More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_4025 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_4025  ABC transporter related  100 
 
 
320 aa  620  1e-177  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.426784 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3449  ABC transporter related protein  64.85 
 
 
325 aa  345  4e-94  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.102969 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2548  ABC transporter related protein  60.68 
 
 
293 aa  334  2e-90  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0653313  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4201  ABC transporter related  59.72 
 
 
305 aa  323  2e-87  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36180  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  59.73 
 
 
311 aa  320  1.9999999999999998e-86  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1267  ABC transporter-like protein  55.09 
 
 
303 aa  304  1.0000000000000001e-81  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  52.43 
 
 
303 aa  288  6e-77  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0255  ABC transporter related  44.56 
 
 
298 aa  231  1e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.339403 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0652  ABC transporter related  41.28 
 
 
307 aa  226  5.0000000000000005e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.673494  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0187  ABC transporter related  46.6 
 
 
299 aa  223  4e-57  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.852326  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  33.89 
 
 
300 aa  206  4e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  34.34 
 
 
300 aa  206  4e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  34.01 
 
 
300 aa  205  1e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  34.34 
 
 
300 aa  205  1e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  35.07 
 
 
300 aa  203  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  33.89 
 
 
300 aa  203  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  34.33 
 
 
300 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  39.2 
 
 
326 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  33.22 
 
 
300 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5203  ABC transporter ATP-binding protein  34.33 
 
 
299 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0289  ABC transporter related  40.97 
 
 
343 aa  196  4.0000000000000005e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.233403  normal  0.22367 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0482  ABC transporter related  40.51 
 
 
322 aa  195  8.000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  32.21 
 
 
300 aa  194  2e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  33.67 
 
 
300 aa  194  2e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1638  ABC transporter related protein  43.4 
 
 
299 aa  192  6e-48  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.374187  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0760  ABC transporter related  36.91 
 
 
326 aa  192  7e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.393195 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0274  ABC transporter related protein  38.46 
 
 
303 aa  192  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02230  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.48 
 
 
320 aa  192  8e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1723  ABC transporter-like protein  40.41 
 
 
295 aa  192  8e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.14632  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06310  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.54 
 
 
323 aa  191  1e-47  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.52931  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  38.93 
 
 
339 aa  191  1e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  49.11 
 
 
276 aa  191  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3003  ABC transporter related  38.14 
 
 
309 aa  189  5.999999999999999e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000662652  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  40.79 
 
 
314 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  45.5 
 
 
284 aa  189  7e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1905  ABC transporter related  42.05 
 
 
300 aa  187  2e-46  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.256972 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0824  ABC transporter related protein  39.8 
 
 
306 aa  186  3e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0192  ABC transporter related  39.1 
 
 
329 aa  186  5e-46  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2014  ABC transporter related  38.31 
 
 
309 aa  186  5e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9332  ABC transporter related protein  40.14 
 
 
299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.45815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  41.2 
 
 
322 aa  184  2.0000000000000003e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3544  ABC transporter related  40.07 
 
 
302 aa  184  2.0000000000000003e-45  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0818201  normal  0.548154 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2760  ABC transporter related  39.02 
 
 
318 aa  183  3e-45  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  40.13 
 
 
301 aa  183  4.0000000000000006e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1926  ABC transporter related  39.6 
 
 
326 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0069  ABC transporter component  39.46 
 
 
336 aa  181  1e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.248175  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1940  ABC transporter related  40.6 
 
 
306 aa  181  1e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0411  ABC transporter related  40 
 
 
335 aa  179  4e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  32.45 
 
 
308 aa  180  4e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0582  ABC transporter related protein  38.62 
 
 
310 aa  179  7e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.691368  unclonable  0.00000397849 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  36.93 
 
 
309 aa  178  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0096  putative ATP-binding component of a transport system  33.76 
 
 
312 aa  177  2e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.546673  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  41.35 
 
 
254 aa  177  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  39.61 
 
 
301 aa  177  3e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  42.41 
 
 
280 aa  177  3e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  36.89 
 
 
300 aa  176  4e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2941  ABC transporter related  37.38 
 
 
325 aa  175  8e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2744  ABC transporter related  37.29 
 
 
309 aa  174  9.999999999999999e-43  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0242  ABC transporter related  33.44 
 
 
297 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.197006 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0746  ABC transporter related  36.39 
 
 
310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1855  ABC transporter related  38.81 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.152779  normal  0.374801 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1061  ABC transporter related protein  32.25 
 
 
311 aa  174  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1585  ABC transporter related  39.67 
 
 
321 aa  174  2.9999999999999996e-42  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.719287  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  38.8 
 
 
319 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  40.27 
 
 
741 aa  173  2.9999999999999996e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0925  ABC transporter related  40.09 
 
 
256 aa  173  3.9999999999999995e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.560586  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  48.99 
 
 
282 aa  173  3.9999999999999995e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  40.56 
 
 
310 aa  172  5e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  33.33 
 
 
304 aa  173  5e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0102  ABC transporter related  43.05 
 
 
250 aa  172  6.999999999999999e-42  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.85955  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  38.59 
 
 
300 aa  172  7.999999999999999e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0612  ABC transporter related protein  39.73 
 
 
314 aa  172  7.999999999999999e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.787595  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1864  ABC transporter related  35.45 
 
 
303 aa  172  7.999999999999999e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.319064 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18350  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.87 
 
 
313 aa  172  9e-42  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  29.64 
 
 
312 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  35.42 
 
 
302 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0639  multidrug ABC transporter ATPase  35.6 
 
 
327 aa  171  1e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  34 
 
 
310 aa  171  2e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0104  ABC transporter related  36.84 
 
 
333 aa  171  2e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.233279 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1906  ABC transporter related protein  42.55 
 
 
306 aa  171  2e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4919  ABC transporter related protein  38.78 
 
 
302 aa  170  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0999062  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.42 
 
 
310 aa  170  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.317764  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2316  ABC transporter related  37.42 
 
 
307 aa  171  2e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3480  ABC transporter-like protein  37.25 
 
 
319 aa  171  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  48.48 
 
 
290 aa  170  3e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  29.64 
 
 
312 aa  170  3e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33070  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.32 
 
 
286 aa  170  3e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.468184  normal  0.320706 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2288  ABC transporter related  43.64 
 
 
304 aa  170  3e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  29.64 
 
 
312 aa  170  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  29.64 
 
 
312 aa  170  3e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1865  ABC transporter, ATP-binding protein  29.97 
 
 
312 aa  169  4e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.216814  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  29.64 
 
 
312 aa  169  4e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  29.32 
 
 
312 aa  170  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0393  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  36.15 
 
 
310 aa  169  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1452  ABC transporter related  35.06 
 
 
306 aa  170  4e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3802  ABC transporter related  37.76 
 
 
330 aa  169  5e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.550833  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  29.64 
 
 
312 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  29.64 
 
 
312 aa  169  6e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  34.23 
 
 
305 aa  169  6e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  35.45 
 
 
308 aa  169  6e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>