More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2730 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  100 
 
 
309 aa  617  1e-176  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  92.18 
 
 
319 aa  568  1e-161  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  85.71 
 
 
310 aa  544  1e-154  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  85.71 
 
 
310 aa  544  1e-154  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  85.39 
 
 
310 aa  542  1e-153  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  81.13 
 
 
313 aa  490  1e-137  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  70.49 
 
 
338 aa  442  1e-123  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  64.36 
 
 
312 aa  385  1e-106  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  62.25 
 
 
308 aa  382  1e-105  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  63.46 
 
 
310 aa  372  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  60.86 
 
 
308 aa  363  2e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  60 
 
 
388 aa  357  9.999999999999999e-98  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  63.7 
 
 
374 aa  355  5e-97  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  59.41 
 
 
308 aa  349  3e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  59.02 
 
 
302 aa  346  2e-94  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  59.28 
 
 
308 aa  334  1e-90  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  54.3 
 
 
314 aa  332  5e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  56.73 
 
 
313 aa  326  3e-88  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  57.05 
 
 
309 aa  320  1.9999999999999998e-86  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  54.82 
 
 
304 aa  311  5.999999999999999e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  54.13 
 
 
315 aa  303  2.0000000000000002e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2919  ABC transporter related  53.44 
 
 
334 aa  277  2e-73  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.748186  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1668  ABC transporter related protein  49.84 
 
 
329 aa  263  4e-69  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0326508  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1138  ABC transporter related  45.9 
 
 
311 aa  258  1e-67  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.129025  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  47.88 
 
 
299 aa  249  4e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  45.03 
 
 
300 aa  248  9e-65  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  46.51 
 
 
306 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2342  ABC transporter related  48.09 
 
 
319 aa  238  9e-62  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.2832 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  43.89 
 
 
302 aa  223  2e-57  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1843  ABC transporter related  43.03 
 
 
322 aa  223  3e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000163971 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  45.48 
 
 
322 aa  222  4.9999999999999996e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4919  ABC transporter related protein  44.52 
 
 
302 aa  218  7e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0999062  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2101  ABC transporter related  42.77 
 
 
322 aa  217  2e-55  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  41.12 
 
 
303 aa  216  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  38.03 
 
 
305 aa  205  7e-52  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  38.36 
 
 
304 aa  204  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0612  ABC transporter related protein  42.62 
 
 
314 aa  202  8e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.787595  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  41.2 
 
 
299 aa  201  9.999999999999999e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  37.7 
 
 
305 aa  200  1.9999999999999998e-50  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  49.77 
 
 
301 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  41.47 
 
 
290 aa  200  1.9999999999999998e-50  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  40.73 
 
 
330 aa  200  3e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  40.2 
 
 
314 aa  199  5e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  41.55 
 
 
282 aa  199  5e-50  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  41.25 
 
 
301 aa  199  5e-50  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  37.7 
 
 
305 aa  199  6e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  35.22 
 
 
283 aa  198  1.0000000000000001e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0191  ABC transporter related  41.14 
 
 
305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.668087  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  41.31 
 
 
301 aa  196  4.0000000000000005e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  48.37 
 
 
284 aa  196  5.000000000000001e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  47.42 
 
 
280 aa  195  7e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  41.35 
 
 
331 aa  193  3e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14590  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  51.22 
 
 
331 aa  192  7e-48  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.294178  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  36.83 
 
 
319 aa  192  8e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5477  ABC transporter related protein  41.58 
 
 
330 aa  192  8e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  35.74 
 
 
308 aa  191  9e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  36.3 
 
 
305 aa  191  1e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2680  ABC transporter related protein  49.77 
 
 
297 aa  190  2e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  39.6 
 
 
322 aa  191  2e-47  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7343  ABC transporter related  47.89 
 
 
284 aa  190  2.9999999999999997e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00991324 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  35.97 
 
 
301 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1191  ABC transporter related protein  40.58 
 
 
333 aa  188  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0291  ABC-type multidrug transport system ATPase component  37.79 
 
 
324 aa  187  3e-46  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  35.92 
 
 
295 aa  187  3e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  45.49 
 
 
285 aa  187  3e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  41.12 
 
 
254 aa  186  4e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  39.41 
 
 
310 aa  185  8e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03830  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.85 
 
 
347 aa  184  1.0000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112396  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  37.55 
 
 
256 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  39.81 
 
 
300 aa  184  1.0000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3531  ABC transporter related protein  40.67 
 
 
319 aa  184  1.0000000000000001e-45  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  36.42 
 
 
310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1776  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.02 
 
 
319 aa  184  2.0000000000000003e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.179608 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  39.93 
 
 
301 aa  183  4.0000000000000006e-45  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  39.54 
 
 
741 aa  183  4.0000000000000006e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  50.23 
 
 
317 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  40.79 
 
 
319 aa  182  6e-45  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  37.31 
 
 
326 aa  182  6e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  36.99 
 
 
300 aa  182  8.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7156  ABC transporter related protein  46.02 
 
 
281 aa  182  8.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.023596 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  37.29 
 
 
300 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29910  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.05 
 
 
313 aa  181  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.880888  normal  0.697642 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  36.99 
 
 
300 aa  181  1e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  38.01 
 
 
310 aa  181  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  36.99 
 
 
300 aa  181  1e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  37.78 
 
 
310 aa  181  1e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0144  ABC transporter related protein  46.89 
 
 
300 aa  180  2.9999999999999997e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3162  ABC transporter related  46.43 
 
 
324 aa  180  2.9999999999999997e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0228051 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1677  ABC transporter, ATPase subunit  36.2 
 
 
353 aa  179  4e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3171  ABC transporter related  47.73 
 
 
294 aa  179  5.999999999999999e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.0428846 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0672  ABC transporter related  46.61 
 
 
289 aa  179  5.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422494  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  47.42 
 
 
276 aa  179  7e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5630  ABC transporter related protein  39.59 
 
 
302 aa  178  9e-44  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.694537  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3107  ABC transporter related protein  42.62 
 
 
323 aa  178  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000248355 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  36.95 
 
 
300 aa  177  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  37.29 
 
 
300 aa  177  2e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3387  ABC transporter related  44.87 
 
 
324 aa  177  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.0912472 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  36.3 
 
 
300 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  36.05 
 
 
326 aa  177  2e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33070  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.36 
 
 
286 aa  177  2e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.468184  normal  0.320706 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>