More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dhaf_2001 on replicon NC_011830
Organism: Desulfitobacterium hafniense DCB-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011830  Dhaf_2001  ABC transporter related  100 
 
 
286 aa  590  1e-167  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4683  ABC transporter related protein  52.82 
 
 
287 aa  299  3e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.192563  normal  0.0676075 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3832  ABC transporter related  53.17 
 
 
283 aa  298  7e-80  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.363702  hitchhiker  0.000120659 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0970  ABC transporter related  52.82 
 
 
283 aa  295  4e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.653003 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12703  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  51.58 
 
 
301 aa  290  1e-77  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2191  ABC transporter related  51.93 
 
 
312 aa  284  1.0000000000000001e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0278805 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2202  ABC transporter related  51.58 
 
 
312 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.229953  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2248  ABC transporter related  51.58 
 
 
312 aa  280  2e-74  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0776  ABC transporter-related protein  50.18 
 
 
290 aa  273  3e-72  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03720  ABC transporter related  47.02 
 
 
284 aa  250  2e-65  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1678  ABC transporter related protein  44.72 
 
 
284 aa  245  4.9999999999999997e-64  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.711145 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_125  ABC transporter, type 2, ATP-binding protein  44.52 
 
 
288 aa  234  2.0000000000000002e-60  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0253  ABC transporter related  43.11 
 
 
288 aa  227  2e-58  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0522  ABC transporter related  44.36 
 
 
287 aa  213  2.9999999999999995e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000861338  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3803  ABC transporter-related protein  40.15 
 
 
281 aa  194  1e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5545  ABC transporter, ATP-binding protein  39.42 
 
 
280 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5409  ABC transporter, ATP-binding protein  39.05 
 
 
280 aa  187  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00615205  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5460  ABC transporter, ATP-binding protein  40.29 
 
 
280 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00101212  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5133  ABC transporter ATP-binding protein  40.29 
 
 
280 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.907732  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5405  ABC transporter, ATP-binding protein  37.59 
 
 
280 aa  187  2e-46  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00980275  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5526  ABC transporter ATP-binding protein  40.29 
 
 
280 aa  187  2e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4966  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  40.29 
 
 
280 aa  186  3e-46  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000075672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4984  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  40.29 
 
 
280 aa  186  3e-46  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00201825  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5375  ABC transporter, ATP-binding protein  40.29 
 
 
280 aa  186  3e-46  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214452 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5082  ABC transporter related  38.44 
 
 
280 aa  186  5e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00905032  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0600  gliding motility protein  38.81 
 
 
290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884739  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3598  ABC transporter related  38.55 
 
 
281 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4307  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.58 
 
 
330 aa  179  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2672  ABC transporter related protein  37.06 
 
 
285 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000143411  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  34.72 
 
 
312 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0260  ABC transporter related protein  33.96 
 
 
329 aa  171  2e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.723146  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1005  ABC transporter related  43.12 
 
 
257 aa  166  5e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00810555  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1400  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  45.33 
 
 
334 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.28 
 
 
321 aa  165  5.9999999999999996e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1274  ABC transporter ATP-binding protein  32.12 
 
 
300 aa  163  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.1161  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1246  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  32.12 
 
 
300 aa  163  3e-39  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0565117  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  35.13 
 
 
301 aa  162  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  35.51 
 
 
741 aa  162  5.0000000000000005e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2486  ATP-binding protein  34.14 
 
 
318 aa  161  1e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0151  ABC transporter related  36.14 
 
 
283 aa  160  2e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1410  ABC transporter, ATP-binding protein  31.79 
 
 
300 aa  160  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.84 
 
 
318 aa  160  3e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0194342 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1517  ABC transporter, ATP-binding protein  31.79 
 
 
300 aa  159  4e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1448  ABC transporter, ATP-binding protein  31.79 
 
 
300 aa  159  4e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000281318 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3933  ABC transporter, ATP-binding protein  31.25 
 
 
300 aa  159  6e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.643034 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1281  ABC transporter related  32.28 
 
