More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1687 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 280 aa  553  1e-156  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  74.55 
 
 		 284 aa  397  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  66.06 
 
 		 301 aa  355  6.999999999999999e-97  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  64.47 
 
 		 301 aa  352  5e-96  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  64.62 
 
 		 276 aa  344  8.999999999999999e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  64.23 
 
 		 290 aa  344  1e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  64.6 
 
 		 282 aa  343  2e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7343  ABC transporter related  62.68 
 
 		 284 aa  338  5.9999999999999996e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991324 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3171  ABC transporter related  64.62 
 
 		 294 aa  335  5e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0428846 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  60.87 
 
 		 301 aa  320  1.9999999999999998e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2680  ABC transporter related protein  61.96 
 
 		 297 aa  315  7e-85  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0672  ABC transporter related  58.21 
 
 		 289 aa  314  9.999999999999999e-85  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29910  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  62.68 
 
 		 313 aa  312  2.9999999999999996e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.880888  normal  0.697642 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  57.66 
 
 		 317 aa  294  8e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7156  ABC transporter related protein  53.43 
 
 		 281 aa  291  7e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.023596 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  56.68 
 
 		 285 aa  291  9e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4302  ABC transporter related protein  46.81 
 
 		 312 aa  251  1e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33070  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.16 
 
 		 286 aa  250  2e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.468184  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3144  ABC transporter related  48.96 
 
 		 304 aa  248  6e-65  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000906796  normal  0.0406724 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3387  ABC transporter related  48.03 
 
 		 324 aa  248  9e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.0912472 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3162  ABC transporter related  48.03 
 
 		 324 aa  241  7.999999999999999e-63  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0228051 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0144  ABC transporter related protein  48.04 
 
 		 300 aa  241  1e-62  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  42.44 
 
 		 283 aa  228  1e-58  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  42.42 
 
 		 304 aa  227  2e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  42.96 
 
 		 305 aa  223  2e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  42.6 
 
 		 301 aa  221  9e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  39.46 
 
 		 310 aa  218  8.999999999999998e-56  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3531  ABC transporter related protein  44.82 
 
 		 319 aa  213  1.9999999999999998e-54  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  41.28 
 
 		 301 aa  210  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  38.46 
 
 		 310 aa  209  5e-53  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  36.3 
 
 		 308 aa  205  6e-52  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  40.47 
 
 		 312 aa  205  8e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  51.43 
 
 		 303 aa  204  9e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  46.29 
 
 		 300 aa  203  2e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  45.37 
 
 		 254 aa  203  3e-51  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  50 
 
 		 308 aa  203  3e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  49.07 
 
 		 304 aa  202  4e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  40.85 
 
 		 326 aa  202  7e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  45.45 
 
 		 302 aa  202  7e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  49.08 
 
 		 308 aa  201  8e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2147  ABC transporter, ATP-binding protein  39.73 
 
 		 294 aa  201  9.999999999999999e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.387571  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  48.31 
 
 		 322 aa  201  9.999999999999999e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  50 
 
 		 314 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  35.03 
 
 		 300 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1585  ABC transporter related  47.56 
 
 		 321 aa  199  5e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.719287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  44.54 
 
 		 306 aa  199  6e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  39.02 
 
 		 300 aa  198  9e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  49.05 
 
 		 302 aa  197  1.0000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  38.8 
 
 		 300 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  40.68 
 
 		 310 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  39.02 
 
 		 300 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  40.68 
 
 		 310 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  40.68 
 
 		 310 aa  197  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.61 
 
 		 308 aa  196  2.0000000000000003e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0505  ABC transporter related protein  46.9 
 
 		 323 aa  197  2.0000000000000003e-49  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  46.19 
 
 		 313 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  38.85 
 
 		 305 aa  196  3e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  38.18 
 
 		 305 aa  196  3e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  35.79 
 
 		 295 aa  196  3e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  45.41 
 
 		 311 aa  196  4.0000000000000005e-49  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  38.51 
 
 		 305 aa  196  5.000000000000001e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  46.08 
 
 		 319 aa  195  5.000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  43.55 
 
 		 322 aa  196  5.000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  38.4 
 
 		 300 aa  195  6e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  47.42 
 
 		 309 aa  195  6e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  39.06 
 
 		 300 aa  194  1e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  46.15 
 
 		 328 aa  194  1e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  37.8 
 
 		 300 aa  194  2e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  41.36 
 
 		 319 aa  194  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  46.54 
 
 		 338 aa  193  3e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  38.4 
 
 		 300 aa  193  3e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  47.2 
 
 		 310 aa  193  3e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  48.06 
 
 		 388 aa  192  4e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  39.06 
 
 		 300 aa  192  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  44.13 
 
 		 256 aa  192  6e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  42.75 
 
 		 299 aa  191  8e-48  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  44.1 
 
 		 300 aa  191  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1677  ABC transporter, ATPase subunit  46.52 
 
 		 353 aa  191  1e-47  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  40.73 
 
 		 339 aa  191  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  38.1 
 
 		 300 aa  191  1e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0286  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.46 
 
 		 307 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  46.73 
 
 		 315 aa  190  2e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5630  ABC transporter related protein  47.37 
 
 		 302 aa  190  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.694537  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3003  ABC transporter related  40.34 
 
 		 309 aa  189  4e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000662652  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3299  ABC transporter related protein  39.1 
 
 		 342 aa  189  4e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  45.78 
 
 		 332 aa  188  7e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  46.92 
 
 		 314 aa  188  8e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  47.66 
 
 		 309 aa  188  9e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25200  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.58 
 
 		 317 aa  187  1e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0192  ABC transporter related  39.58 
 
 		 329 aa  187  1e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5203  ABC transporter ATP-binding protein  39.06 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4201  ABC transporter related  46.01 
 
 		 305 aa  187  2e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06310  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.12 
 
 		 323 aa  187  2e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.52931  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  50.46 
 
 		 308 aa  186  3e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  37.93 
 
 		 293 aa  186  4e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0874  ABC transporter related  43.1 
 
 		 312 aa  186  4e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.468306  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0187  ABC transporter related  42.46 
 
 		 299 aa  186  4e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.852326  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4919  ABC transporter related protein  43.11 
 
 		 302 aa  186  4e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0999062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  42.67 
 
 		 306 aa  186  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  44.91 
 
 		 313 aa  186  5e-46  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>