More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01807 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01807  ABC transporter, ATP-binding protein  100 
 
 		 240 aa  491  9.999999999999999e-139  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3773  ABC transporter related  59.41 
 
 		 245 aa  280  1e-74  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3610  ABC transporter ATP-binding protein  50.64 
 
 		 249 aa  231  1e-59  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000141343 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04085  ABC transporter ATP-binding protein  48.7 
 
 		 240 aa  209  2e-53  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0682  ABC transporter related  45.32 
 
 		 231 aa  199  1.9999999999999998e-50  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4461  ABC transporter related  42.98 
 
 		 273 aa  189  2.9999999999999997e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0398264 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5321  ABC transporter related  44.86 
 
 		 234 aa  184  7e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.632986 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3330  ABC transporter related  43.46 
 
 		 231 aa  184  1.0000000000000001e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.237178  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2050  ABC transporter related  46.23 
 
 		 236 aa  181  8.000000000000001e-45  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.492019  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01818  ABC transporter ATP-binding protein  44.29 
 
 		 245 aa  175  5e-43  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.0000012979  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3361  putative ABC transporter ATP-binding protein  36.48 
 
 		 239 aa  158  6e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.836865  normal  0.481905 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0522  ABC transporter related  38.68 
 
 		 287 aa  157  1e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000861338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  39.9 
 
 		 300 aa  153  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  36.45 
 
 		 304 aa  153  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  39.05 
 
 		 332 aa  151  8.999999999999999e-36  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  36.67 
 
 		 301 aa  148  6e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  37.96 
 
 		 316 aa  148  9e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  36.92 
 
 		 316 aa  145  5e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0405  ABC transporter related protein  38.42 
 
 		 346 aa  145  6e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  34.96 
 
 		 318 aa  145  7.0000000000000006e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4914  putative ABC transporter ATP-binding protein  37.17 
 
 		 316 aa  144  1e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000429083 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  35.05 
 
 		 315 aa  144  1e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1293  ABC transporter, ATP-binding protein  38.6 
 
 		 350 aa  143  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.906267  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0407  ABC transporter-like protein  39.72 
 
 		 247 aa  143  3e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0988  ABC transporter related  35.62 
 
 		 327 aa  143  3e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.037196 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1044  ABC transporter related  40.69 
 
 		 331 aa  143  3e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0878  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 		 266 aa  142  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  35.85 
 
 		 337 aa  142  3e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  36.49 
 
 		 300 aa  142  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  39.91 
 
 		 298 aa  142  5e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3402  ABC transporter-related protein  36.62 
 
 		 322 aa  142  5e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00371017  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  37.82 
 
 		 303 aa  142  6e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  37.44 
 
 		 309 aa  141  8e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3189  ABC transporter related protein  36.1 
 
 		 316 aa  140  9.999999999999999e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  37.5 
 
 		 312 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  36.32 
 
 		 309 aa  140  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2549  ABC transporter related  35.98 
 
 		 340 aa  141  9.999999999999999e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1642  ABC transporter related protein  36.67 
 
 		 323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_125  ABC transporter, type 2, ATP-binding protein  35.75 
 
 		 288 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp1371  copper ATP-binding ABC transporter protein  41.75 
 
 		 314 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  35.19 
 
 		 301 aa  139  3e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  36.24 
 
 		 259 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0925  ABC transporter ATP-binding protein  38.66 
 
 		 307 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.989727  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0908  ABC transporter ATP-binding protein  39.18 
 
 		 307 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1426  ABC transporter for copper ATP-binding protein  34.29 
 
 		 303 aa  138  7e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5529  ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 		 305 aa  138  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  35.35 
 
 		 319 aa  138  7.999999999999999e-32  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4353  ABC transporter related  38.46 
 
 		 340 aa  138  8.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0121046  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  35.84 
 
 		 310 aa  137  1e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  35.85 
 
 		 318 aa  137  1e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  34.22 
 
 		 303 aa  137  2e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  34.8 
 
 		 305 aa  137  2e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  37.74 
 
 		 303 aa  136  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2217  ABC transporter related  34.27 
 
 		 327 aa  136  2e-31  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4174  ABC transporter related  40.72 
 
 		 318 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4062  ABC transporter related  40.72 
 
 		 318 aa  137  2e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.603136  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1807  ABC transporter, ATP-binding protein  35.27 
 
 		 253 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5442  ABC transporter-like  39.07 
 
 		 906 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0350358 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  33.49 
 
 		 248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  37.02 
 
 		 369 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1419  ABC transporter related protein  39.49 
 
 		 247 aa  136  3.0000000000000003e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5523  ABC transporter, ATP-binding protein  35.86 
 
 		 305 aa  135  4e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0689501  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.34 
 
 		 299 aa  135  5e-31  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5579  ABC transporter, ATP-binding protein  35.86 
 
 		 305 aa  135  5e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1392  ABC transporter ATPase  36.02 
 
 		 318 aa  135  5e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.51 
 
 		 309 aa  135  6.0000000000000005e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2969  ABC transporter related protein  35.75 
 
 		 373 aa  134  9e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.297443  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0679  ABC transporter related  36.57 
 
 		 253 aa  134  9e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0136  ABC transporter related  31.72 
 
 		 250 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0134  ABC transporter related  31.72 
 
 		 250 aa  134  9.999999999999999e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1121  ABC transporter, ATP-binding protein  39.39 
 
 		 306 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5193  ABC transporter related  35.35 
 
 		 305 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  34.43 
 
 		 309 aa  134  9.999999999999999e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4530  ABC transporter related  40.21 
 
 		 242 aa  134  9.999999999999999e-31  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.286786  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1150  ABC transporter related  37.14 
 
 		 306 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3870  ABC transporter related  41.54 
 
 		 304 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1057  ABC transporter related  37.21 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  34.58 
 
 		 250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  37.38 
 
 		 316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2017  ABC transporter related  37.24 
 
 		 273 aa  133  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0353  ABC transporter related  37.93 
 
 		 303 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02790  ABC transporter related  34.38 
 
 		 258 aa  133  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3468  ABC transporter, ATP-binding protein  34.82 
 
 		 253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000910882  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1136  ABC transporter related  37.21 
 
 		 310 aa  134  1.9999999999999998e-30  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0444125  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0454  ABC transporter related protein  36.97 
 
 		 305 aa  133  1.9999999999999998e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1339  ABC transporter, ATP-binding protein  37.44 
 
 		 306 aa  133  3e-30  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1717  ABC transporter related protein  33.81 
 
 		 335 aa  133  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3213  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  34.19 
 
 		 253 aa  132  3e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  34.26 
 
 		 356 aa  133  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  36.27 
 
 		 309 aa  133  3e-30  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0253  ABC transporter related  33.68 
 
 		 288 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4010  ABC transporter related protein  36.78 
 
 		 299 aa  132  3.9999999999999996e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2125  normal  0.344666 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  34.55 
 
 		 312 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  35.05 
 
 		 308 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1335  ABC transporter related  36.22 
 
 		 316 aa  132  3.9999999999999996e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.434396  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3240  ABC transporter ATP-binding protein  34.82 
 
 		 253 aa  132  5e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3150  ABC transporter efflux permease; daunorubicin resistance transmembrane protein  34.82 
 
 		 253 aa  132  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.962721  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5098  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  34.85 
 
 		 305 aa  132  5e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3493  ABC transporter ATP-binding protein  34.82 
 
 		 253 aa  132  5e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.644181  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3921  ABC transporter-related protein  34.85 
 
 		 305 aa  132  5e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.463673  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>