More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphy_1005 on replicon NC_010001
Organism: Clostridium phytofermentans ISDg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010001  Cphy_1005  ABC transporter related  100 
 
 
257 aa  518  1e-146  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00810555  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4307  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  51.45 
 
 
330 aa  258  8e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3319  ABC transporter related  51.77 
 
 
332 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1400  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  47.35 
 
 
334 aa  221  9.999999999999999e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1127  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  47.6 
 
 
334 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0903207  normal  0.972786 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  44.98 
 
 
241 aa  209  2e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1658  ABC transporter related  41.88 
 
 
303 aa  209  3e-53  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0154883  decreased coverage  0.000224831 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1136  ABC transporter related  41.63 
 
 
334 aa  209  3e-53  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.123452  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0010  ABC transporter related  50.23 
 
 
339 aa  208  6e-53  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  47.39 
 
 
325 aa  207  1e-52  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  50.47 
 
 
339 aa  206  2e-52  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  42.42 
 
 
330 aa  204  1e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  48.42 
 
 
328 aa  203  2e-51  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  44.16 
 
 
243 aa  203  2e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4617  ABC transporter related  44.86 
 
 
314 aa  203  3e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3573  ABC transporter, ATP-binding protein  49.77 
 
 
330 aa  202  4e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.366392  normal  0.0689174 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  46.61 
 
 
329 aa  199  5e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  47 
 
 
328 aa  198  6e-50  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0523  ABC transporter, ATP-binding protein  43.7 
 
 
368 aa  197  1.0000000000000001e-49  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000509478 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  42.86 
 
 
243 aa  197  2.0000000000000003e-49  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  40.6 
 
 
251 aa  196  2.0000000000000003e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1122  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.92 
 
 
320 aa  196  3e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1019  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  46.23 
 
 
328 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.35766  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0600  gliding motility protein  46.46 
 
 
290 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884739  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1767  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  45.5 
 
 
255 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2408  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  48.44 
 
 
325 aa  195  6e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000647943  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2877  ABC transporter related  44.49 
 
 
329 aa  195  8.000000000000001e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2251  ABC transporter related protein  45.76 
 
 
266 aa  194  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00759154  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  50.7 
 
 
327 aa  194  1e-48  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0061  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.96 
 
 
338 aa  194  2e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00188149  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0419  ABC transporter related  44.08 
 
 
314 aa  192  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00150824  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2158  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  46.58 
 
 
325 aa  192  4e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2672  ABC transporter related protein  47.34 
 
 
285 aa  192  5e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000143411  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1126  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  47.73 
 
 
326 aa  192  6e-48  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1381  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  47.49 
 
 
327 aa  191  7e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000774362  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.19 
 
 
327 aa  191  1e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.154202  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_125  ABC transporter, type 2, ATP-binding protein  48.11 
 
 
288 aa  190  2e-47  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  39.91 
 
 
257 aa  189  5e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0253  ABC transporter related  47.37 
 
 
288 aa  189  5e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2353  ABC transporter related  44.32 
 
 
309 aa  188  8e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.341379  normal  0.122242 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1891  ABC transporter related  39.5 
 
 
320 aa  188  9e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572686  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0560  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  46.47 
 
 
324 aa  188  9e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  40.87 
 
 
327 aa  187  1e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0522  ABC transporter related  49.28 
 
 
287 aa  187  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000861338  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19730  ABC transporter related  38.98 
 
 
252 aa  186  2e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  43.56 
 
 
356 aa  186  2e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2474  ABC transporter related  44.53 
 
 
299 aa  186  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.471366  normal  0.779331 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3113  ABC transporter, ATPase subunit  43.72 
 
 
322 aa  187  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0475  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  47.14 
 
 
333 aa  186  2e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0408472 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0776  ABC transporter-related protein  45.53 
 
 
290 aa  187  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1257  ABC transporter related  39.53 
 
 
330 aa  186  3e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12703  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  49.07 
 
 
301 aa  186  4e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3629  ABC transporter related  42.79 
 
 
311 aa  186  5e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00141619  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1806  ABC transporter related  40.16 
 
 
294 aa  185  5e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.802258  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  41.26 
 
 
301 aa  185  6e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3222  ABC transporter-related protein  43.26 
 
 
322 aa  184  9e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.209487  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3246  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.76 
 
 
321 aa  184  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.328861 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3307  ABC transporter related  43.26 
 
 
322 aa  184  1.0000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0967  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.77 
 
 
348 aa  184  1.0000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3246  ABC transporter, ATP-binding protein  41.5 
 
 
266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.478641  normal  0.0776231 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.36 
 
 
318 aa  183  2.0000000000000003e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0194342 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2918  ABC transporter related  41.7 
 
 
247 aa  182  3e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.79893  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0228  ABC transporter related  43.3 
 
 
324 aa  183  3e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.00487637  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4032  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  46.02 
 
 
338 aa  182  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.631221  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  41 
 
 
319 aa  182  4.0000000000000006e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  40.72 
 
 
314 aa  182  4.0000000000000006e-45  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1594  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  50.23 
 
 
323 aa  182  5.0000000000000004e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.658594  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.74 
 
 
321 aa  182  6e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00218593  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  41.35 
 
 
314 aa  181  7e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1776  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.35 
 
 
319 aa  181  7e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.179608 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  47.49 
 
 
323 aa  181  7e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0427  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.93 
 
 
322 aa  181  8.000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2039  ABC transporter-like protein protein  41.25 
 
 
339 aa  181  8.000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.72 
 
 
279 aa  181  1e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0785  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.01 
 
 
324 aa  181  1e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.89 
 
 
305 aa  181  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.7 
 
 
334 aa  180  2e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2297  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  44.35 
 
 
325 aa  180  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.422878  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0903  ABC transporter related  41.63 
 
 
303 aa  180  2e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4151  ABC transporter-like  40.25 
 
 
275 aa  179  2.9999999999999997e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000107642  normal  0.126355 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.81 
 
 
324 aa  179  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0010745  normal  0.559357 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2191  ABC transporter related  46.48 
 
 
312 aa  179  2.9999999999999997e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0278805 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.92 
 
 
317 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2202  ABC transporter related  46.7 
 
 
312 aa  179  4e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.229953  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2248  ABC transporter related  46.7 
 
 
312 aa  179  4e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0260  ABC transporter related protein  41.36 
 
 
329 aa  179  4e-44  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.723146  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0215  ABC transporter-related protein  43.81 
 
 
310 aa  179  4e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.314538  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  43.24 
 
 
320 aa  179  4.999999999999999e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5639  ABC transporter related  40.36 
 
 
248 aa  179  4.999999999999999e-44  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.307001 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1208  ABC transporter related  40 
 
 
339 aa  178  7e-44  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.697219  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0498  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.72 
 
 
360 aa  178  7e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1956  ABC transporter related protein  39.06 
 
 
240 aa  178  9e-44  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  hitchhiker  0.00584741  normal  0.468336 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0458  ABC transporter related protein  42.59 
 
 
309 aa  177  1e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0191  ABC transporter-like  39.58 
 
 
339 aa  177  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0494849 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0614  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.74 
 
 
374 aa  177  1e-43  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.668059 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07240  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  41.15 
 
 
332 aa  177  2e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.44685 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3594  ABC transporter related  45.26 
 
 
299 aa  177  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1213  ABC transporter related  43.98 
 
 
309 aa  177  2e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.715047  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1235  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.74 
 
 
368 aa  176  4e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1439  ABC transporter related protein  40.09 
 
 
299 aa  176  4e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>