More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1077 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1077  ABC transporter related protein  100 
 
 		 309 aa  616  1e-175  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0807489  normal  0.0520068 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1895  ABC transporter related  56.83 
 
 		 343 aa  304  1.0000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.16 
 
 		 310 aa  251  1e-65  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.317764  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1585  ABC transporter related  48.37 
 
 		 321 aa  249  3e-65  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.719287  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5630  ABC transporter related protein  51.92 
 
 		 302 aa  244  9.999999999999999e-64  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.694537  normal  0.578056 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2960  ABC transporter related protein  46.86 
 
 		 314 aa  242  5e-63  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00870565  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3531  ABC transporter related protein  47.25 
 
 		 319 aa  239  2.9999999999999997e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03830  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.68 
 
 		 347 aa  228  9e-59  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.112396  normal  0.109015 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1677  ABC transporter, ATPase subunit  52.34 
 
 		 353 aa  226  3e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.42394 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0505  ABC transporter related protein  44.33 
 
 		 323 aa  221  1.9999999999999999e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0291  ABC-type multidrug transport system ATPase component  42.16 
 
 		 324 aa  211  2e-53  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4839  ABC transporter related protein  48.11 
 
 		 314 aa  210  2e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0814661  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5477  ABC transporter related protein  42.86 
 
 		 330 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0278  ABC transporter related  36.49 
 
 		 308 aa  192  8e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.833844  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2220  ABC transporter related protein  41.98 
 
 		 308 aa  191  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000054865  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  47.25 
 
 		 285 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5037  ABC transporter, ATP-binding protein  40.08 
 
 		 300 aa  181  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2680  ABC transporter related protein  47.86 
 
 		 297 aa  181  2e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5534  ABC transporter, ATP-binding protein  39.84 
 
 		 300 aa  181  2e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2609  ABC transporter related protein  40.79 
 
 		 303 aa  180  2.9999999999999997e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000416385  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2080  ABC transporter related  39.94 
 
 		 388 aa  180  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.669128 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  35.74 
 
 		 304 aa  179  4.999999999999999e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5447  ABC transporter, ATP-binding protein  39.69 
 
 		 300 aa  179  5.999999999999999e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  44.14 
 
 		 280 aa  179  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  45.61 
 
 		 301 aa  178  9e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2545  ABC transporter related  39.74 
 
 		 315 aa  178  9e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.107905  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5474  ABC transporter, ATP-binding protein  38.82 
 
 		 300 aa  178  1e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.960642  hitchhiker  0.00000000406318 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21980  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.63 
 
 		 304 aa  177  1e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.110747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5478  ABC transporter, ATP-binding protein  38.82 
 
 		 300 aa  177  2e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5600  ABC transporter ATP-binding protein  39.69 
 
 		 300 aa  177  3e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2965  ABC transporter related protein  47 
 
 		 313 aa  176  4e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5485  ABC transporter, ATP-binding protein  38.82 
 
 		 300 aa  176  5e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0910  ABC transporter-like protein  44.69 
 
 		 284 aa  175  8e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  47.03 
 
 		 301 aa  175  9e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5153  ABC transporter related  38.91 
 
 		 300 aa  175  9.999999999999999e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  38.72 
 
 		 319 aa  174  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29910  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  50.76 
 
 		 313 aa  174  9.999999999999999e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.880888  normal  0.697642 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5053  ABC transporter, ATP-binding protein  38.91 
 
 		 300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1989  ABC-type multidrug transport system ATPase componen  45.87 
 
 		 309 aa  174  2.9999999999999996e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  43.27 
 
 		 256 aa  173  3.9999999999999995e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  41.9 
 
 		 254 aa  172  5.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3874  ABC transporter-related protein  40.09 
 
 		 300 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.987197  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5203  ABC transporter ATP-binding protein  39.69 
 
 		 299 aa  172  9e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0187  ABC transporter related  39.13 
 
 		 299 aa  171  1e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.852326  normal  0.850223 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0095  ABC transporter related  38.43 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00000602484  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2730  ABC transporter-related protein  38.78 
 
 		 309 aa  171  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110102 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2398  ABC transporter related protein  44.93 
 
 		 300 aa  169  5e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.0000000000133291  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2251  ABC transporter related  37.41 
 
