More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_0295 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  100 
 
 
315 aa  630  1e-179  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  65.59 
 
 
369 aa  435  1e-121  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  64.22 
 
 
317 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  57.37 
 
 
325 aa  376  1e-103  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  57.14 
 
 
310 aa  351  8e-96  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  49.84 
 
 
316 aa  313  1.9999999999999998e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  47.63 
 
 
319 aa  301  1e-80  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  47 
 
 
320 aa  295  9e-79  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  47 
 
 
320 aa  295  9e-79  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  44.97 
 
 
331 aa  292  5e-78  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  44.9 
 
 
328 aa  290  2e-77  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  45.45 
 
 
308 aa  282  6.000000000000001e-75  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  44.9 
 
 
360 aa  281  7.000000000000001e-75  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  43.27 
 
 
311 aa  272  5.000000000000001e-72  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  42.86 
 
 
344 aa  269  5e-71  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0087  ABC transporter related  41.77 
 
 
341 aa  265  8.999999999999999e-70  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  41.27 
 
 
336 aa  263  4e-69  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  43.32 
 
 
305 aa  262  6e-69  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  44.16 
 
 
314 aa  259  5.0000000000000005e-68  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2644  ABC transporter, ATPase subunit  43.59 
 
 
317 aa  257  2e-67  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  44.48 
 
 
305 aa  252  4.0000000000000004e-66  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  40.65 
 
 
329 aa  251  8.000000000000001e-66  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  43.46 
 
 
322 aa  249  4e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  44.41 
 
 
310 aa  249  5e-65  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  43.32 
 
 
303 aa  246  4e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.46 
 
 
301 aa  244  9.999999999999999e-64  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  52.27 
 
 
236 aa  244  9.999999999999999e-64  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6081  ABC transporter related protein  39.25 
 
 
317 aa  243  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  42.54 
 
 
298 aa  240  2e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  39.37 
 
 
316 aa  238  8e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  39.17 
 
 
331 aa  237  2e-61  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  42.54 
 
 
299 aa  234  1.0000000000000001e-60  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  50.68 
 
 
240 aa  234  1.0000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  39.31 
 
 
315 aa  233  3e-60  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39220  ABC transporter  46.4 
 
 
306 aa  232  8.000000000000001e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0732588  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  48.64 
 
 
306 aa  231  9e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  51.38 
 
 
307 aa  229  4e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  40.39 
 
 
308 aa  226  6e-58  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16870  putative ABC transporter ATP-binding protein  48.4 
 
 
307 aa  225  6e-58  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  38.54 
 
 
311 aa  223  3e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
309 aa  220  1.9999999999999999e-56  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1561  ABC transporter, ATP-binding protein  49.54 
 
 
312 aa  220  3e-56  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327811  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1467  ABC transporter ATP-binding protein  47.03 
 
 
307 aa  219  5e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1068  ABC transporter ATP-binding protein  41.43 
 
 
308 aa  219  6e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1397  ABC transporter related  49.08 
 
 
323 aa  217  2e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3051  ABC transporter related  37.1 
 
 
309 aa  216  5.9999999999999996e-55  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11620  ABC transporter  39.84 
 
 
308 aa  215  7e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  52.11 
 
 
235 aa  214  9.999999999999999e-55  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2842  ATP-binding protein of ABC transporter  36.86 
 
 
317 aa  214  1.9999999999999998e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000492349  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2669  ABC transporter related  37.58 
 
 
308 aa  210  2e-53  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0475955  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  45.25 
 
 
339 aa  205  7e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2202  ABC transporter related protein  48.33 
 
 
261 aa  205  7e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2945  ABC transporter related  36.45 
 
 
314 aa  205  9e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.760604  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2645  ABC transporter related  33.66 
 
 
325 aa  204  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.14 
 
 
321 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  45.21 
 
 
289 aa  197  1.0000000000000001e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  33.33 
 
 
308 aa  196  4.0000000000000005e-49  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0039  ABC transporter related  35.78 
 
 
310 aa  196  6e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
321 aa  195  1e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  35.71 
 
 
318 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0585  ABC transporter related  45.41 
 
 
247 aa  193  3e-48  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2220  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.76 
 
 
318 aa  192  4e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.0194342 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0475  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.14 
 
 
333 aa  192  5e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0408472 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  42.92 
 
 
306 aa  191  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3642  ABC transporter related protein  43.97 
 
 
310 aa  191  2e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  44.59 
 
 
303 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  36.81 
 
 
312 aa  189  4e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  34.71 
 
 
305 aa  189  4e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2562  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.84 
 
 
328 aa  189  4e-47  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.518295 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5193  ABC transporter related  39.18 
 
 
305 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5523  ABC transporter, ATP-binding protein  39.56 
 
 
305 aa  188  9e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0689501  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.6 
 
 
339 aa  188  9e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3123  ABC transporter related  34.92 
 
 
313 aa  188  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.546098  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5428  ABC transporter, ATP-binding protein  38.15 
 
 
305 aa  187  2e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5579  ABC transporter, ATP-binding protein  38.63 
 
 
305 aa  187  2e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0227  ABC transporter related protein  33.98 
 
 
304 aa  187  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1669  ABC transporter related  33.33 
 
 
338 aa  187  3e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.700006  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  44.02 
 
 
301 aa  187  3e-46  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  36.33 
 
 
318 aa  186  4e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  44.98 
 
 
332 aa  186  6e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1357  ABC transporter related  42.27 
 
 
309 aa  185  8e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1460  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.18 
 
 
329 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0256  ABC transporter related protein  44.29 
 
 
308 aa  185  1.0000000000000001e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392742  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  35.16 
 
 
310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1575  ABC-type transport system, ATPase component  34.46 
 
 
314 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0632  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.01 
 
 
318 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.38 
 
 
309 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1717  ABC transporter related protein  40.52 
 
 
335 aa  183  3e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  34.27 
 
 
308 aa  183  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5529  ABC transporter, ATP-binding protein  37.73 
 
 
305 aa  183  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.16 
 
 
334 aa  183  3e-45  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3978  ABC transporter related  37.65 
 
 
244 aa  183  3e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.73602  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5252  ABC transporter ATP-binding protein  38.61 
 
 
305 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  40.43 
 
 
316 aa  182  4.0000000000000006e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5650  ABC transporter ATP-binding protein  38.61 
 
 
305 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5495  ABC transporter, ATP-binding protein  38.61 
 
 
305 aa  183  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1126  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  42.73 
 
 
326 aa  182  5.0000000000000004e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5098  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  38.29 
 
 
305 aa  182  7e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5081  bacitracin ABC transporter ATP-binding protein  38.61 
 
 
305 aa  182  9.000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0793208  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  43.5 
 
 
327 aa  182  9.000000000000001e-45  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>