More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_0303 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_0303  ABC transporter related protein  100 
 
 
244 aa  483  1e-135  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  45.21 
 
 
309 aa  198  6e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  45 
 
 
309 aa  194  9e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  42.08 
 
 
316 aa  191  7e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3370  ABC transporter, ATP-binding protein  42.41 
 
 
356 aa  190  1e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0614768  decreased coverage  0.00407786 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1837  ABC transporter, ATPase subunit  41.26 
 
 
327 aa  189  2.9999999999999997e-47  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000000368839  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2228  ABC transporter related protein  44.25 
 
 
310 aa  189  5e-47  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  41.82 
 
 
337 aa  189  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1365  ABC transporter related  40.43 
 
 
313 aa  188  7e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0210  ABC transporter related  40.85 
 
 
916 aa  188  8e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.10228  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1501  ABC transporter  41.05 
 
 
313 aa  186  2e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  42.15 
 
 
308 aa  186  2e-46  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  45.54 
 
 
332 aa  186  4e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3800  ABC transporter related  41 
 
 
310 aa  185  7e-46  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0317923 
 
 
-
 
NC_002936  DET1619  ABC transporter, ATP-binding protein  40.61 
 
 
313 aa  184  9e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.54081  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  41.35 
 
 
305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0659  ABC transporter-related protein  43.69 
 
 
293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.696372  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1080  ATPase  39.33 
 
 
275 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3749  ABC transporter related protein  43.75 
 
 
310 aa  184  2.0000000000000003e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2942  ABC transporter related protein  39.66 
 
 
251 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3248  ABC transporter related  39.66 
 
 
235 aa  183  3e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.013922 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  41.63 
 
 
316 aa  182  5.0000000000000004e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1321  ABC transporter-related protein  44.8 
 
 
259 aa  182  5.0000000000000004e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0916068  normal  0.515129 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1546  ABC transporter related protein  41.59 
 
 
341 aa  182  5.0000000000000004e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1033  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  41.38 
 
 
317 aa  181  8.000000000000001e-45  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.100021 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2181  ABC transporter related  41.2 
 
 
326 aa  181  9.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0744  ABC transporter related  40.17 
 
 
332 aa  181  9.000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0297534  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2980  ABC transporter related  43.5 
 
 
306 aa  180  1e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_2014  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40.95 
 
 
317 aa  181  1e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  hitchhiker  0.0000225656  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1526  ABC transporter related protein  44.84 
 
 
305 aa  180  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  42.15 
 
 
318 aa  180  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  42.86 
 
 
303 aa  180  2e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  41.84 
 
 
301 aa  180  2e-44  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3423  ABC transporter related  41.03 
 
 
310 aa  180  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  decreased coverage  0.00331391  normal  0.124939 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1047  ABC transporter, ATP-binding protein  40.35 
 
 
308 aa  179  2.9999999999999997e-44  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0364  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.19 
 
 
334 aa  179  2.9999999999999997e-44  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2875  ABC transporter related  40.64 
 
 
315 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2796  ABC transporter related  44.44 
 
 
326 aa  179  2.9999999999999997e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.982119 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1683  ABC transporter related  40.42 
 
 
314 aa  179  4.999999999999999e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0670  ABC transporter related  45.18 
 
 
318 aa  179  4.999999999999999e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  40.09 
 
 
293 aa  178  5.999999999999999e-44  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0461  ABC transporter related protein  39.32 
 
 
305 aa  178  7e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0227  ABC transporter related protein  42.6 
 
 
304 aa  178  7e-44  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0670  ABC transporter-related protein  45.18 
 
 
318 aa  178  8e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.708326  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0648  ABC transporter related  38.57 
 
 
308 aa  178  8e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  40.95 
 
 
293 aa  178  8e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2557  ABC transporter related  40.66 
 
 
259 aa  178  9e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000637535  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  39.3 
 
 
298 aa  178  9e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0749  ABC transporter related  39.57 
 
 
904 aa  178  9e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.118496  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1717  ABC transporter related protein  42.15 
 
