
 
322 aa  206  4e-52  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  50 
 
 
280 aa  203  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0191  ABC transporter related  43.09 
 
 
305 aa  203  3e-51  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.668087  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  37.29 
 
 
305 aa  202  5e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  48.13 
 
 
284 aa  202  5e-51  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  41.2 
 
 
290 aa  202  6e-51  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  41.2 
 
 
282 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  36.96 
 
 
301 aa  201  1.9999999999999998e-50  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5630  ABC transporter related protein  41.33 
 
 
302 aa  199  6e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.694537  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  40 
 
 
326 aa  198  1.0000000000000001e-49  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  38.59 
 
 
310 aa  195  9e-49  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1677  ABC transporter, ATPase subunit  39.94 
 
 
353 aa  194  1e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  34.84 
 
 
283 aa  194  1e-48  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3171  ABC transporter related  52.26 
 
 
294 aa  194  2e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0428846 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11470  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  49.75 
 
 
321 aa  192  7e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.160218  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5477  ABC transporter related protein  41.64 
 
 
330 aa  191  1e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0291  ABC-type multidrug transport system ATPase component  37.38 
 
 
324 aa  190  2e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  39.74 
 
 
311 aa  190  2.9999999999999997e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  43.66 
 
 
254 aa  189  4e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0672  ABC transporter related  40.91 
 
 
289 aa  189  4e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422494  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  36.57 
 
 
295 aa  189  5e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4747  ABC transporter related protein  47.19 
 
 
237 aa  189  7e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.667529 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  37.38 
 
 
312 aa  188  9e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  46.45 
 
 
276 aa  188  1e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0043  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.94 
 
 
337 aa  187  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  35.99 
 
 
310 aa  187  2e-46  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  42.3 
 
 
741 aa  187  2e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  38.14 
 
 
310 aa  186  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7156  ABC transporter related protein  40.73 
 
 
281 aa  186  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.023596 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3107  ABC transporter related protein  43.42 
 
 
323 aa  185  7e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248355 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0925  ABC transporter related  44.04 
 
 
256 aa  185  7e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4302  ABC transporter related protein  42.08 
 
 
312 aa  185  9e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3162  ABC transporter related  43.41 
 
 
324 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0228051 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7343  ABC transporter related  46.26 
 
 
284 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991324 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  35.02 
 
 
300 aa  183  3e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  40.32 
 
 
319 aa  183  3e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  36.03 
 
 
300 aa  183  3e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  35.35 
 
 
300 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1698  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.54 
 
 
338 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33070  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.81 
 
 
286 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.468184  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  38.39 
 
 
332 aa  182  5.0000000000000004e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3144  ABC transporter related  44.81 
 
 
304 aa  182  5.0000000000000004e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000906796  normal  0.0406724 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3531  ABC transporter related protein  44.69 
 
 
319 aa  182  6e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1191  ABC transporter related protein  40 
 
 
333 aa  182  8.000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1585  ABC transporter related  38.49 
 
 
321 aa  181  1e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.719287  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6786  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.76 
 
 
322 aa  181  2e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00659712  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>