More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2980 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2980  ABC transporter related  100 
 
 
306 aa  620  1e-177  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2709  ABC transporter related  75.87 
 
 
298 aa  454  1.0000000000000001e-126  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0350953 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  63.58 
 
 
341 aa  383  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1427  ABC transporter related  63.78 
 
 
332 aa  370  1e-101  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0395  ABC transporter-related protein  44.37 
 
 
295 aa  246  4.9999999999999997e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  42.86 
 
 
295 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1464  ABC transporter related  43.84 
 
 
293 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.708189  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2285  ABC transporter related  42.76 
 
 
296 aa  230  2e-59  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  36.7 
 
 
305 aa  187  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0363  ABC transporter related  41.52 
 
 
243 aa  186  4e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  35.16 
 
 
310 aa  185  8e-46  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3749  ABC transporter related protein  40.87 
 
 
310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0068  ATPase  35.28 
 
 
329 aa  183  3e-45  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  39.52 
 
 
251 aa  183  3e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0340  ABC transporter related  40.18 
 
 
243 aa  182  8.000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0376  ABC transporter related  41.26 
 
 
339 aa  181  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_125  ABC transporter, type 2, ATP-binding protein  36.01 
 
 
288 aa  181  1e-44  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2672  ABC transporter related  32.2 
 
 
300 aa  181  1e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.425869  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  41.53 
 
 
279 aa  181  2e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  36.1 
 
 
325 aa  181  2e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  35.79 
 
 
293 aa  181  2e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2132  ABC transporter-related protein  39.04 
 
 
245 aa  180  2.9999999999999997e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.76673  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  39.19 
 
 
241 aa  179  4e-44  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2070  ABC transporter-related protein  41.59 
 
 
316 aa  179  5.999999999999999e-44  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.894734  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0405  ABC transporter related protein  37.22 
 
 
346 aa  178  9e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3143  ABC transporter related protein  38.26 
 
 
274 aa  178  1e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0254  ABC transporter related  35.62 
 
 
246 aa  178  1e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0374649  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  37.3 
 
 
344 aa  177  2e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1403  ABC transporter-related protein  35.29 
 
 
296 aa  176  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.357223 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  40.74 
 
 
306 aa  176  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  35.45 
 
 
293 aa  176  4e-43  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  37 
 
 
308 aa  176  5e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0960  ABC transporter related  36.18 
 
 
305 aa  176  5e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0253328  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0253  ABC transporter related  34.97 
 
 
288 aa  176  5e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  37.5 
 
 
318 aa  176  6e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0087  ABC transporter related  40.87 
 
 
341 aa  175  7e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.875685  normal  0.704785 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  40.27 
 
 
369 aa  175  8e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0785  ABC transporter related  33.67 
 
 
300 aa  175  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1150  ABC transporter related  42.27 
 
 
306 aa  175  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2796  ABC transporter related  38.84 
 
 
326 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1571  ABC transporter, ATPase subunit  34.42 
 
 
309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.181605  normal  0.0483556 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4617  ABC transporter related  35.69 
 
 
314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.299444 
 
 
-
 
NC_002936  DET1339  ABC transporter, ATP-binding protein  41.82 
 
 
306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1671  ABC transporter related  34.42 
 
 
316 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0904  ABC transporter-like protein  36.82 
 
 
293 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.212918  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3144  ABC transporter related  34.59 
 
 
306 aa  173  2.9999999999999996e-42  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  33.12 
 
 
316 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  34.39 
 
 
315 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1723  ABC transporter ATP-binding protein  38.36 
 
 
308 aa  173  3.9999999999999995e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  38.81 
 
 
309 aa  172  5e-42  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2644  ABC transporter, ATPase subunit  33.77 
 
 
317 aa  172  5e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1121  ABC transporter, ATP-binding protein  41.82 
 
 
306 aa  172  5e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1046  ABC transporter related  42.45 
 
 
320 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000262053  unclonable  0.00000000321405 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1017  ABC transporter related  42.45 
 
 
320 aa  172  5e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  32.8 
 
 
336 aa  172  5e-42  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00600  ABC transporter, ATP binding component  40.09 
 
 
593 aa  172  5e-42  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.248095  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0600  gliding motility protein  32.87 
 
 
290 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.884739  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2969  ABC transporter related protein  36.96 
 
 
373 aa  172  6.999999999999999e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.297443  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  34.65 
 
 
314 aa  172  9e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  35.69 
 
 
360 aa  172  9e-42  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  37.79 
 
 
328 aa  171  1e-41  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2963  ABC transporter-like  33.55 
 
 
316 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.23893  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  35.69 
 
 
332 aa  170  2e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2181  ABC transporter related  34.97 
 
 
326 aa  170  2e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0740  ABC transporter related  34.14 
 
 
247 aa  171  2e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0259888  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4338  ABC transporter related  32.77 
 
 
303 aa  170  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0107  ABC transporter related  35.87 
 
 
326 aa  170  3e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.208875  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  35.26 
 
 
328 aa  170  3e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  36.04 
 
 
319 aa  169  4e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  37.33 
 
 
328 aa  169  6e-41  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2089  ABC transporter related  43.01 
 
 
288 aa  169  7e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.268618  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4207  ABC transporter related  39.01 
 
 
236 aa  169  8e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2810  ABC transporter related protein  38.79 
 
 
315 aa  168  8e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000850582  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  34.51 
 
 
256 aa  168  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3471  gliding motility-associated ABC transporter ATP- binding subunit GldA  35.88 
 
 
305 aa  168  1e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000514218  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0617  ABC transporter, ATP-binding protein  31.63 
 
 
294 aa  167  2e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1669  ABC transporter related  41.55 
 
 
338 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.700006  hitchhiker  0.00242494 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4068  ABC transporter related  37.02 
 
 
325 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4391  ABC transporter related  41.51 
 
 
319 aa  167  2e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.052423 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0419  ABC transporter related  42.93 
 
 
314 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  decreased coverage  0.00150824  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4618  sodium export ATP-binding protein  31.74 
 
 
294 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  35.25 
 
 
302 aa  167  2.9999999999999998e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1739  ABC transporter related protein  35.09 
 
 
305 aa  166  2.9999999999999998e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.783462 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  34.19 
 
 
356 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0303  ABC transporter related protein  43.5 
 
 
244 aa  167  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0218  ABC transporter related  41.28 
 
 
329 aa  167  2.9999999999999998e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.977972  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  35.76 
 
 
303 aa  167  2.9999999999999998e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1545  ABC-type multidrug transporter, ATP-binding protein; gliding motility-associated protein  33 
 
 
305 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00000116898  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11620  ABC transporter  34.31 
 
 
308 aa  167  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1207  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.07 
 
 
279 aa  167  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  41.4 
 
 
250 aa  166  4e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2586  ABC transporter related protein  38.12 
 
 
287 aa  166  5e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4965  ABC transporter related  34.21 
 
 
304 aa  166  5e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0679  ABC transporter related  44.71 
 
 
253 aa  166  5e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.103832 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1741  ABC transporter related protein  36.53 
 
 
321 aa  166  5.9999999999999996e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2202  ABC transporter related protein  42.59 
 
 
261 aa  166  5.9999999999999996e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1661  ABC transporter related  33.22 
 
 
304 aa  166  5.9999999999999996e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19730  ABC transporter related  39.3 
 
 
252 aa  166  6.9999999999999995e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1397  ABC transporter related  36.82 
 
 
323 aa  165  6.9999999999999995e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25200  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.99 
 
 
317 aa  165  8e-40  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>