More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2644 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2644  ABC transporter, ATPase subunit  100 
 
 
317 aa  645    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3078  ABC transporter, ATP-binding protein  60.39 
 
 
314 aa  381  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.437201  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0682  ABC transporter related  55.37 
 
 
310 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.30246  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0989  ABC transporter related  48.2 
 
 
331 aa  276  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00029019  normal  0.847424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3051  ABC transporter related  42.05 
 
 
309 aa  275  8e-73  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1357  ABC transporter related  43.71 
 
 
309 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2945  ABC transporter related  44.59 
 
 
314 aa  273  2.0000000000000002e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.760604  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  43.99 
 
 
325 aa  273  2.0000000000000002e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2669  ABC transporter related  43.43 
 
 
308 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0475955  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  46.84 
 
 
360 aa  271  9e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1755  ABC transporter related  44.55 
 
 
316 aa  269  4e-71  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.707927  normal  0.143983 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  42.36 
 
 
336 aa  261  1e-68  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  44.9 
 
 
319 aa  258  9e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  43.59 
 
 
315 aa  257  2e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  43.81 
 
 
320 aa  256  4e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  43.81 
 
 
320 aa  256  4e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  44.27 
 
 
310 aa  254  1.0000000000000001e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  44.44 
 
 
331 aa  254  2.0000000000000002e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0003  ABC transporter related  44.69 
 
 
311 aa  250  2e-65  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.445352  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  42.31 
 
 
328 aa  248  1e-64  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2366  ABC transporter related  50 
 
 
317 aa  247  2e-64  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000796281  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  44.13 
 
 
344 aa  247  2e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2645  ABC transporter related  42.43 
 
 
325 aa  247  2e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1163  ABC transporter related  41.58 
 
 
303 aa  244  9.999999999999999e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5380  ABC transporter related protein  45.1 
 
 
322 aa  243  1.9999999999999999e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0478769  normal  0.847068 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  41.4 
 
 
369 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  39.67 
 
 
308 aa  244  1.9999999999999999e-63  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  44.98 
 
 
311 aa  242  6e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  45.42 
 
 
308 aa  241  1e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0585  ABC transporter related  56.62 
 
 
247 aa  240  2e-62  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  41.4 
 
 
315 aa  239  5.999999999999999e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6081  ABC transporter related protein  40.71 
 
 
317 aa  237  2e-61  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  44.23 
 
 
329 aa  235  8e-61  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0087  ABC transporter related  42.07 
 
 
341 aa  234  1.0000000000000001e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  42.11 
 
 
305 aa  229  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  42.72 
 
 
339 aa  226  6e-58  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  48.64 
 
 
236 aa  224  1e-57  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07370  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.33 
 
 
301 aa  224  2e-57  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.171579  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1219  ABC transporter related  39.54 
 
 
299 aa  223  4e-57  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.538125  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1516  ABC transporter related  38.87 
 
 
298 aa  221  9.999999999999999e-57  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  38.61 
 
 
316 aa  220  3e-56  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39220  ABC transporter  41.1 
 
 
306 aa  219  7e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0732588  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  38.59 
 
 
305 aa  216  2.9999999999999998e-55  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_16870  putative ABC transporter ATP-binding protein  41.5 
 
 
307 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2842  ATP-binding protein of ABC transporter  39.1 
 
 
317 aa  214  9.999999999999999e-55  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000492349  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11620  ABC transporter  38.69 
 
 
308 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1397  ABC transporter related  38.99 
 
 
323 aa  213  3.9999999999999995e-54  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1561  ABC transporter, ATP-binding protein  40.07 
 
 
312 aa  210  2e-53  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327811  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  46.9 
 
 
235 aa  211  2e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  48.65 
 
 
240 aa  210  2e-53  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1467  ABC transporter ATP-binding protein  40 
 
 
307 aa  209  7e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.282523  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1068  ABC transporter ATP-binding protein  37.79 
 
 
308 aa  209  7e-53  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  42.58 
 
 
306 aa  208  9e-53  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  40 
 
 
307 aa  207  2e-52  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  37.58 
 
 
309 aa  206  3e-52  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  37.66 
 
 
309 aa  200  1.9999999999999998e-50  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  35.33 
 
 
316 aa  197  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2202  ABC transporter related protein  44.91 
 
 
261 aa  192  5e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  35.83 
 
 
309 aa  192  6e-48  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  35.48 
 
 
316 aa  192  7e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  34.52 
 
 
337 aa  188  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0405  ABC transporter related protein  35.81 
 
 
346 aa  186  3e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1427  ABC transporter related  39.08 
 
 
332 aa  185  8e-46  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1717  ABC transporter related protein  34.82 
 
 
335 aa  181  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  38.67 
 
 
245 aa  180  2e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2485  ABC transporter related protein  35.9 
 
 
304 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3013  ABC transporter related protein  34.68 
 
 
360 aa  180  2.9999999999999997e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.978748  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2467  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.72 
 
 
305 aa  178  1e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  35.74 
 
 
318 aa  178  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  34.95 
 
 
318 aa  177  2e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2909  ABC transporter related  43.93 
 
 
245 aa  177  2e-43  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2709  ABC transporter related  32.35 
 
 
298 aa  176  3e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0350953 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  37.3 
 
 
302 aa  176  3e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3116  ABC transporter related  32.78 
 
 
326 aa  176  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.389623  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1571  ABC transporter, ATPase subunit  43 
 
 
309 aa  175  7e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181605  normal  0.0483556 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  37.29 
 
 
302 aa  174  9.999999999999999e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  39.73 
 
 
257 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3372  bacitracin ABC transporter, ATP-binding protein  34.98 
 
 
331 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.0000344616  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  38.71 
 
 
306 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1468  ABC transporter related  34.27 
 
 
319 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00475192  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  34.98 
 
 
305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1811  ABC transporter related  36.81 
 
 
305 aa  173  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0460716  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  34.3 
 
 
308 aa  173  2.9999999999999996e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  35.57 
 
 
303 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3123  ABC transporter related  35.31 
 
 
313 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.546098  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5657  ABC transporter related protein  42.53 
 
 
258 aa  172  5e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.893177  normal  0.229729 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  35.64 
 
 
311 aa  172  5e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1575  ABC-type transport system, ATPase component  34.98 
 
 
314 aa  172  5.999999999999999e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2980  ABC transporter related  33.55 
 
 
306 aa  172  6.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2586  ABC transporter related protein  34.49 
 
 
287 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1356  ABC transporter related  33.44 
 
 
309 aa  172  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0445843  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  37.29 
 
 
295 aa  172  7.999999999999999e-42  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3707  bacitracin transport ATP-binding protein  34.65 
 
 
303 aa  172  9e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.713768  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3700  antibiotic ABC transporter, ATP-binding protein, putative  34.65 
 
 
331 aa  171  1e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  31.13 
 
 
321 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3421  bacitracin transport ATP-binding protein  34.65 
 
 
331 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000000149175  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0681  ABC transporter related  34.48 
 
 
339 aa  171  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249966  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0264  ABC transporter related  34.97 
 
 
309 aa  171  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1549  ABC transporter related  34.98 
 
 
319 aa  171  1e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.819341  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2963  ABC transporter-like  33.33 
 
 
316 aa  170  2e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.23893  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>