More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3610 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3610  ABC transporter ATP-binding protein  100 
 
 		 249 aa  504  9.999999999999999e-143  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000141343 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3773  ABC transporter related  58.87 
 
 		 245 aa  275  4e-73  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01807  ABC transporter, ATP-binding protein  50.64 
 
 		 240 aa  231  1e-59  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04085  ABC transporter ATP-binding protein  50.65 
 
 		 240 aa  225  6e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4461  ABC transporter related  46.44 
 
 		 273 aa  203  2e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0398264 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2050  ABC transporter related  47.62 
 
 		 236 aa  194  8.000000000000001e-49  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.492019  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3330  ABC transporter related  42.49 
 
 		 231 aa  192  5e-48  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.237178  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5321  ABC transporter related  44.44 
 
 		 234 aa  191  8e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.632986 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0682  ABC transporter related  41.99 
 
 		 231 aa  188  9e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01818  ABC transporter ATP-binding protein  44.92 
 
 		 245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000012979  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3361  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.67 
 
 		 239 aa  171  9e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836865  normal  0.481905 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  38.98 
 
 		 332 aa  158  7e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  39.02 
 
 		 309 aa  158  8e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2969  ABC transporter related protein  37.66 
 
 		 373 aa  149  4e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.297443  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  35.02 
 
 		 305 aa  149  6e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1076  ABC transporter related  38.64 
 
 		 308 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2338  ABC transporter-like protein  38.37 
 
 		 305 aa  146  4.0000000000000006e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  35.48 
 
 		 304 aa  145  5e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1161  ABC transporter related  34.31 
 
 		 307 aa  145  6e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0454  ABC transporter related protein  34.78 
 
 		 305 aa  145  7.0000000000000006e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1339  ABC transporter, ATP-binding protein  35.86 
 
 		 306 aa  144  1e-33  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1811  ABC transporter related  34.2 
 
 		 305 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0460716  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  37.44 
 
 		 301 aa  144  2e-33  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3201  ABC transporter-like protein  40.82 
 
 		 309 aa  144  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  36.87 
 
 		 337 aa  143  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  37.06 
 
 		 316 aa  143  3e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  34.56 
 
 		 318 aa  142  4e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0600  gliding motility protein  36.22 
 
 		 290 aa  142  5e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884739  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1121  ABC transporter, ATP-binding protein  36.49 
 
 		 306 aa  142  6e-33  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1150  ABC transporter related  36.79 
 
 		 306 aa  141  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0925  ABC transporter ATP-binding protein  33.61 
 
 		 307 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.989727  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  37.5 
 
 		 316 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  35.05 
 
 		 303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  36.28 
 
 		 309 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  33.47 
 
 		 303 aa  140  1.9999999999999998e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1392  ABC transporter ATPase  37.5 
 
 		 318 aa  139  3e-32  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0253  ABC transporter related  35.92 
 
 		 288 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.21 
 
 		 312 aa  139  4.999999999999999e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  34.88 
 
 		 316 aa  139  4.999999999999999e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  35.71 
 
 		 243 aa  139  6e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0353  ABC transporter related  36.7 
 
 		 303 aa  138  7e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0660  ABC transporter related  36.98 
 
 		 313 aa  138  1e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.946314  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1615  ABC transporter, ATP-binding protein  36.63 
 
 		 297 aa  137  1e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.002407  hitchhiker  0.000000022556 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0322  ABC transporter related  38.43 
 
 		 302 aa  137  1e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0405  ABC transporter related protein  33.96 
 
 		 346 aa  137  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4469  ABC transporter related  42.86 
 
 		 302 aa  137  1e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3279  ABC transporter related  36.63 
 
 		 297 aa  137  2e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00236807  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2485  ABC transporter related protein  35.18 
 
 		 304 aa  137  2e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3642  ABC transporter related protein  38.66 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  37.31 
 
 		 243 aa  137  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1571  ABC transporter, ATPase subunit  36.95 
 
 		 309 aa  136  2e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181605  normal  0.0483556 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3749  ABC transporter related protein  36.92 
 
 		 310 aa  137  2e-31  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  31.02 
 
 		 315 aa  137  2e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0908  ABC transporter ATP-binding protein  34.91 
 
 		 307 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  31.75 
 
 		 318 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0194342 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1657  ABC transporter related  37.5 
 
 		 313 aa  136  3.0000000000000003e-31  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  33.84 
 
 		 303 aa  135  4e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3189  ABC transporter related protein  36.63 
 
 		 316 aa  136  4e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  33.8 
 
 		 301 aa  135  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_125  ABC transporter, type 2, ATP-binding protein  35.44 
 
 		 288 aa  135  5e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1717  ABC transporter related protein  32.58 
 
 		 335 aa  135  5e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  33.17 
 
 		 310 aa  135  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.07 
 
 		 309 aa  135  5e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  35.9 
 
 		 247 aa  135  5e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3351  ABC transporter, ATP-binding protein  37.13 
 
 		 297 aa  135  6.0000000000000005e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182827  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3604  ABC transporter, ATP-binding protein  37.13 
 
 		 297 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.12304e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3388  ABC transporter ATP-binding protein  37.13 
 
 		 297 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.955224  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  34.08 
 
 		 341 aa  135  7.000000000000001e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  34.08 
 
 		 309 aa  135  7.000000000000001e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3300  ABC transporter, ATP-binding protein  37.13 
 
 		 297 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000068812  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3653  ABC transporter ATP-binding protein  37.13 
 
 		 297 aa  135  7.000000000000001e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.169658  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1426  ABC transporter for copper ATP-binding protein  39.58 
 
 		 303 aa  135  7.000000000000001e-31  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  37.69 
 
 		 299 aa  135  7.000000000000001e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2217  ABC transporter related  38.78 
 
 		 327 aa  135  8e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2951  ABC transporter related  35.53 
 
 		 260 aa  134  9e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.202921  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  35.38 
 
 		 295 aa  134  9e-31  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0487  ABC transporter related  41.71 
 
 		 325 aa  135  9e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  36.45 
 
 		 298 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2566  ABC transporter related  39.62 
 
 		 310 aa  134  9.999999999999999e-31  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.2512  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  39.18 
 
 		 312 aa  134  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1051  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.48 
 
 		 302 aa  134  9.999999999999999e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 251 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.03 
 
 		 321 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0487  copper ABC transporter, ATP-binding protein  41.28 
 
 		 332 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1640  ABC transporter related  36.79 
 
 		 287 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3702  ABC transporter, ATP-binding protein  36.14 
 
 		 297 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000381067  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  35.21 
 
 		 318 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1806  ABC transporter related  37.14 
 
 		 294 aa  133  1.9999999999999998e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.802258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3358  ABC transporter related  40.21 
 
 		 344 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.348903  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3610  ABC transporter, ATP-binding protein  36.13 
 
 		 297 aa  133  3e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000012403  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  37.2 
 
 		 279 aa  133  3e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  34.85 
 
 		 302 aa  133  3e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0816  ABC transporter related protein  35.05 
 
 		 305 aa  133  3e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.286081  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3620  ABC transporter, ATP-binding protein  36.13 
 
 		 297 aa  133  3e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627092  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3534  ABC transporter related  40.68 
 
 		 348 aa  132  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4530  ABC transporter related  38.57 
 
 		 242 aa  133  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.286786  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  37.02 
 
 		 308 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0497  ABC transporter related  40.68 
 
 		 348 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2644  ABC transporter related  38.42 
 
 		 334 aa  132  3.9999999999999996e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  32.08 
 
 		 300 aa  132  5e-30  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.445411 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>