More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_11620 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008463  PA14_11620  ABC transporter  100 
 
 
308 aa  625  1e-178  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1068  ABC transporter ATP-binding protein  92.21 
 
 
308 aa  579  1e-164  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1467  ABC transporter ATP-binding protein  62.83 
 
 
307 aa  389  1e-107  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16870  putative ABC transporter ATP-binding protein  62.01 
 
 
307 aa  390  1e-107  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39220  ABC transporter  61.18 
 
 
306 aa  379  1e-104  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0732588  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  59.54 
 
 
307 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1561  ABC transporter, ATP-binding protein  51.15 
 
 
312 aa  311  1e-83  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327811  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  49.51 
 
 
306 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1397  ABC transporter related  51.12 
 
 
323 aa  298  7e-80  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  41.46 
 
 
331 aa  245  6.999999999999999e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  42.22 
 
 
328 aa  242  7e-63  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  37.74 
 
 
316 aa  238  9e-62  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  49.1 
 
 
240 aa  236  5.0000000000000005e-61  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  37.86 
 
 
325 aa  235  8e-61  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  41.23 
 
 
308 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  36.72 
 
 
310 aa  231  1e-59  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  39.41 
 
 
319 aa  231  1e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  39.27 
 
 
308 aa  230  2e-59  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  39.35 
 
 
344 aa  229  4e-59  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  37.62 
 
 
360 aa  229  4e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  38.94 
 
 
320 aa  228  8e-59  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  38.94 
 
 
320 aa  228  8e-59  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  36.57 
 
 
369 aa  228  8e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  38.49 
 
 
303 aa  227  2e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  39.41 
 
 
310 aa  224  2e-57  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  37.5 
 
 
329 aa  221  9.999999999999999e-57  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  38.22 
 
 
317 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  39.02 
 
 
339 aa  220  3e-56  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  40.72 
 
 
322 aa  219  3.9999999999999997e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  37.83 
 
 
305 aa  219  6e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  39.35 
 
 
311 aa  218  8.999999999999998e-56  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  37.26 
 
 
316 aa  217  2.9999999999999998e-55  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  37.82 
 
 
315 aa  216  5e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  39.84 
 
 
315 aa  215  5.9999999999999996e-55  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  34.98 
 
 
298 aa  215  8e-55  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2644  ABC transporter, ATPase subunit  38.69 
 
 
317 aa  214  1.9999999999999998e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  38.98 
 
 
311 aa  212  7e-54  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  36.36 
 
 
301 aa  211  1e-53  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  35.43 
 
 
299 aa  208  9e-53  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  43.67 
 
 
235 aa  206  3e-52  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  43.84 
 
 
236 aa  206  4e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  34.33 
 
 
305 aa  206  5e-52  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0087  ABC transporter related  37.3 
 
 
341 aa  204  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2909  ABC transporter related  50 
 
 
245 aa  203  3e-51  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  35.71 
 
 
314 aa  202  4e-51  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2842  ATP-binding protein of ABC transporter  39.15 
 
 
317 aa  202  4e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000492349  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2202  ABC transporter related protein  45.41 
 
 
261 aa  201  9e-51  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  35.53 
 
 
336 aa  201  9.999999999999999e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  34.54 
 
 
331 aa  198  7.999999999999999e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2945  ABC transporter related  36.04 
 
 
314 aa  194  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.760604  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  37.38 
 
 
309 aa  189  5.999999999999999e-47  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  35.28 
 
 
341 aa  187  2e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6081  ABC transporter related protein  36.51 
 
 
317 aa  186  4e-46  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2669  ABC transporter related  33.01 
 
 
308 aa  182  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0475955  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0585  ABC transporter related  44.55 
 
 
247 aa  181  2e-44  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0657  ABC transporter-related protein  34.44 
 
 
320 aa  177  1e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00186139 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  32.01 
 
 
312 aa  177  3e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0809  ABC transporter-related protein  38.16 
 
 
308 aa  177  3e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0407465  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0039  ABC transporter related  30.39 
 
 
310 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1605  ABC transporter, ATP-binding protein  37.01 
 
 
309 aa  174  9.999999999999999e-43  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.692946  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  37.38 
 
 
302 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3462  ABC transporter-related protein  34.1 
 
 
308 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  34.45 
 
 
308 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2255  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.88 
 
 
305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  33.01 
 
 
305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0918  ABC transporter related  40.33 
 
 
333 aa  173  2.9999999999999996e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.800734 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2645  ABC transporter related  35.48 
 
 
325 aa  173  2.9999999999999996e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0427  ATPase  36.19 
 
 
282 aa  172  5e-42  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.965922 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.35 
 
 
321 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3051  ABC transporter related  32.04 
 
 
309 aa  172  7.999999999999999e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.77 
 
 
312 aa  171  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1357  ABC transporter related  31.44 
 
 
309 aa  171  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0011  ABC transporter, ATP-binding protein  32.45 
 
 
308 aa  169  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1149  ABC transporter related  35.33 
 
 
324 aa  169  5e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.283923  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2486  ATP-binding protein  31.48 
 
 
318 aa  169  6e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  37.39 
 
 
257 aa  169  6e-41  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3211  ABC transporter ATP-binding protein  41.23 
 
 
307 aa  168  1e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00761631  normal  0.0394821 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0256  ABC transporter related protein  30.62 
 
 
308 aa  168  1e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.392742  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1462  ABC transporter related  40.74 
 
 
252 aa  168  1e-40  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.936224  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0130  ABC transporter related  40.91 
 
 
576 aa  167  2e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  37.27 
 
 
259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2980  ABC transporter related  34.31 
 
 
306 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0328  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  32.57 
 
 
339 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.328549  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1257  ABC transporter related  32.48 
 
 
330 aa  166  4e-40  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.298467 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2709  ABC transporter related  34.73 
 
 
298 aa  166  4e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0350953 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3038  ABC transporter related  36.65 
 
 
588 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1900  ABC transporter related  35.41 
 
 
314 aa  166  5.9999999999999996e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3230  ABC transporter related  32.47 
 
 
316 aa  165  6.9999999999999995e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0381022 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2448  ABC transporter-related protein  37.61 
 
 
314 aa  166  6.9999999999999995e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1355  ABC transporter related  34 
 
 
315 aa  165  8e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000405969  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2586  ABC transporter related protein  41.2 
 
 
287 aa  165  8e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1128  ABC transporter related protein  36.16 
 
 
253 aa  165  8e-40  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0998662  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0427  ABC transporter related  38.07 
 
 
317 aa  165  9e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1640  ABC transporter related  38.3 
 
 
287 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  40.09 
 
 
582 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1912  ABC multidrug efflux pump, ATPase subunit  35.31 
 
 
316 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0244419  normal  0.149204 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1891  ABC transporter related  31.41 
 
 
320 aa  164  1.0000000000000001e-39  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572686  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1083  ABC transport system ATPase component  36.79 
 
 
304 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.323648 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18810  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  37.85 
 
 
291 aa  164  2.0000000000000002e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.222917 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3276  ABC transporter related protein  37.1 
 
 
319 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>