More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3076 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3076  ABC transporter related  100 
 
 
310 aa  624  1e-178  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.591298  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1736  nitrous oxide reductase maturation ATPase NosF  54.82 
 
 
304 aa  285  8e-76  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42445  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1426  ABC transporter for copper ATP-binding protein  50.33 
 
 
303 aa  284  1.0000000000000001e-75  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20180  NosF protein  54.85 
 
 
304 aa  281  7.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.423742  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3402  ABC transporter-related protein  48.4 
 
 
322 aa  279  4e-74  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00371017  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4734  copper ABC transporter, ATP-binding protein  49.67 
 
 
304 aa  272  6e-72  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2217  ABC transporter related  49.16 
 
 
327 aa  268  1e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1076  ABC transporter related  48.99 
 
 
308 aa  261  1e-68  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  46.03 
 
 
298 aa  246  3e-64  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2566  ABC transporter related  46.23 
 
 
310 aa  243  3e-63  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.2512  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  44.04 
 
 
303 aa  241  1e-62  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1392  ABC transporter ATPase  41.97 
 
 
318 aa  227  2e-58  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4217  ABC transporter related  45.45 
 
 
299 aa  224  1e-57  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.175008  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4448  ABC transporter related  40.85 
 
 
327 aa  223  3e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1057  ABC transporter related  44.44 
 
 
310 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  43.58 
 
 
301 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1136  ABC transporter related  44.44 
 
 
310 aa  221  9.999999999999999e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0444125  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6010  copper ABC transporter, ATP-binding protein NosF  42.33 
 
 
306 aa  221  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00601626  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0660  ABC transporter related  42.03 
 
 
313 aa  219  3e-56  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.946314  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0490  ABC transporter-related protein  41.64 
 
 
302 aa  218  7e-56  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2353  ABC transporter related  42 
 
 
301 aa  218  7e-56  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0501  ABC transporter-related protein  42.47 
 
 
300 aa  218  1e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3358  ABC transporter related  41.47 
 
 
344 aa  215  7e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348903  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1480  ABC transporter-related protein  42.35 
 
 
338 aa  214  1.9999999999999998e-54  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132633 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4469  ABC transporter related  41.25 
 
 
302 aa  214  1.9999999999999998e-54  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4914  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.61 
 
 
316 aa  213  2.9999999999999995e-54  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000429083 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4062  ABC transporter related  43.96 
 
 
318 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0487  ABC transporter related  41.08 
 
 
325 aa  213  4.9999999999999996e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4174  ABC transporter related  43.96 
 
 
318 aa  212  4.9999999999999996e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0253  copper ABC transporter, ATP-binding protein  41.69 
 
 
331 aa  210  2e-53  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0277  copper ABC transporter, ATP-binding protein  41.69 
 
 
316 aa  209  4e-53  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.122603  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0487  copper ABC transporter, ATP-binding protein  42.18 
 
 
332 aa  208  8e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3534  ABC transporter related  42.86 
 
 
348 aa  208  8e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0497  ABC transporter related  42.86 
 
 
348 aa  207  2e-52  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0511  ABC transporter related  41 
 
 
302 aa  207  3e-52  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3144  ABC transporter related  40.47 
 
 
301 aa  206  3e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0496  ABC transporter related  41.91 
 
 
348 aa  206  3e-52  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.630223  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0430  ABC transporter related  41.81 
 
 
301 aa  205  8e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0993  copper ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
304 aa  204  2e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193362  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2062  copper ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
309 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.947517  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2117  copper ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
304 aa  204  2e-51  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4344  ABC transporter related  40.73 
 
 
310 aa  202  7e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1371  copper ATP-binding ABC transporter protein  40.8 
 
 
314 aa  201  9.999999999999999e-51  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2257  putative copper-related ABC transport system, ATP-binding protein  40.2 
 
 
747 aa  200  3e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0356  ABC transporter-related protein  40.89 
 
 
309 aa  200  3e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3869  ABC transporter related  41.64 
 
 
345 aa  199  5e-50  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3994  ABC transporter related  41.3 
 
 
345 aa  198  9e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2323  copper ABC transporter, ATP-binding protein  40.2 
 
 
304 aa  196  4.0000000000000005e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  39.4 
 
 
305 aa  193  3e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  36.27 
 
 
303 aa  191  1e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  38.41 
 
 
318 aa  178  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  35 
 
 
305 aa  177  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  36.93 
 
 
310 aa  177  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  44.39 
 
 
318 aa  177  3e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1760  ABC transporter related  39.78 
 
 
292 aa  176  4e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  44.39 
 
 
318 aa  176  4e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3387  ABC transporter related  39.68 
 
 
323 aa  175  8e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  34.33 
 
 
309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  34.46 
 
 
300 aa  174  1.9999999999999998e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  35.62 
 
 
302 aa  172  7.999999999999999e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  35.97 
 
 
303 aa  171  1e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2643  ABC transporter related  42.86 
 
 
304 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  37.1 
 
 
304 aa  170  3e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0227  ABC transporter related protein  34.65 
 
 
304 aa  169  4e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  33.88 
 
 
316 aa  169  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  35.45 
 
 
300 aa  168  1e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  36.72 
 
 
301 aa  168  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  41.92 
 
 
300 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3749  ABC transporter related protein  42.86 
 
 
310 aa  167  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  35.95 
 
 
301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1485  ABC transporter related protein  43.69 
 
 
332 aa  166  4e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  34.81 
 
 
302 aa  166  5e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  33.22 
 
 
302 aa  166  5.9999999999999996e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  34.2 
 
 
309 aa  165  9e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1774  ABC transporter related protein  32.58 
 
 
304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  40 
 
 
250 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1717  ABC transporter related protein  35.06 
 
 
335 aa  164  3e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1082  ABC transporter related  34.98 
 
 
309 aa  163  3e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124615  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1811  ABC transporter related  35.91 
 
 
305 aa  163  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0460716  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2411  ABC transporter related  33.89 
 
 
299 aa  163  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0293991  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  35.16 
 
 
303 aa  163  3e-39  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2366  ABC transporter related  33.89 
 
 
299 aa  163  3e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  33.33 
 
 
308 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2228  ABC transporter related protein  35.79 
 
 
310 aa  162  5.0000000000000005e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0681  ABC transporter related  35.42 
 
 
339 aa  162  6e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249966  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  33.44 
 
 
337 aa  162  6e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2796  ABC transporter related  36.27 
 
 
326 aa  162  7e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2142  ABC-type transport system, ATPase component  41.83 
 
 
247 aa  161  1e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0133824  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  33.44 
 
 
316 aa  161  1e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  34.24 
 
 
316 aa  161  1e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  36.04 
 
 
301 aa  161  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  39.59 
 
 
318 aa  162  1e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  34.67 
 
 
298 aa  161  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1761  ABC transporter related  40.97 
 
 
350 aa  161  1e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.298772 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.52 
 
 
312 aa  160  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2644  ABC transporter related  35.6 
 
 
334 aa  160  3e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  33.86 
 
 
313 aa  159  5e-38  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1245  ABC transporter related protein  33.22 
 
 
313 aa  159  5e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  33.86 
 
 
313 aa  159  7e-38  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3411  ABC transporter related  42.53 
 
 
342 aa  159  7e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0395155  hitchhiker  0.000120901 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>