 
300 aa  159  6e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278405  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4353  ABC transporter related  41.26 
 
 
340 aa  159  7e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0121046  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  33.33 
 
 
356 aa  158  8e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1526  ABC transporter related  40.48 
 
 
245 aa  157  1e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.561273  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1669  ABC transporter related  38.6 
 
 
338 aa  158  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.700006  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1248  multidrug ABC transporter ATP-binding protein  31.79 
 
 
300 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.330688  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  42.93 
 
 
250 aa  157  2e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7720  nodulation ABC transporter NodI  38.19 
 
 
304 aa  157  2e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.948879  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2408  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.81 
 
 
325 aa  156  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000647943  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1475  ABC transporter, ATP-binding protein  31.13 
 
 
300 aa  156  4e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4029  nodulation ABC transporter NodI  37.19 
 
 
304 aa  156  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0256  heme exporter protein CcmA  34.66 
 
 
291 aa  155  9e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.197051  normal  0.658869 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  41.87 
 
 
314 aa  154  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  34.28 
 
 
301 aa  154  1e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1080  ABC transporter-related protein  30.79 
 
 
300 aa  154  1e-36  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  35.66 
 
 
300 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4919  nodulation factor exporter subunit NodI  34.77 
 
 
342 aa  154  2e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1126  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.02 
 
 
326 aa  154  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2969  ABC transporter related protein  36.18 
 
 
373 aa  154  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.297443  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  37.39 
 
 
303 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  33.45 
 
 
300 aa  153  2.9999999999999998e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.03 
 
 
309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1082  ABC transporter related  33.44 
 
 
309 aa  152  4e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124615  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6187  nodulation factor exporter subunit NodI  34.75 
 
 
355 aa  153  4e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1213  ABC transporter related  38.08 
 
 
309 aa  152  5e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.715047  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  40.48 
 
 
330 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  33.77 
 
 
319 aa  152  5.9999999999999996e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5039  nodulation factor exporter subunit NodI  34.65 
 
 
345 aa  152  7e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1284  ABC transporter related  37.21 
 
 
334 aa  152  7e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485103  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1403  ABC transporter-related protein  34.31 
 
 
296 aa  152  7e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.357223 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0349  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
301 aa  152  8.999999999999999e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.172507  normal  0.855348 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  32.58 
 
 
256 aa  151  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0419  ABC transporter related  33.68 
 
 
314 aa  151  1e-35  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00150824  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  34.39 
 
 
303 aa  151  1e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.01 
 
 
325 aa  151  1e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3870  ABC transporter related  31.21 
 
 
304 aa  150  2e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0681  ABC transporter related  38.25 
 
 
339 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249966  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0988  ABC transporter related  41.75 
 
 
327 aa  150  2e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.418125  normal  0.037196 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3629  ABC transporter related  38.92 
 
 
311 aa  150  2e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00141619  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4559  ABC transporter related protein  34.98 
 
 
285 aa  150  2e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.995467  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2485  ABC transporter related protein  32.86 
 
 
304 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0284  ABC transporter, ATPase subunit  32.76 
 
 
310 aa  150  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1594  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.45 
 
 
323 aa  150  2e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.658594  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0809  ABC transporter-related protein  34.01 
 
 
308 aa  150  2e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0407465  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1257  ABC transporter related  39.27 
 
 
330 aa  150  2e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  36.1 
 
 
310 aa  150  3e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3694  ABC transporter related  39.02 
 
 
756 aa  149  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0794  ABC transporter, ATP-binding protein  33.98 
 
 
305 aa  149  5e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00734303  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1790  ABC transporter related  35.82 
 
 
316 aa  149  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.154782 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  38.97 
 
 
301 aa  149  5e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_700  ABC transporter, ATP-binding protein  33.66 
 
 
305 aa  149  6e-35  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.365383  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0679  ABC transporter related  36.07 
 
 
253 aa  149  7e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  34.19 
 
 
327 aa  148  8e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  37.56 
 
 
327 aa  148  8e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3116  ABC transporter related  36.6 
 
 
326 aa  148  8e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.389623  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>