More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_1392 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007404  Tbd_1392  ABC transporter ATPase  100 
 
 
318 aa  636    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0660  ABC transporter related  75.47 
 
 
313 aa  484  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.946314  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  67.33 
 
 
303 aa  412  1e-114  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1136  ABC transporter related  65.52 
 
 
310 aa  402  1e-111  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0444125  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1057  ABC transporter related  65.52 
 
 
310 aa  402  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1480  ABC transporter-related protein  60.57 
 
 
338 aa  381  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132633 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4914  putative ABC transporter ATP-binding protein  57.68 
 
 
316 aa  350  1e-95  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000429083 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4062  ABC transporter related  62.29 
 
 
318 aa  345  8e-94  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4174  ABC transporter related  62.29 
 
 
318 aa  345  8e-94  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1371  copper ATP-binding ABC transporter protein  58.88 
 
 
314 aa  335  7e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2323  copper ABC transporter, ATP-binding protein  58.56 
 
 
304 aa  322  5e-87  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0993  copper ABC transporter, ATP-binding protein  58.56 
 
 
304 aa  317  1e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193362  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2062  copper ABC transporter, ATP-binding protein  58.56 
 
 
309 aa  317  1e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.947517  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2117  copper ABC transporter, ATP-binding protein  58.56 
 
 
304 aa  317  1e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2257  putative copper-related ABC transport system, ATP-binding protein  58.62 
 
 
747 aa  316  3e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  45.17 
 
 
298 aa  236  3e-61  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1076  ABC transporter related  45.18 
 
 
308 aa  233  2.0000000000000002e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2566  ABC transporter related  45.79 
 
 
310 aa  230  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.2512  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  39.06 
 
 
303 aa  227  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3076  ABC transporter related  41.97 
 
 
310 aa  227  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.591298  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1426  ABC transporter for copper ATP-binding protein  39.13 
 
 
303 aa  226  4e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3144  ABC transporter related  46.39 
 
 
301 aa  218  1e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3402  ABC transporter-related protein  45.92 
 
 
322 aa  216  5e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00371017  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6010  copper ABC transporter, ATP-binding protein NosF  44.71 
 
 
306 aa  215  7e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00601626  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  44.67 
 
 
301 aa  214  9.999999999999999e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0430  ABC transporter related  43.75 
 
 
301 aa  214  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4217  ABC transporter related  41.3 
 
 
299 aa  214  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.175008  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4734  copper ABC transporter, ATP-binding protein  39.46 
 
 
304 aa  213  2.9999999999999995e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2217  ABC transporter related  43.03 
 
 
327 aa  213  2.9999999999999995e-54  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0253  copper ABC transporter, ATP-binding protein  41.41 
 
 
331 aa  213  2.9999999999999995e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0277  copper ABC transporter, ATP-binding protein  41.41 
 
 
316 aa  213  4.9999999999999996e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.122603  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  39.14 
 
 
316 aa  212  5.999999999999999e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4344  ABC transporter related  40.79 
 
 
310 aa  211  1e-53  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3358  ABC transporter related  38.91 
 
 
344 aa  210  3e-53  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348903  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20180  NosF protein  45.07 
 
 
304 aa  206  4e-52  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.423742  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2353  ABC transporter related  44.67 
 
 
301 aa  205  9e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1736  nitrous oxide reductase maturation ATPase NosF  45.1 
 
 
304 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42445  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0487  copper ABC transporter, ATP-binding protein  36.93 
 
 
332 aa  196  4.0000000000000005e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  37.22 
 
 
337 aa  194  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  36.75 
 
 
316 aa  192  6e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0497  ABC transporter related  36.33 
 
 
348 aa  189  4e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3534  ABC transporter related  36.18 
 
 
348 aa  189  7e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4469  ABC transporter related  38.93 
 
 
302 aa  188  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0496  ABC transporter related  35.67 
 
 
348 aa  188  1e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.630223  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4448  ABC transporter related  38.46 
 
 
327 aa  188  1e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  37.95 
 
 
309 aa  187  2e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  35.81 
 
 
318 aa  186  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  40.36 
 
 
315 aa  185  7e-46  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0487  ABC transporter related  36.49 
 
 
325 aa  185  1.0000000000000001e-45  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2969  ABC transporter related protein  38.72 
 
 
373 aa  184  1.0000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.297443  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3869  ABC transporter related  42.08 
 
 
345 aa  184  2.0000000000000003e-45  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3994  ABC transporter related  38.39 
 
 
345 aa  183  3e-45  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0501  ABC transporter-related protein  38.05 
 
 
300 aa  183  3e-45  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2549  ABC transporter related  33.97 
 
 
340 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  34.82 
 
 
336 aa  182  6e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0356  ABC transporter-related protein  36.18 
 
 
309 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  36.43 
 
 
301 aa  181  1e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0511  ABC transporter related  38.91 
 
 
302 aa  181  2e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  33.11 
 
 
308 aa  181  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  34.73 
 
 
309 aa  178  9e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  37.33 
 
 
303 aa  178  1e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  36.12 
 
 
310 aa  178  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  37.88 
 
 
305 aa  177  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1760  ABC transporter related  47.17 
 
 
292 aa  177  3e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  42.37 
 
 
311 aa  176  4e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2796  ABC transporter related  32.92 
 
 
326 aa  175  9e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1082  ABC transporter related  37.04 
 
 
309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124615  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  36.79 
 
 
309 aa  173  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  45.89 
 
 
318 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  37.58 
 
 
312 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1257  ABC transporter related  35 
 
 
330 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  35.29 
 
 
305 aa  173  3.9999999999999995e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4579  ABC transporter related  35.1 
 
 
300 aa  172  5.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146186  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1706  ABC transporter related  31.44 
 
 
311 aa  172  6.999999999999999e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1526  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.13 
 
 
330 aa  172  9e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  hitchhiker  0.00601366  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  38.31 
 
 
305 aa  171  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  37.41 
 
 
316 aa  171  1e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0490  ABC transporter-related protein  35.64 
 
 
302 aa  171  1e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2644  ABC transporter related  36.27 
 
 
334 aa  170  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0454  ABC transporter related protein  40.18 
 
 
305 aa  171  2e-41  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3749  ABC transporter related protein  37.6 
 
 
310 aa  171  2e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1811  ABC transporter related  36.6 
 
 
305 aa  170  3e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0460716  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  44.44 
 
 
318 aa  169  6e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  43.48 
 
 
318 aa  169  7e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4530  ABC transporter related  43.6 
 
 
242 aa  169  7e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.286786  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18350  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  35.31 
 
 
313 aa  168  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2643  ABC transporter related  33.78 
 
 
304 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02380  ABC transporter related  33.89 
 
 
316 aa  168  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.31 
 
 
321 aa  168  1e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2485  ABC transporter related protein  37.58 
 
 
304 aa  168  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1475  ABC transporter, ATP-binding protein  34.3 
 
 
300 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1274  ABC transporter ATP-binding protein  33.98 
 
 
300 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1246  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  33.98 
 
 
300 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0565117  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0919  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.19 
 
 
342 aa  166  2.9999999999999998e-40  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1774  ABC transporter related protein  33.44 
 
 
304 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3870  ABC transporter related  34.41 
 
 
304 aa  166  4e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1248  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  34.3 
 
 
300 aa  166  4e-40  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.330688  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  40.72 
 
 
308 aa  166  5e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3642  ABC transporter related protein  35 
 
 
310 aa  166  5e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1717  ABC transporter related protein  35.02 
 
 
335 aa  166  6.9999999999999995e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>