More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_07370 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  100 
 
 
301 aa  618  1e-176  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  66.33 
 
 
298 aa  400  9.999999999999999e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  58.39 
 
 
299 aa  367  1e-100  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  53.97 
 
 
303 aa  326  3e-88  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  53.55 
 
 
305 aa  318  7e-86  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  50 
 
 
305 aa  310  2e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  64.55 
 
 
236 aa  301  1e-80  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  46.71 
 
 
322 aa  266  2e-70  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  46.01 
 
 
325 aa  265  7e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  44 
 
 
308 aa  265  8.999999999999999e-70  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  55.5 
 
 
235 aa  260  2e-68  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  44.95 
 
 
308 aa  259  6e-68  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  43.37 
 
 
336 aa  259  6e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  44.87 
 
 
369 aa  256  3e-67  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  43.37 
 
 
316 aa  247  2e-64  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  41.46 
 
 
315 aa  244  9.999999999999999e-64  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  42.72 
 
 
311 aa  242  3.9999999999999997e-63  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  42.95 
 
 
317 aa  241  1e-62  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  39.75 
 
 
331 aa  235  7e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  41.45 
 
 
319 aa  232  4.0000000000000004e-60  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  41.53 
 
 
360 aa  233  4.0000000000000004e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  41.04 
 
 
311 aa  231  1e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  39.05 
 
 
320 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  39.05 
 
 
320 aa  230  2e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  41.31 
 
 
310 aa  229  6e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  51.35 
 
 
240 aa  228  1e-58  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  38.85 
 
 
344 aa  226  3e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  40 
 
 
315 aa  226  4e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  39.74 
 
 
310 aa  225  8e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2644  ABC transporter, ATPase subunit  40.33 
 
 
317 aa  224  1e-57  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  36.94 
 
 
328 aa  224  2e-57  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0087  ABC transporter related  39.74 
 
 
341 aa  221  8e-57  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  46.58 
 
 
316 aa  220  3e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1397  ABC transporter related  47.3 
 
 
323 aa  219  6e-56  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  39.54 
 
 
307 aa  219  6e-56  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  37.01 
 
 
339 aa  218  1e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  36.94 
 
 
329 aa  216  5e-55  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  38.39 
 
 
309 aa  215  8e-55  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  38.87 
 
 
331 aa  215  9e-55  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1561  ABC transporter, ATP-binding protein  46.4 
 
 
312 aa  212  4.9999999999999996e-54  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327811  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2202  ABC transporter related protein  47.68 
 
 
261 aa  212  7e-54  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  45.92 
 
 
306 aa  212  7.999999999999999e-54  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11620  ABC transporter  36.36 
 
 
308 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16870  putative ABC transporter ATP-binding protein  38.21 
 
 
307 aa  211  1e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39220  ABC transporter  38.44 
 
 
306 aa  209  6e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0732588  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1068  ABC transporter ATP-binding protein  36.63 
 
 
308 aa  208  8e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1467  ABC transporter ATP-binding protein  37.3 
 
 
307 aa  207  2e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6081  ABC transporter related protein  36.71 
 
 
317 aa  206  4e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2645  ABC transporter related  35.69 
 
 
325 aa  204  1e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2842  ATP-binding protein of ABC transporter  37.79 
 
 
317 aa  204  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000492349  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  35.05 
 
 
314 aa  195  9e-49  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  43.48 
 
 
256 aa  192  9e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2945  ABC transporter related  33.77 
 
 
314 aa  190  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.760604  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2081  ABC transporter related protein  36.3 
 
 
310 aa  189  4e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3051  ABC transporter related  34.43 
 
 
309 aa  187  2e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0585  ABC transporter related  41.4 
 
 
247 aa  185  9e-46  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2909  ABC transporter related  45.24 
 
 
245 aa  184  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1717  ABC transporter related protein  33.44 
 
 
335 aa  184  2.0000000000000003e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  37.38 
 
 
300 aa  183  3e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  35.86 
 
 
309 aa  181  9.000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  40.43 
 
 
310 aa  181  2e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3642  ABC transporter related protein  35.29 
 
 
310 aa  180  2.9999999999999997e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  33.55 
 
 
315 aa  179  4.999999999999999e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1634  ABC transporter related  36.7 
 
 
297 aa  179  7e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00180587  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2969  ABC transporter related protein  35.06 
 
 
373 aa  177  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.297443  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  39.57 
 
 
332 aa  177  2e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2669  ABC transporter related  38.79 
 
 
308 aa  177  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0475955  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0227  ABC transporter related protein  33.66 
 
 
304 aa  176  4e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1228  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  34.63 
 
 
309 aa  176  4e-43  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  41.1 
 
 
305 aa  176  4e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  40.61 
 
 
316 aa  175  7e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  31.89 
 
 
303 aa  175  7e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3352  ABC transporter related  33.89 
 
 
303 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0414725  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  41.59 
 
 
356 aa  172  6.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  34.64 
 
 
302 aa  172  7.999999999999999e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1669  ABC transporter related  33 
 
 
338 aa  172  7.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.700006  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  41.7 
 
 
327 aa  172  9e-42  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  41.74 
 
 
303 aa  171  1e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  33.22 
 
 
309 aa  171  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1542  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  34.23 
 
 
303 aa  171  1e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0283688 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  34.1 
 
 
308 aa  170  2e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2631  ABC transporter related  34.44 
 
 
301 aa  171  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2228  ABC transporter related protein  33.45 
 
 
310 aa  171  2e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0262  ABC transporter-related protein  39.3 
 
 
318 aa  170  3e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  37.7 
 
 
313 aa  170  3e-41  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3773  bacitracin transport ATP-binding protein BcrA  34.23 
 
 
303 aa  169  4e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.379604  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0783  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.71 
 
 
324 aa  169  4e-41  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  31.31 
 
 
316 aa  169  5e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  33.89 
 
 
331 aa  169  5e-41  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1284  ABC transporter related  32.23 
 
 
334 aa  169  5e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.485103  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  37.3 
 
 
313 aa  169  5e-41  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.88 
 
 
321 aa  169  5e-41  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2549  ABC transporter related  33.44 
 
 
340 aa  169  6e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0295  ABC transporter related  40.53 
 
 
298 aa  169  6e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.520917  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  31.33 
 
 
301 aa  169  7e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0256  ABC transporter related protein  33.33 
 
 
308 aa  169  8e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392742  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  39.91 
 
 
293 aa  168  9e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3211  ABC transporter ATP-binding protein  41.18 
 
 
307 aa  167  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00761631  normal  0.0394821 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  34.11 
 
 
318 aa  167  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  31.49 
 
 
316 aa  168  1e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>