More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_0490 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_0490  ABC transporter-related protein  100 
 
 		 302 aa  614  1e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0487  ABC transporter related  69.83 
 
 		 325 aa  424  1e-118  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4469  ABC transporter related  72.32 
 
 		 302 aa  422  1e-117  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4448  ABC transporter related  56.55 
 
 		 327 aa  328  8e-89  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0501  ABC transporter-related protein  58.74 
 
 		 300 aa  327  1.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0511  ABC transporter related  56.85 
 
 		 302 aa  318  7e-86  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0356  ABC transporter-related protein  50.52 
 
 		 309 aa  300  1e-80  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3534  ABC transporter related  46.56 
 
 		 348 aa  273  4.0000000000000004e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0497  ABC transporter related  46.89 
 
 		 348 aa  272  6e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0496  ABC transporter related  47.16 
 
 		 348 aa  271  9e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.630223  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0487  copper ABC transporter, ATP-binding protein  46.98 
 
 		 332 aa  271  1e-71  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3358  ABC transporter related  47.46 
 
 		 344 aa  270  2e-71  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348903  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3994  ABC transporter related  45.45 
 
 		 345 aa  254  2.0000000000000002e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3869  ABC transporter related  45.67 
 
 		 345 aa  252  6e-66  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3402  ABC transporter-related protein  44.56 
 
 		 322 aa  241  7e-63  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00371017  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4734  copper ABC transporter, ATP-binding protein  43.34 
 
 		 304 aa  241  2e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1426  ABC transporter for copper ATP-binding protein  40 
 
 		 303 aa  225  5.0000000000000005e-58  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2217  ABC transporter related  41.94 
 
 		 327 aa  222  4.9999999999999996e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1076  ABC transporter related  40.41 
 
 		 308 aa  218  7e-56  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3076  ABC transporter related  41.64 
 
 		 310 aa  218  7e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.591298  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20180  NosF protein  42.66 
 
 		 304 aa  217  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.423742  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1736  nitrous oxide reductase maturation ATPase NosF  41.41 
 
 		 304 aa  215  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.42445  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2566  ABC transporter related  41.44 
 
 		 310 aa  209  4e-53  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.2512  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3144  ABC transporter related  38.11 
 
 		 301 aa  204  1e-51  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2353  ABC transporter related  38.03 
 
 		 301 aa  200  3e-50  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6010  copper ABC transporter, ATP-binding protein NosF  42.41 
 
 		 306 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  decreased coverage  0.00601626  normal  0.07018 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0430  ABC transporter related  36.71 
 
 		 301 aa  193  3e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4344  ABC transporter related  41.52 
 
 		 310 aa  192  4e-48  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0253  copper ABC transporter, ATP-binding protein  35.86 
 
 		 331 aa  191  9e-48  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0277  copper ABC transporter, ATP-binding protein  35.86 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.122603  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  37.98 
 
 		 301 aa  189  5e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  41.52 
 
 		 316 aa  186  4e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0660  ABC transporter related  37.5 
 
 		 313 aa  186  6e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.946314  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  35.76 
 
 		 303 aa  183  3e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  37.5 
 
 		 303 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  35.54 
 
 		 298 aa  182  7e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2323  copper ABC transporter, ATP-binding protein  35.49 
 
 		 304 aa  181  1e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2062  copper ABC transporter, ATP-binding protein  35.45 
 
 		 309 aa  181  1e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.947517  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0993  copper ABC transporter, ATP-binding protein  35.84 
 
 		 304 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193362  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2117  copper ABC transporter, ATP-binding protein  35.84 
 
 		 304 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2257  putative copper-related ABC transport system, ATP-binding protein  35.84 
 
 		 747 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4217  ABC transporter related  34.72 
 
 		 299 aa  178  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.175008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4174  ABC transporter related  34.21 
 
 		 318 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4062  ABC transporter related  34.21 
 
 		 318 aa  177  1e-43  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1057  ABC transporter related  34.46 
 
 		 310 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1136  ABC transporter related  34.46 
 
 		 310 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0444125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  37.95 
 
 		 337 aa  172  5.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1392  ABC transporter ATPase  35.64 
 
 		 318 aa  171  1e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1480  ABC transporter-related protein  33.33 
 
 		 338 aa  171  2e-41  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132633 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4914  putative ABC transporter ATP-binding protein  32.48 
 
 		 316 aa  170  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000429083 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  32.78 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  32.79 
 
 		 316 aa  167  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1371  copper ATP-binding ABC transporter protein  32.79 
 
 		 314 aa  162  8.000000000000001e-39  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  32.09 
 
 		 309 aa  161  1e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  40.72 
 
 		 318 aa  160  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  40.27 
 
 		 318 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  41.18 
 
 		 318 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  32.99 
 
 		 305 aa  158  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  38.53 
 
 		 247 aa  158  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3159  ABC transporter related  37.73 
 
 		 259 aa  156  4e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6528  ABC transporter related  36.07 
 
 		 897 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0392546  normal  0.0789085 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1021  ABC transporter related  39.25 
 
 		 237 aa  154  2e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00128788 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1888  ABC transporter related  36.16 
 
 		 249 aa  154  2e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.289771  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0448  multidrug ABC transporter  31.23 
 
 		 338 aa  153  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.380616  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.92 
 
 		 312 aa  154  2.9999999999999998e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  35.89 
 
 		 250 aa  153  4e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3123  ABC transporter related  38.18 
 
 		 313 aa  153  4e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.546098  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  38.63 
 
 		 250 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04731  putative multidrug efflux ABC transporter  32.49 
 
 		 338 aa  152  7e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3287  ABC transporter related protein  35.8 
 
 		 261 aa  151  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3435  ABC transporter-like protein  38.05 
 
 		 295 aa  151  1e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05041  putative multidrug efflux ABC transporter  31.55 
 
 		 338 aa  151  1e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1419  ABC transporter related protein  38.53 
 
 		 247 aa  151  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4674  ABC transporter related protein  39.91 
 
 		 237 aa  151  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330871 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  36.11 
 
 		 314 aa  150  2e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0089  ABC transporter related  38.79 
 
 		 237 aa  150  2e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.842138  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  33.18 
 
 		 312 aa  150  2e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  33.18 
 
 		 312 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  33.18 
 
 		 312 aa  150  3e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  35.45 
 
 		 279 aa  150  3e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  33.18 
 
 		 312 aa  150  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  33.18 
 
 		 312 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1560  ABC transporter related  38.57 
 
 		 344 aa  149  4e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0503147  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05111  putative multidrug efflux ABC transporter  31.55 
 
 		 338 aa  149  4e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  36.77 
 
 		 257 aa  149  5e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  32.73 
 
 		 312 aa  149  5e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  38.57 
 
 		 310 aa  149  7e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  37.23 
 
 		 311 aa  149  7e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0681  ABC transporter related  41.54 
 
 		 339 aa  149  7e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249966  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  33.67 
 
 		 301 aa  149  7e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  32.73 
 
 		 312 aa  149  8e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1191  ABC transporter related protein  32.55 
 
 		 333 aa  148  8e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  32.73 
 
 		 312 aa  149  8e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2228  ABC transporter related protein  32.44 
 
 		 310 aa  148  9e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2050  ABC transporter related  41.67 
 
 		 236 aa  148  9e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.492019  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  32.73 
 
 		 312 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  36.53 
 
 		 308 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  35.62 
 
 		 356 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0554  ABC transporter related  31.91 
 
 		 305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.31573  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  36.02 
 
 		 327 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>