More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_5321 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_5321  ABC transporter related  100 
 
 		 234 aa  482  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.632986 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3330  ABC transporter related  61.57 
 
 		 231 aa  289  3e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.237178  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0682  ABC transporter related  58.52 
 
 		 231 aa  286  2.9999999999999996e-76  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3361  putative ABC transporter ATP-binding protein  56.22 
 
 		 239 aa  264  8e-70  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836865  normal  0.481905 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2050  ABC transporter related  54.31 
 
 		 236 aa  239  2e-62  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.492019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01818  ABC transporter ATP-binding protein  51.52 
 
 		 245 aa  213  1.9999999999999998e-54  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000012979  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4461  ABC transporter related  46.7 
 
 		 273 aa  202  5e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0398264 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3610  ABC transporter ATP-binding protein  44.44 
 
 		 249 aa  191  7e-48  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000141343 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3773  ABC transporter related  43.72 
 
 		 245 aa  186  2e-46  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01807  ABC transporter, ATP-binding protein  44.86 
 
 		 240 aa  184  7e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04085  ABC transporter ATP-binding protein  47.24 
 
 		 240 aa  184  8e-46  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  42.58 
 
 		 318 aa  171  5.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  39.3 
 
 		 316 aa  169  3e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  39.21 
 
 		 316 aa  167  9e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  37.55 
 
 		 309 aa  166  4e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  41.78 
 
 		 247 aa  165  6.9999999999999995e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  39.81 
 
 		 337 aa  165  6.9999999999999995e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  39.51 
 
 		 318 aa  163  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1419  ABC transporter related protein  42.03 
 
 		 247 aa  162  3e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  34.93 
 
 		 309 aa  162  3e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  39.91 
 
 		 305 aa  161  7e-39  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2549  ABC transporter related  37.89 
 
 		 340 aa  161  9e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1559  ABC transporter related  41.31 
 
 		 299 aa  161  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0776966  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2643  ABC transporter related  40.09 
 
 		 304 aa  159  4e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  38.5 
 
 		 301 aa  159  4e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  37.28 
 
 		 315 aa  158  5e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2399  ABC transporter, ATPase subunit  40.85 
 
 		 299 aa  158  8e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.196934  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  39.48 
 
 		 250 aa  158  9e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  38.21 
 
 		 304 aa  157  1e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  40.57 
 
 		 303 aa  157  1e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  39.44 
 
 		 300 aa  157  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  38.83 
 
 		 310 aa  156  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1082  ABC transporter related  39.32 
 
 		 309 aa  156  3e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0353  ABC transporter related  38.86 
 
 		 303 aa  155  4e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  38.92 
 
 		 303 aa  155  4e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1790  ABC transporter related  39.44 
 
 		 316 aa  155  6e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.154782 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  38.01 
 
 		 307 aa  155  6e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  39.61 
 
 		 332 aa  155  7e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0247  ABC transporter related  39.53 
 
 		 299 aa  155  7e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.702234  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0405  ABC transporter related protein  38.83 
 
 		 346 aa  155  8e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  38.14 
 
 		 250 aa  154  1e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  37.26 
 
 		 309 aa  154  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  36.4 
 
 		 298 aa  153  2e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  42.31 
 
 		 314 aa  153  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4579  ABC transporter related  38.39 
 
 		 300 aa  153  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146186  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  37.85 
 
 		 303 aa  153  2e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1392  ABC transporter ATPase  42.58 
 
 		 318 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  35.47 
 
 		 302 aa  152  4e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4530  ABC transporter related  40.34 
 
 		 242 aa  152  5e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.286786  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3189  ABC transporter related protein  38.39 
 
 		 316 aa  152  5e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.26 
 
 		 317 aa  152  5e-36  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  35.38 
 
 		 308 aa  151  7e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1642  ABC transporter related protein  38.57 
 
 		 323 aa  151  7e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1464  ABC transporter-related protein  39.91 
 
 		 299 aa  151  8.999999999999999e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  38.1 
 
 		 259 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  39.61 
 
 		 312 aa  150  1e-35  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  39.61 
 
 		 300 aa  150  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  38.94 
 
 		 301 aa  150  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3201  ABC transporter-like protein  42.25 
 
 		 309 aa  150  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  36.71 
 
 		 257 aa  150  2e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  37.38 
 
 		 316 aa  150  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  39.73 
 
 		 245 aa  150  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2014  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.26 
 
 		 317 aa  150  2e-35  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000225656  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  39.65 
 
 		 322 aa  149  3e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  39.22 
 
 		 316 aa  149  5e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3642  ABC transporter related protein  37.38 
 
 		 310 aa  148  6e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  39.15 
 
 		 309 aa  148  7e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  42.45 
 
 		 298 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1526  ABC transporter related protein  36.99 
 
 		 305 aa  147  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.06 
 
 		 312 aa  147  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1658  ABC transporter related  39.8 
 
 		 303 aa  147  1.0000000000000001e-34  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0154883  decreased coverage  0.000224831 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1627  ABC transporter related  38.68 
 
 		 252 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.868529  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  35.62 
 
 		 327 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1033  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.26 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.100021 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3076  ABC transporter related  41.79 
 
 		 310 aa  147  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.591298  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06690  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.82 
 
 		 317 aa  147  2.0000000000000003e-34  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  41.63 
 
 		 312 aa  146  3e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0114  ABC transporter related  38.21 
 
 		 270 aa  146  3e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1811  ABC transporter related  39.3 
 
 		 305 aa  146  3e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0460716  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  40.78 
 
 		 313 aa  145  4.0000000000000006e-34  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  36.67 
 
 		 305 aa  145  4.0000000000000006e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3735  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.2 
 
 		 446 aa  145  4.0000000000000006e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  36.55 
 
 		 279 aa  145  4.0000000000000006e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1891  ABC transporter related  36.87 
 
 		 320 aa  145  4.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572686  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5524  ABC transporter related protein  42.44 
 
 		 304 aa  145  5e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1103  ABC transporter related  38.03 
 
 		 320 aa  145  5e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0391915  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.38 
 
 		 279 aa  145  5e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  42.31 
 
 		 313 aa  145  5e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3364  ABC transporter related protein  35.15 
 
 		 266 aa  145  5e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2206  ABC transporter related  40 
 
 		 307 aa  145  6e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758752  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2252  ABC transporter related  40 
 
 		 307 aa  145  6e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.951966  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0134  ABC transporter related  36.32 
 
 		 250 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0136  ABC transporter related  36.32 
 
 		 250 aa  145  7.0000000000000006e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1669  ABC transporter related  39.25 
 
 		 338 aa  144  8.000000000000001e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.700006  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.74 
 
 		 305 aa  145  8.000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.39 
 
 		 316 aa  144  8.000000000000001e-34  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4248  ABC transporter related protein  39.38 
 
 		 390 aa  144  9e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1774  ABC transporter related protein  33.33 
 
 		 304 aa  144  9e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1080  ABC transporter-related protein  38.42 
 
 		 300 aa  144  9e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0740  ABC transporter related  32.48 
 
 		 247 aa  144  9e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0259888  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>