More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3773 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3773  ABC transporter related  100 
 
 		 245 aa  501  1e-141  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01807  ABC transporter, ATP-binding protein  59.41 
 
 		 240 aa  280  1e-74  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3610  ABC transporter ATP-binding protein  58.87 
 
 		 249 aa  275  4e-73  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000141343 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04085  ABC transporter ATP-binding protein  47.62 
 
 		 240 aa  217  1e-55  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4461  ABC transporter related  48.72 
 
 		 273 aa  210  2e-53  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0398264 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3330  ABC transporter related  42.86 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.237178  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0682  ABC transporter related  43.54 
 
 		 231 aa  187  2e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5321  ABC transporter related  43.72 
 
 		 234 aa  186  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.632986 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01818  ABC transporter ATP-binding protein  44.21 
 
 		 245 aa  185  4e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000012979  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2050  ABC transporter related  48.97 
 
 		 236 aa  184  9e-46  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.492019  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  39.25 
 
 		 316 aa  159  4e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  42.18 
 
 		 332 aa  158  7e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  38.07 
 
 		 318 aa  156  3e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  37.38 
 
 		 337 aa  153  2e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3361  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.68 
 
 		 239 aa  154  2e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836865  normal  0.481905 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  37.96 
 
 		 316 aa  152  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  37.38 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  41.24 
 
 		 303 aa  149  3e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3642  ABC transporter related protein  38.28 
 
 		 310 aa  147  1.0000000000000001e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  36.87 
 
 		 303 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3402  ABC transporter-related protein  37.61 
 
 		 322 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00371017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  38.79 
 
 		 302 aa  146  4.0000000000000006e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  37.25 
 
 		 356 aa  145  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  32.26 
 
 		 304 aa  144  9e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  37.44 
 
 		 310 aa  143  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  38.36 
 
 		 243 aa  144  2e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  38.66 
 
 		 310 aa  144  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19730  ABC transporter related  37.33 
 
 		 252 aa  143  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  39.8 
 
 		 318 aa  143  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  37.38 
 
 		 309 aa  143  3e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1642  ABC transporter related protein  36.97 
 
 		 323 aa  142  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4734  copper ABC transporter, ATP-binding protein  40.4 
 
 		 304 aa  141  8e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1076  ABC transporter related  39.49 
 
 		 308 aa  141  9e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  37.44 
 
 		 243 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3189  ABC transporter related protein  36.6 
 
 		 316 aa  141  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  35.32 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2338  ABC transporter-like protein  35.14 
 
 		 305 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  38.46 
 
 		 316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  36.15 
 
 		 303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  33.95 
 
 		 309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2969  ABC transporter related protein  37.44 
 
 		 373 aa  140  1.9999999999999998e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.297443  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1051  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.56 
 
 		 302 aa  140  1.9999999999999998e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0256  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  35.65 
 
 		 309 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2217  ABC transporter related  38.78 
 
 		 327 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0983  ABC heme exporter, ATPase subunit  38 
 
 		 266 aa  139  6e-32  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  35.55 
 
 		 307 aa  138  7e-32  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1627  ABC transporter related  38.25 
 
 		 252 aa  137  1e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.868529  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4354  ABC transporter related  36.63 
 
 		 249 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.294486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  35.19 
 
 		 309 aa  137  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2278  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.12 
 
 		 256 aa  138  1e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0405  ABC transporter related protein  35.85 
 
 		 346 aa  137  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1661  ABC transporter related  35.65 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0121  ABC transporter related  39.07 
 
 		 270 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1426  ABC transporter for copper ATP-binding protein  40.59 
 
 		 303 aa  136  3.0000000000000003e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0490  ABC transporter-related protein  40.1 
 
 		 302 aa  136  3.0000000000000003e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4617  ABC transporter related  37.56 
 
 		 314 aa  136  3.0000000000000003e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1392  ABC transporter ATPase  39.06 
 
 		 318 aa  136  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  36.62 
 
 		 308 aa  135  4e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3123  ABC transporter related  38.53 
 
 		 313 aa  135  4e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.546098  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  35.81 
 
 		 279 aa  136  4e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3084  ABC transporter, ATP-binding protein  37.11 
 
 		 308 aa  135  5e-31  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5000  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  35.19 
 
 		 309 aa  135  5e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0314  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  35.19 
 
 		 309 aa  135  5e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3749  ABC transporter related protein  38.07 
 
 		 310 aa  135  6.0000000000000005e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2644  ABC transporter related  37.09 
 
 		 334 aa  135  7.000000000000001e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  35.78 
 
 		 312 aa  135  8e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03078  sodium ABC exporter ATP-binding protein  34.39 
 
 		 273 aa  134  9e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.403818  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2483  ABC transporter related  35.75 
 
 		 592 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2862  ABC transporter, ATP-binding protein  35.75 
 
 		 592 aa  134  9.999999999999999e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  35.2 
 
 		 309 aa  134  9.999999999999999e-31  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.74 
 
 		 299 aa  134  9.999999999999999e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1427  ABC transporter related  34.91 
 
 		 332 aa  134  9.999999999999999e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  36.92 
 
 		 339 aa  134  9.999999999999999e-31  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  37.44 
 
 		 301 aa  134  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2709  ABC transporter related  34.55 
 
 		 298 aa  134  9.999999999999999e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.0350953 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.77 
 
 		 321 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  37.06 
 
 		 303 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0660  ABC transporter related  37.11 
 
 		 313 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.946314  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  33.8 
 
 		 300 aa  133  1.9999999999999998e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  34.85 
 
 		 310 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2566  ABC transporter related  40.51 
 
 		 310 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.2512  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  36.41 
 
 		 320 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1005  ABC transporter related  37.07 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00810555  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1400  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.76 
 
 		 334 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0271  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  37.06 
 
 		 309 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3468  ABC transporter, ATP-binding protein  36.15 
 
 		 253 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000910882  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0285  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  37.06 
 
 		 309 aa  133  3e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  38.53 
 
 		 298 aa  133  3e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  34.86 
 
 		 259 aa  133  3e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3387  ABC transporter related  38.19 
 
 		 323 aa  133  3e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0315  putative bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  37.06 
 
 		 309 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0454  ABC transporter related protein  34.63 
 
 		 305 aa  132  3.9999999999999996e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  35.71 
 
 		 250 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4579  ABC transporter related  33.65 
 
 		 300 aa  132  3.9999999999999996e-30  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146186  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1790  ABC transporter related  34.56 
 
 		 316 aa  132  3.9999999999999996e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.154782 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3812  putative bacteriocin ABC transporter, ATP-binding protein  34.45 
 
 		 234 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0439  ABC transporter related  36.08 
 
 		 283 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0541  ABC transporter related protein  38.97 
 
 		 265 aa  132  5e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4530  ABC transporter related  37.62 
 
 		 242 aa  132  5e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.286786  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1761  ABC transporter related  34.02 
 
 		 350 aa  132  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.298772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>