 
335 aa  177  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4686  ABC transporter related  40 
 
 
912 aa  177  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.248247 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2233  ABC transporter related protein  45.33 
 
 
318 aa  177  1e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0193643  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  45 
 
 
308 aa  176  2e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0218  ABC transporter related  44.5 
 
 
329 aa  177  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.977972  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  40.81 
 
 
302 aa  177  2e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2057  ABC transporter related  39.92 
 
 
257 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.01402  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0214  ABC transporter related  39.01 
 
 
303 aa  176  2e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000423562  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04710  ATP-binding ABC transporter family nodulation protein NodI  39.92 
 
 
328 aa  176  3e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.427122  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0222  hypothetical protein  37.67 
 
 
308 aa  176  3e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.238657 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0242  daunorubicin resistance ABC transporter ATP-binding subunit  40.09 
 
 
312 aa  176  3e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00751289  normal  0.894903 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0231  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  40 
 
 
316 aa  176  3e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.158088 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2172  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  39.22 
 
 
317 aa  176  3e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4068  ABC transporter related  48.24 
 
 
325 aa  176  4e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3123  ABC transporter related  46.15 
 
 
313 aa  176  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.546098  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  40 
 
 
307 aa  176  4e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3001  ABC transporter related  37.4 
 
 
585 aa  175  7e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1108  ABC transporter related  37.82 
 
 
255 aa  174  8e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.298542 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  42.08 
 
 
303 aa  175  8e-43  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2518  ABC transporter related  39.74 
 
 
310 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0818783  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4202  ABC transporter related  38.43 
 
 
335 aa  174  9.999999999999999e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.933672  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3251  ABC transporter related  39.55 
 
 
581 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0113  ABC transporter related  37.97 
 
 
241 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0690  ABC transporter related protein  42.04 
 
 
311 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.0475794 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0789  ABC transporter related protein  40.99 
 
 
302 aa  173  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1076  ABC transporter related  40.71 
 
 
308 aa  173  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3674  ABC transporter related protein  45.05 
 
 
309 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1661  ABC transporter related  39.3 
 
 
304 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1665  ABC transporter related  44.8 
 
 
316 aa  174  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148623  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1536  ABC transporter related protein  39.34 
 
 
305 aa  173  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1135  ABC transporter related protein  41.44 
 
 
301 aa  174  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.869398 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0555  ABC transporter, ATP-binding/permease protein  40.5 
 
 
907 aa  173  2.9999999999999996e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1427  ABC transporter related  42.04 
 
 
332 aa  172  2.9999999999999996e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0681  ABC transporter related  44.05 
 
 
339 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249966  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0905  ABC transporter related  42.39 
 
 
250 aa  173  2.9999999999999996e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2421  ABC transporter related  37.55 
 
 
582 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.259147  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2113  ABC transporter related  38.89 
 
 
303 aa  173  2.9999999999999996e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1561  ABC transporter, ATP-binding protein  40 
 
 
312 aa  172  3.9999999999999995e-42  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.327811  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0636  ABC transporter, ATPase subunit  44.74 
 
 
318 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3189  ABC transporter related protein  42.47 
 
 
316 aa  172  3.9999999999999995e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  42.27 
 
 
309 aa  172  3.9999999999999995e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3159  ABC transporter related  42.41 
 
 
259 aa  172  3.9999999999999995e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4697  ABC transporter related  38.74 
 
 
582 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.793973  normal  0.717601 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3104  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  43.3 
 
 
323 aa  172  5e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.54604  hitchhiker  0.0035061 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  42.92 
 
 
311 aa  172  5e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1774  ABC transporter related protein  41.63 
 
 
304 aa  172  5e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1113  ABC transporter related  42.15 
 
 
301 aa  172  5e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.311346  normal  0.550799 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  43.64 
 
 
279 aa  172  5e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4964  ABC transporter related  41.85 
 
 
327 aa  172  5.999999999999999e-42  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.763895  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  44.34 
 
 
307 aa  172  5.999999999999999e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  40.91 
 
 
311 aa  171  6.999999999999999e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>