 		 308 aa  169  6e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000349445 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1027  ABC transporter related protein  46.02 
 
 		 317 aa  169  6e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.87943  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  38.57 
 
 		 301 aa  169  6e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  43.64 
 
 		 310 aa  169  6e-41  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1655  ABC transporter related  39.36 
 
 		 374 aa  169  7e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.334849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5991  ABC transporter, ATP-binding protein  38.85 
 
 		 302 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.171427  normal  0.144114 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  36.9 
 
 		 305 aa  167  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0609  ABC transporter related protein  44.24 
 
 		 301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  44.55 
 
 		 322 aa  167  2.9999999999999998e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2380  ABC transporter related protein  37.21 
 
 		 338 aa  166  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.719921  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  36.95 
 
 		 305 aa  166  5e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4004  ABC transporter related  46.19 
 
 		 282 aa  166  5e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0853449  hitchhiker  0.000219352 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  36.95 
 
 		 305 aa  166  5e-40  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  43.4 
 
 		 290 aa  165  6.9999999999999995e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3680  ABC transporter related  39.86 
 
 		 319 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.764168  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1974  ABC transporter-like protein  37.67 
 
 		 308 aa  165  8e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.495936 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2433  ABC transporter related  39.12 
 
 		 310 aa  165  8e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.555917  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2478  ABC transporter related  39.12 
 
 		 310 aa  165  8e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  41.41 
 
 		 300 aa  165  8e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  36.61 
 
 		 305 aa  165  9e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1267  ABC transporter-like protein  37.04 
 
 		 303 aa  164  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.684433 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0540  ABC transporter related  36.55 
 
 		 301 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  38.25 
 
 		 283 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5162  ABC transporter related  37.2 
 
 		 312 aa  164  2.0000000000000002e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.91236  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3171  ABC transporter related  48 
 
 		 294 aa  164  2.0000000000000002e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0428846 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2469  ABC transporter related  38.78 
 
 		 310 aa  163  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.182364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1355  ABC transporter related protein  41 
 
 		 299 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.79712  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3116  ABC transporter related  36.54 
 
 		 316 aa  162  5.0000000000000005e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.645942  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  42.06 
 
 		 741 aa  162  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1864  ABC transporter related  40.62 
 
 		 303 aa  162  6e-39  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.319064 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4025  ABC transporter related  46.12 
 
 		 320 aa  162  7e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.426784 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1173  ABC transporter related  37.25 
 
 		 306 aa  162  7e-39  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1138  ABC transporter related  33.55 
 
 		 311 aa  162  8.000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.129025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03054  ABC transporter ATP-binding protein  34.75 
 
 		 314 aa  161  1e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7343  ABC transporter related  46.15 
 
 		 284 aa  161  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991324 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0510  ABC transporter related  44.34 
 
 		 276 aa  161  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1717  ABC transporter, ATPase subunit  36.62 
 
 		 305 aa  161  1e-38  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0897  ABC transporter related  43.27 
 
 		 309 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3003  ABC transporter related  35.52 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000662652  decreased coverage  0.0000461867 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2512  ABC transporter related protein  41.18 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3253  ABC transporter-related protein  35.76 
 
 		 316 aa  161  2e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.458377  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11486  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  36.36 
 
 		 313 aa  160  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.576168  normal  0.635651 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2270  ABC transporter related  44.19 
 
 		 314 aa  161  2e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0194765  normal  0.0896073 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2744  ABC transporter related  35.14 
 
 		 309 aa  160  3e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3694  ABC transporter related  39.76 
 
 		 756 aa  160  3e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16220  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.92 
 
 		 323 aa  160  4e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.4304  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0672  ABC transporter related  44.21 
 
 		 289 aa  159  5e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0422494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1343  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.42 
 
 		 411 aa  159  6e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.557493  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3150  ABC transporter related  36.24 
 
 		 247 aa  159  6e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0885  ABC transporter related  40.65 
 
 		 309 aa  159  6e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.536039  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0748  ABC transporter related  36.45 
 
 		 318 aa  159  6e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.329889 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2085  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.13 
 
 		 318 aa  158  9e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.198089  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2887  ABC transporter related  41.78 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.310491  normal  0.0921794 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>