More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2050 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2050  ABC transporter related  100 
 
 		 236 aa  473  1e-132  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.492019  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0682  ABC transporter related  57.83 
 
 		 231 aa  277  1e-73  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3330  ABC transporter related  55.65 
 
 		 231 aa  258  5.0000000000000005e-68  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.237178  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5321  ABC transporter related  54.31 
 
 		 234 aa  239  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.632986 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3361  putative ABC transporter ATP-binding protein  51.72 
 
 		 239 aa  237  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836865  normal  0.481905 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3610  ABC transporter ATP-binding protein  47.62 
 
 		 249 aa  194  7e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000141343 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01818  ABC transporter ATP-binding protein  47.37 
 
 		 245 aa  193  2e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000012979  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04085  ABC transporter ATP-binding protein  47.42 
 
 		 240 aa  192  3e-48  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4461  ABC transporter related  46.05 
 
 		 273 aa  186  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0398264 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3773  ABC transporter related  48.97 
 
 		 245 aa  184  8e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01807  ABC transporter, ATP-binding protein  46.23 
 
 		 240 aa  181  8.000000000000001e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  40.08 
 
 		 303 aa  178  7e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  37.5 
 
 		 315 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  42.25 
 
 		 316 aa  169  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  42.65 
 
 		 316 aa  169  4e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  40.19 
 
 		 303 aa  169  5e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  39.81 
 
 		 301 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  41.04 
 
 		 318 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  40.28 
 
 		 305 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  40.28 
 
 		 337 aa  162  4.0000000000000004e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.92 
 
 		 317 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  38.08 
 
 		 251 aa  159  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2549  ABC transporter related  38.16 
 
 		 340 aa  158  6e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0522  ABC transporter related  40 
 
 		 287 aa  158  7e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000861338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  41.51 
 
 		 303 aa  157  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  36.49 
 
 		 309 aa  156  2e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  37.95 
 
 		 315 aa  157  2e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.1 
 
 		 312 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0660  ABC transporter related  42.52 
 
 		 313 aa  156  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.946314  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3358  ABC transporter related  42.64 
 
 		 344 aa  155  4e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348903  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2323  copper ABC transporter, ATP-binding protein  42.45 
 
 		 304 aa  155  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2062  copper ABC transporter, ATP-binding protein  42.45 
 
 		 309 aa  155  6e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.947517  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0993  copper ABC transporter, ATP-binding protein  42.45 
 
 		 304 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193362  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2117  copper ABC transporter, ATP-binding protein  42.45 
 
 		 304 aa  155  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  37.91 
 
 		 309 aa  154  1e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  34.78 
 
 		 312 aa  154  1e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  39.23 
 
 		 310 aa  154  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  35.98 
 
 		 243 aa  154  2e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1392  ABC transporter ATPase  42.45 
 
 		 318 aa  154  2e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0496  ABC transporter related  39.09 
 
 		 348 aa  154  2e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.630223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3534  ABC transporter related  39.09 
 
 		 348 aa  153  2e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0497  ABC transporter related  39.09 
 
 		 348 aa  153  2e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1033  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.6 
 
 		 317 aa  153  2.9999999999999998e-36  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.100021 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  35.98 
 
 		 243 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0501  ABC transporter-related protein  44.5 
 
 		 300 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  38.68 
 
 		 314 aa  152  4e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2257  putative copper-related ABC transport system, ATP-binding protein  42.92 
 
 		 747 aa  152  5e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4530  ABC transporter related  41.78 
 
 		 242 aa  151  7e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.286786  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2217  ABC transporter related  41.45 
 
 		 327 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0395  ABC transporter-related protein  36.19 
 
 		 295 aa  150  1e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.95 
 
 		 316 aa  151  1e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  39.71 
 
 		 305 aa  150  2e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  42.4 
 
 		 344 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  35.86 
 
 		 298 aa  149  3e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  40 
 
 		 303 aa  149  3e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4248  ABC transporter related protein  41.83 
 
 		 390 aa  149  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1956  ABC transporter related protein  37.71 
 
 		 240 aa  149  4e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00584741  normal  0.468336 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0487  copper ABC transporter, ATP-binding protein  42.41 
 
 		 332 aa  149  4e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3189  ABC transporter related protein  38.94 
 
 		 316 aa  149  4e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2014  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.58 
 
 		 317 aa  149  5e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000225656  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  38.57 
 
 		 314 aa  148  6e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0490  ABC transporter-related protein  41.67 
 
 		 302 aa  148  6e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3123  ABC transporter related  39.91 
 
 		 313 aa  148  6e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.546098  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0487  ABC transporter related  45.76 
 
 		 325 aa  148  7e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  40.64 
 
 		 311 aa  148  8e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3642  ABC transporter related protein  36.36 
 
 		 310 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0569  ABC transporter related  33.33 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  43.14 
 
 		 316 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04730  ABC transporter related  36.24 
 
 		 306 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000816769  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  34.76 
 
 		 321 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0080  ABC transporter related  36.19 
 
 		 305 aa  146  2.0000000000000003e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1245  ABC transporter related protein  40.74 
 
 		 313 aa  147  2.0000000000000003e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_125  ABC transporter, type 2, ATP-binding protein  38.68 
 
 		 288 aa  146  2.0000000000000003e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  36.97 
 
 		 317 aa  146  3e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0256  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  35.45 
 
 		 309 aa  146  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4344  ABC transporter related  44.22 
 
 		 310 aa  146  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1419  ABC transporter related protein  40.28 
 
 		 247 aa  146  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  35.91 
 
 		 309 aa  146  3e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1339  ABC transporter, ATP-binding protein  37.85 
 
 		 306 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0271  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  36.97 
 
 		 309 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0285  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  36.97 
 
 		 309 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3279  ABC transporter related  32.92 
 
 		 297 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00236807  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0315  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  36.97 
 
 		 309 aa  145  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  40.78 
 
 		 332 aa  145  4.0000000000000006e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3402  ABC transporter-related protein  38.86 
 
 		 322 aa  145  4.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00371017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  34.29 
 
 		 253 aa  145  5e-34  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4579  ABC transporter related  34.12 
 
 		 300 aa  145  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146186  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  35.07 
 
 		 306 aa  145  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1480  ABC transporter-related protein  39.72 
 
 		 338 aa  145  7.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132633 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1400  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.72 
 
 		 334 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  36.97 
 
 		 315 aa  145  7.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0252  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.11 
 
 		 317 aa  144  9e-34  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.297756 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  41.9 
 
 		 298 aa  144  1e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3388  ABC transporter ATP-binding protein  32.5 
 
 		 297 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.955224  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2922  ABC transporter related protein  43.33 
 
 		 304 aa  144  1e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3300  ABC transporter, ATP-binding protein  32.5 
 
 		 297 aa  144  1e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000068812  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  39.05 
 
 		 312 aa  144  1e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3653  ABC transporter ATP-binding protein  32.5 
 
 		 297 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.169658  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  39.34 
 
 		 307 aa  144  1e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  35.71 
 
 		 295 aa  144  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>