More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1678 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1678  ABC transporter related protein  100 
 
 
284 aa  552  1e-156  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.711145 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2191  ABC transporter related  56.06 
 
 
312 aa  294  9e-79  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.132491  normal  0.0278805 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2202  ABC transporter related  55.71 
 
 
312 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.229953  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2248  ABC transporter related  55.71 
 
 
312 aa  290  2e-77  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0776  ABC transporter-related protein  55.79 
 
 
290 aa  286  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.401792  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12703  antibiotic ABC transporter ATP-binding protein  53.68 
 
 
301 aa  283  3.0000000000000004e-75  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4683  ABC transporter related protein  53.57 
 
 
287 aa  281  6.000000000000001e-75  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.192563  normal  0.0676075 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3832  ABC transporter related  51.97 
 
 
283 aa  276  3e-73  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.363702  hitchhiker  0.000120659 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0970  ABC transporter related  50.9 
 
 
283 aa  275  5e-73  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.653003 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2001  ABC transporter related  44.72 
 
 
286 aa  245  4.9999999999999997e-64  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03720  ABC transporter related  40.14 
 
 
284 aa  230  2e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_125  ABC transporter, type 2, ATP-binding protein  42.71 
 
 
288 aa  218  1e-55  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0253  ABC transporter related  43.06 
 
 
288 aa  218  1e-55  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5082  ABC transporter related  37.55 
 
 
280 aa  204  2e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00905032  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0522  ABC transporter related  44.06 
 
 
287 aa  204  2e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000861338  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5409  ABC transporter, ATP-binding protein  37.4 
 
 
280 aa  202  3e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00615205  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5545  ABC transporter, ATP-binding protein  37.55 
 
 
280 aa  202  4e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5405  ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 
280 aa  202  5e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00980275  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5460  ABC transporter, ATP-binding protein  37.02 
 
 
280 aa  202  6e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00101212  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5375  ABC transporter, ATP-binding protein  37.02 
 
 
280 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00214452 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4966  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  37.02 
 
 
280 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000075672  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4984  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  37.02 
 
 
280 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00201825  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5133  ABC transporter ATP-binding protein  36.64 
 
 
280 aa  198  9e-50  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.907732  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5526  ABC transporter ATP-binding protein  36.64 
 
 
280 aa  198  9e-50  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3803  ABC transporter-related protein  36.78 
 
 
281 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0600  gliding motility protein  34.75 
 
 
290 aa  186  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884739  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1005  ABC transporter related  45.15 
 
 
257 aa  172  5e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00810555  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3642  ABC transporter related protein  41.58 
 
 
310 aa  172  5e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  47.12 
 
 
305 aa  171  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  46.33 
 
 
310 aa  167  2e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4307  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  47.6 
 
 
330 aa  164  2.0000000000000002e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2672  ABC transporter related protein  42.01 
 
 
285 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000143411  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3598  ABC transporter related  34.98 
 
 
281 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  37.06 
 
 
303 aa  161  1e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1036  ABC transporter related protein  38.71 
 
 
246 aa  160  2e-38  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.749247  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  42.59 
 
 
304 aa  160  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.62 
 
 
334 aa  159  4e-38  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2486  ATP-binding protein  41.26 
 
 
318 aa  159  4e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.54 
 
 
321 aa  159  4e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5131  ABC transporter related protein  44.91 
 
 
301 aa  159  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.135595  normal  0.223967 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.79 
 
 
318 aa  159  6e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0194342 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  33.76 
 
 
312 aa  159  6e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0036  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.5 
 
 
325 aa  158  7e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  44.54 
 
 
309 aa  158  9e-38  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.85 
 
 
329 aa  157  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  42.48 
 
 
904 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4353  ABC transporter related  43.33 
 
 
340 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0121046  normal  0.625584 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  41.63 
 
 
310 aa  157  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  46.61 
 
 
318 aa  157  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0704  ABC transporter related  38.25 
 
 
256 aa  156  4e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.187193  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.74 
 
