More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sked_29910 on replicon NC_013521
Organism: Sanguibacter keddieii DSM 10542



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_29910  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  100 
 
 		 313 aa  612  9.999999999999999e-175  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.880888  normal  0.697642 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  69.5 
 
 		 301 aa  364  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2680  ABC transporter related protein  70.85 
 
 		 297 aa  364  1e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  64.16 
 
 		 301 aa  336  2.9999999999999997e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  62.45 
 
 		 280 aa  332  4e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  63.9 
 
 		 284 aa  329  3e-89  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3171  ABC transporter related  68.59 
 
 		 294 aa  326  4.0000000000000003e-88  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0428846 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  62.32 
 
 		 301 aa  320  9.999999999999999e-87  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0672  ABC transporter related  61.84 
 
 		 289 aa  311  5.999999999999999e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422494  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  58.84 
 
 		 290 aa  311  9e-84  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  59.21 
 
 		 282 aa  307  1.0000000000000001e-82  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7343  ABC transporter related  58.6 
 
 		 284 aa  307  1.0000000000000001e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991324 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  60 
 
 		 276 aa  301  1e-80  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  59.11 
 
 		 317 aa  296  4e-79  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  53.05 
 
 		 285 aa  267  1e-70  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7156  ABC transporter related protein  51.62 
 
 		 281 aa  263  2e-69  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.023596 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33070  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  50 
 
 		 286 aa  246  4.9999999999999997e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.468184  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4302  ABC transporter related protein  44.34 
 
 		 312 aa  239  5.999999999999999e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3144  ABC transporter related  48.45 
 
 		 304 aa  238  1e-61  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000906796  normal  0.0406724 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3162  ABC transporter related  48.82 
 
 		 324 aa  238  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0228051 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0144  ABC transporter related protein  49.48 
 
 		 300 aa  235  8e-61  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3387  ABC transporter related  46.96 
 
 		 324 aa  230  3e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.962121  normal  0.0912472 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  55.5 
 
 		 308 aa  228  8e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  46.58 
 
 		 308 aa  227  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  54.3 
 
 		 312 aa  226  5.0000000000000005e-58  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  54.13 
 
 		 304 aa  224  2e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  40.14 
 
 		 283 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  40.4 
 
 		 304 aa  219  5e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  44.37 
 
 		 302 aa  217  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  53.74 
 
 		 308 aa  216  4e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.252835  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  43.92 
 
 		 301 aa  216  4e-55  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  43.84 
 
 		 300 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  39.52 
 
 		 300 aa  213  4.9999999999999996e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  46.01 
 
 		 308 aa  212  5.999999999999999e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  45.39 
 
 		 338 aa  212  7e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  47.04 
 
 		 299 aa  211  1e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  44.19 
 
 		 314 aa  211  1e-53  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  46.37 
 
 		 374 aa  209  5e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  43.25 
 
 		 388 aa  209  7e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  43.87 
 
 		 310 aa  209  7e-53  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  43.87 
 
 		 310 aa  208  8e-53  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  43.87 
 
 		 310 aa  208  8e-53  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  46.26 
 
 		 308 aa  208  1e-52  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  39.11 
 
 		 300 aa  207  2e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  47.83 
 
 		 310 aa  207  2e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  39.57 
 
 		 300 aa  205  8e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  38.71 
 
 		 300 aa  205  9e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  37.98 
 
 		 300 aa  205  9e-52  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  38.72 
 
 		 300 aa  204  2e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5630  ABC transporter related protein  54.13 
 
 		 302 aa  204  2e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.694537  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0713  ABC transporter related  36.88 
 
 		 295 aa  204  2e-51  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  39.83 
 
 		 300 aa  203  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  38.6 
 
 		 305 aa  203  3e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  39.39 
 
 		 300 aa  202  4e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  39 
 
 		 310 aa  203  4e-51  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  50.47 
 
 		 303 aa  203  4e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  39.15 
 
 		 300 aa  202  5e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  43.81 
 
 		 314 aa  202  6e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  44.26 
 
 		 309 aa  202  8e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  49.56 
 
 		 315 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  38.25 
 
 		 301 aa  201  9.999999999999999e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  38.31 
 
 		 300 aa  200  1.9999999999999998e-50  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1668  ABC transporter related protein  54.88 
 
 		 329 aa  199  3e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0326508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3320  ABC transporter related protein  48.66 
 
 		 331 aa  200  3e-50  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  48.72 
 
 		 313 aa  199  3.9999999999999996e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  47.49 
 
 		 310 aa  197  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3003  ABC transporter related  41.78 
 
 		 309 aa  198  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000662652  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  39.73 
 
 		 305 aa  197  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1585  ABC transporter related  49.14 
 
 		 321 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.719287  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  47.42 
 
 		 302 aa  197  2.0000000000000003e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5203  ABC transporter ATP-binding protein  39.39 
 
 		 299 aa  196  3e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  41.81 
 
 		 254 aa  197  3e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  39.06 
 
 		 305 aa  196  4.0000000000000005e-49  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  42.04 
 
 		 322 aa  196  4.0000000000000005e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  45.21 
 
 		 741 aa  196  4.0000000000000005e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  48.05 
 
 		 309 aa  195  8.000000000000001e-49  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3531  ABC transporter related protein  41.86 
 
 		 319 aa  194  1e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  38.72 
 
 		 305 aa  194  1e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  49.76 
 
 		 322 aa  193  4e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  50.95 
 
 		 303 aa  192  5e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1677  ABC transporter, ATPase subunit  47.39 
 
 		 353 aa  192  5e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  41.56 
 
 		 319 aa  192  8e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  43.29 
 
 		 319 aa  192  9e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0286  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.05 
 
 		 307 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0505  ABC transporter related protein  48.42 
 
 		 323 aa  191  1e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  42.05 
 
 		 300 aa  190  2.9999999999999997e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0874  ABC transporter related  46.64 
 
 		 312 aa  190  2.9999999999999997e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.468306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2518  ABC transporter related  37.38 
 
 		 310 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0818783  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3573  ABC transporter related  41.47 
 
 		 326 aa  190  2.9999999999999997e-47  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0525989  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  44.53 
 
 		 328 aa  189  5e-47  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  47.96 
 
 		 313 aa  189  5.999999999999999e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2919  ABC transporter related  54.42 
 
 		 334 aa  188  8e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.748186  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  46.98 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3299  ABC transporter related protein  41.42 
 
 		 342 aa  186  3e-46  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1138  ABC transporter related  42.92 
 
 		 311 aa  186  5e-46  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.129025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  40.74 
 
 		 319 aa  186  5e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4201  ABC transporter related  41.95 
 
 		 305 aa  185  7e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1843  ABC transporter related  36.74 
 
 		 322 aa  185  7e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000163971 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5589  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.72 
 
 		 327 aa  185  9e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0187  ABC transporter related  41.91 
 
 		 299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.852326  normal  0.850223 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>