More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DehaBAV1_0253 on replicon NC_009455
Organism: Dehalococcoides sp. BAV1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009455  DehaBAV1_0253  ABC transporter related  100 
 
 
288 aa  590  1e-168  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_125  ABC transporter, type 2, ATP-binding protein  94.44 
 
 
288 aa  566  1e-160  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0522  ABC transporter related  65.03 
 
 
287 aa  385  1e-106  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000861338  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2191  ABC transporter related  46.83 
 
 
312 aa  260  2e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0278805 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2202  ABC transporter related  46.83 
 
 
312 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.229953  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2248  ABC transporter related  46.83 
 
 
312 aa  259  3e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0600  gliding motility protein  45.94 
 
 
290 aa  256  2e-67  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884739  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0776  ABC transporter-related protein  47.35 
 
 
290 aa  256  5e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12703  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  45.42 
 
 
301 aa  248  1e-64  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4683  ABC transporter related protein  46.71 
 
 
287 aa  248  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.192563  normal  0.0676075 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03720  ABC transporter related  47.39 
 
 
284 aa  243  3e-63  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0970  ABC transporter related  46.67 
 
 
283 aa  234  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.653003 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2001  ABC transporter related  43.11 
 
 
286 aa  227  2e-58  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2672  ABC transporter related protein  39.65 
 
 
285 aa  226  4e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000143411  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3832  ABC transporter related  44.17 
 
 
283 aa  226  4e-58  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.363702  hitchhiker  0.000120659 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.83 
 
 
318 aa  220  1.9999999999999999e-56  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0194342 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5409  ABC transporter, ATP-binding protein  40.64 
 
 
280 aa  218  1e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00615205  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1678  ABC transporter related protein  43.06 
 
 
284 aa  218  1e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.711145 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4966  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  40.99 
 
 
280 aa  216  4e-55  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000075672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4984  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  40.99 
 
 
280 aa  216  4e-55  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00201825  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5460  ABC transporter, ATP-binding protein  40.64 
 
 
280 aa  216  4e-55  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00101212  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5375  ABC transporter, ATP-binding protein  40.99 
 
 
280 aa  216  4e-55  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214452 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4307  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.55 
 
 
330 aa  216  5e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5082  ABC transporter related  42.7 
 
 
280 aa  215  8e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00905032  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5133  ABC transporter ATP-binding protein  40.64 
 
 
280 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.907732  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5526  ABC transporter ATP-binding protein  40.64 
 
 
280 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3803  ABC transporter-related protein  42.54 
 
 
281 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5545  ABC transporter, ATP-binding protein  42.7 
 
 
280 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5405  ABC transporter, ATP-binding protein  42.7 
 
 
280 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00980275  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2486  ATP-binding protein  39.29 
 
 
318 aa  209  3e-53  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.49 
 
 
309 aa  209  4e-53  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0632  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.61 
 
 
318 aa  207  2e-52  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  39.02 
 
 
330 aa  206  3e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1575  ABC-type transport system, ATPase component  38.03 
 
 
314 aa  206  4e-52  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3598  ABC transporter related  40.99 
 
 
281 aa  205  6e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  38.64 
 
 
328 aa  205  6e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.34 
 
 
329 aa  204  1e-51  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  40.07 
 
 
304 aa  203  2e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.54 
 
 
321 aa  202  7e-51  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0270  ABC transporter related  39.02 
 
 
325 aa  201  9.999999999999999e-51  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.198584  hitchhiker  0.000164753 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1126  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.66 
 
 
326 aa  201  9.999999999999999e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.01 
 
 
328 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  36.57 
 
 
327 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.25 
 
 
317 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.03 
 
 
327 aa  195  7e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0560  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.93 
 
 
324 aa  194  1e-48  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1381  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.11 
 
 
327 aa  193  2e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000774362  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  36.73 
 
 
301 aa  193  3e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.91 
 
 
322 aa  192  7e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.33 
 
 
316 aa  191  9e-48  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1761  ABC transporter related  35.48 
 
 
322 aa  191  1e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.726529  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3189  ABC transporter related protein  38.51 
 
 
316 aa  191  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.36 
 
 
339 aa  191  1e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2408  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.54 
 
 
325 aa  190  2e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000647943  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.81 
 
 
328 aa  189  4e-47  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.89 
 
 
279 aa  189  4e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  38.49 
 
 
305 aa  189  5.999999999999999e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  39.68 
 
 
314 aa  188  8e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  39.36 
 
 
283 aa  187  1e-46  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  40.52 
 
 
247 aa  188  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  37.05 
 
 
312 aa  188  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  36.75 
 
 
319 aa  187  1e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  38.49 
 
 
305 aa  188  1e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1080  ATPase  41.85 
 
 
275 aa  187  2e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  36.93 
 
 
282 aa  187  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0859  ABC transporter related  42.67 
 
 
319 aa  187  2e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0838587  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1103  ABC transporter related  45.24 
 
 
320 aa  187  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0391915  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1033  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.92 
 
 
317 aa  187  2e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.100021 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1005  ABC transporter related  47.34 
 
 
257 aa  186  3e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00810555  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4353  ABC transporter related  44.05 
 
 
340 aa  186  4e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0121046  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  36.24 
 
 
303 aa  185  6e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  37.83 
 
 
305 aa  185  7e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1427  ABC transporter related  35.74 
 
 
332 aa  185  7e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  40.97 
 
 
248 aa  185  8e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2014  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.58 
 
 
317 aa  184  1.0000000000000001e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000225656  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1827  ABC transporter related  37.19 
 
 
279 aa  184  2.0000000000000003e-45  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.215935  normal  0.111086 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  37.86 
 
 
312 aa  184  2.0000000000000003e-45  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0061  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.59 
 
 
338 aa  183  3e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00188149  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  35.2 
 
 
314 aa  183  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2297  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  39.34 
 
 
325 aa  183  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.422878  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  34.9 
 
 
318 aa  183  3e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4617  ABC transporter related  42.36 
 
 
314 aa  182  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1780  ABC transporter related protein  40.95 
 
 
312 aa  182  5.0000000000000004e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.150839  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1339  ABC transporter, ATP-binding protein  38.52 
 
 
306 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  36.68 
 
 
259 aa  182  5.0000000000000004e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1117  ABC transporter related  35.71 
 
 
326 aa  182  6e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.222979  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0013  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  36.6 
 
 
308 aa  181  1e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.805584  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  41.2 
 
 
310 aa  181  1e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3642  ABC transporter related protein  40 
 
 
310 aa  181  1e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.13 
 
 
334 aa  181  1e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  37.6 
 
 
320 aa  180  2e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  36.4 
 
 
256 aa  181  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  34.78 
 
 
305 aa  180  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  41.43 
 
 
301 aa  180  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  34.64 
 
 
356 aa  180  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0260  ABC transporter related protein  36.93 
 
 
329 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.723146  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1213  ABC transporter related  37.76 
 
 
309 aa  180  2.9999999999999997e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.715047  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1658  ABC transporter related  35.84 
 
 
303 aa  179  4e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0154883  decreased coverage  0.000224831 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0557  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.49 
 
 
279 aa  179  4e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1191  ABC transporter related  36.07 
 
 
339 aa  179  4.999999999999999e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000151275 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>