 
339 aa  156  4e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3067  ABC transporter related  39.53 
 
 
254 aa  156  4e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0809  ABC transporter-related protein  44.8 
 
 
308 aa  155  5.0000000000000005e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0407465  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5115  ABC transporter related  38.36 
 
 
906 aa  155  6e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0612  ABC transporter related protein  45.74 
 
 
314 aa  155  6e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.787595  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5207  ABC transporter permease/ATP-binding protein  41.13 
 
 
906 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.468455  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5268  ABC transporter related  41.13 
 
 
906 aa  155  7e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.155488  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1529  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  35.66 
 
 
328 aa  155  9e-37  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.113333 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  43.05 
 
 
316 aa  154  1e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2969  ABC transporter related protein  45.45 
 
 
373 aa  154  1e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.297443  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1717  ABC transporter related protein  40.55 
 
 
335 aa  154  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3102  ABC transporter related  41.4 
 
 
300 aa  153  2e-36  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00319499  hitchhiker  0.0000545387 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1400  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.48 
 
 
334 aa  154  2e-36  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  35.49 
 
 
309 aa  154  2e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  36.44 
 
 
257 aa  152  5e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2228  ABC transporter related protein  40.65 
 
 
310 aa  152  5e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0144  ABC transporter related protein  39.01 
 
 
300 aa  152  8.999999999999999e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.113236 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3790  ABC transporter related  41.87 
 
 
912 aa  152  8.999999999999999e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0498  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.74 
 
 
360 aa  151  1e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3622  ABC transporter related  38.91 
 
 
290 aa  151  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.5 
 
 
328 aa  151  1e-35  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1642  ABC transporter related protein  43.64 
 
 
323 aa  150  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5442  ABC transporter-like  38.7 
 
 
906 aa  150  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.0350358 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1403  ABC transporter-related protein  39.29 
 
 
296 aa  150  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.357223 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  41.63 
 
 
279 aa  150  2e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1800  ABC transporter related protein  37.42 
 
 
312 aa  150  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1687  ABC transporter, ATP-binding protein  39.21 
 
 
280 aa  149  3e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.59 
 
 
316 aa  150  3e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.76 
 
 
317 aa  150  3e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2631  ABC transporter related  35.23 
 
 
301 aa  149  4e-35  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00330  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  45.5 
 
 
311 aa  149  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.851117  normal  0.157442 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1766  ABC transporter-like protein  37.34 
 
 
311 aa  149  5e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0389  daunorubicin resistance ABC transporter, ATPase subunit  41.75 
 
 
327 aa  149  5e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.316024  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0568  ABC transporter related  38.6 
 
 
241 aa  149  5e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6187  nodulation factor exporter subunit NodI  40.08 
 
 
355 aa  149  6e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4203  ABC transporter related  46.11 
 
 
741 aa  149  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.746448  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET1339  ABC transporter, ATP-binding protein  35.55 
 
 
306 aa  149  7e-35  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0061  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.8 
 
 
338 aa  149  7e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00188149  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4397  ABC transporter related protein  40.58 
 
 
301 aa  148  8e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.355124  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0565  ABC transporter related  41.26 
 
 
912 aa  148  8e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.620253  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2165  ABC transporter related protein  39.27 
 
 
308 aa  148  8e-35  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1381  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.75 
 
 
327 aa  148  9e-35  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000774362  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3439  ABC transporter, ATP-binding protein  36.99 
 
 
253 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0081  ABC transporter related  40.16 
 
 
911 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.111976  normal  0.167025 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1575  ABC-type transport system, ATPase component  36.18 
 
 
314 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0222  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  39.46 
 
 
330 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.834743  normal  0.816705 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2556  ABC transporter related protein  40.81 
 
 
272 aa  147  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.90963  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0172  ABC transporter related  41.33 
 
 
322 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0243  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.62 
 
 
316 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0708774  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0720  ABC transporter related  42.86 
 
 
305 aa  148  1.0000000000000001e-34  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00029064  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>