More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1642 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_1642  ABC transporter related protein  100 
 
 
323 aa  625  1e-178  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  66.56 
 
 
318 aa  398  9.999999999999999e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0405  ABC transporter related protein  60.94 
 
 
346 aa  370  1e-101  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  55.3 
 
 
303 aa  314  9.999999999999999e-85  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  54.28 
 
 
310 aa  311  1e-83  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1717  ABC transporter related protein  51.29 
 
 
335 aa  302  6.000000000000001e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  53.59 
 
 
305 aa  301  8.000000000000001e-81  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3642  ABC transporter related protein  53.97 
 
 
310 aa  301  1e-80  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2631  ABC transporter related  54 
 
 
301 aa  300  2e-80  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1082  ABC transporter related  52.96 
 
 
309 aa  298  6e-80  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124615  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2644  ABC transporter related  54.81 
 
 
334 aa  296  3e-79  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3189  ABC transporter related protein  50.66 
 
 
316 aa  291  1e-77  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0074  ABC transporter related protein  52.27 
 
 
309 aa  287  2e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.67132  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  51.64 
 
 
310 aa  283  2.0000000000000002e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  52.84 
 
 
332 aa  282  5.000000000000001e-75  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2228  ABC transporter related protein  50.34 
 
 
310 aa  270  2.9999999999999997e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  48.83 
 
 
316 aa  270  4e-71  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0227  ABC transporter related protein  47.35 
 
 
304 aa  265  8e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1526  ABC transporter related protein  48.84 
 
 
305 aa  261  1e-68  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3716  ABC transporter related protein  52.43 
 
 
311 aa  256  3e-67  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2969  ABC transporter related protein  47.52 
 
 
373 aa  253  3e-66  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.297443  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  43.85 
 
 
309 aa  250  2e-65  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2165  ABC transporter related protein  44.52 
 
 
308 aa  247  2e-64  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2940  ABC transporter related  57.8 
 
 
249 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  50.69 
 
 
311 aa  202  8e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0643  ABC transporter related  43.28 
 
 
304 aa  199  5e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4579  ABC transporter related  37.5 
 
 
300 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146186  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  39.81 
 
 
313 aa  189  8e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  33.44 
 
 
369 aa  187  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2206  ABC transporter related  43.62 
 
 
307 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758752  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2252  ABC transporter related  43.62 
 
 
307 aa  186  6e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.951966  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4248  ABC transporter related protein  39.42 
 
 
390 aa  186  6e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2195  ABC transporter related  43.62 
 
 
307 aa  185  7e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.144611  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  37.34 
 
 
327 aa  185  8e-46  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  40.13 
 
 
300 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  40.13 
 
 
313 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1839  ABC transporter related  40.19 
 
 
339 aa  183  3e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  39.81 
 
 
313 aa  183  4.0000000000000006e-45  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2403  ABC transporter, ATP-binding protein  34.82 
 
 
310 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  38.22 
 
 
337 aa  183  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0607  ABC transporter related  38.48 
 
 
347 aa  182  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000713126 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01670  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.87 
 
 
329 aa  182  5.0000000000000004e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.684849  normal  0.194324 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  34.32 
 
 
302 aa  182  8.000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1292  ABC transporter related protein  40.12 
 
 
351 aa  182  8.000000000000001e-45  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.743714  hitchhiker  0.00147222 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0353  ABC transporter related  39.46 
 
 
303 aa  181  1e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  41.28 
 
 
308 aa  181  1e-44  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4078  ABC transporter related  41.35 
 
 
326 aa  181  2e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  49.52 
 
 
301 aa  181  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  40.46 
 
 
457 aa  179  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0386  ABC transporter related  46.32 
 
 
322 aa  179  4.999999999999999e-44  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  40 
 
 
301 aa  179  4.999999999999999e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  45.5 
 
 
301 aa  179  4.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  38.41 
 
 
302 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  32.26 
 
 
310 aa  178  9e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  40.64 
 
 
356 aa  177  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0361  ABC transporter related  40 
 
 
310 aa  177  2e-43  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.764721 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2485  ABC transporter related protein  40.89 
 
 
304 aa  177  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  38.91 
 
 
307 aa  176  5e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.62 
 
 
321 aa  176  5e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  38.49 
 
 
303 aa  175  8e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2771  ABC transporter related  42.52 
 
 
307 aa  175  9e-43  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160437 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  34.12 
 
 
300 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0929  ABC transporter related  38.1 
 
 
318 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.31859  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0522  ABC transporter related  41.07 
 
 
287 aa  175  9.999999999999999e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000861338  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2549  ABC transporter related  35.78 
 
 
340 aa  175  9.999999999999999e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  34.08 
 
 
317 aa  175  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  45.81 
 
 
300 aa  175  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  34.54 
 
 
293 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  34.9 
 
 
293 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5524  ABC transporter related protein  47.06 
 
 
304 aa  174  9.999999999999999e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0925  ABC transporter ATP-binding protein  35.23 
 
 
307 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.989727  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  35.6 
 
 
309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1245  ABC transporter related protein  37.79 
 
 
313 aa  174  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  33.89 
 
 
316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3364  ABC transporter related protein  43.48 
 
 
266 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  39.67 
 
 
245 aa  173  3.9999999999999995e-42  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3301  ABC transporter related protein  40.19 
 
 
306 aa  173  3.9999999999999995e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.377119  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3536  ABC transporter, ATP-binding protein  31.27 
 
 
312 aa  172  5e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2470  ABC transporter related protein  41.14 
 
 
297 aa  172  5e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00132883  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  35.28 
 
 
316 aa  172  5e-42  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  34.18 
 
 
315 aa  173  5e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1608  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  31.27 
 
 
312 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1811  ABC transporter related  38.68 
 
 
305 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0460716  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  31.27 
 
 
312 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1575  ABC-type transport system, ATPase component  33.88 
 
 
314 aa  172  7.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  31.27 
 
 
312 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  34.87 
 
 
298 aa  172  9e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1175  ABC transporter related  46.3 
 
 
389 aa  172  9e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.181845  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.61 
 
 
309 aa  172  9e-42  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2408  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.1 
 
 
325 aa  172  9e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000647943  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1661  ABC transporter ATP-binding protein  31.27 
 
 
312 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1793  ABC transporter ATP-binding protein  31.27 
 
 
312 aa  172  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.92 
 
 
334 aa  171  1e-41  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  30.94 
 
 
312 aa  171  1e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1658  ABC transporter related  30.94 
 
 
312 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0672996  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  39.48 
 
 
246 aa  171  1e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1915  ABC transporter, ATP-binding protein  30.62 
 
 
312 aa  171  2e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2486  ATP-binding protein  33.55 
 
 
318 aa  171  2e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0679  ABC transporter related  43.5 
 
 
253 aa  171  2e-41  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1468  ABC transporter related  33.97 
 
 
319 aa  171  2e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00475192  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>