More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_1665 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_1665  ABC transporter related  100 
 
 		 316 aa  624  1e-178  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148623  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0999  ABC transporter related protein  69.7 
 
 		 300 aa  412  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3201  ABC transporter-like protein  67.34 
 
 		 309 aa  405  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36950  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  70.89 
 
 		 302 aa  405  1.0000000000000001e-112  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369481  normal  0.0795079 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2719  ABC transporter related  66.78 
 
 		 308 aa  396  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4603  ABC transporter related protein  68.75 
 
 		 308 aa  394  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2540  ABC transporter related  66.11 
 
 		 308 aa  396  1e-109  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  0.404548 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5390  ABC transporter related protein  69.79 
 
 		 305 aa  393  1e-108  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2559  ABC transporter related  70.03 
 
 		 309 aa  393  1e-108  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5634  ABC transporter related  68.4 
 
 		 298 aa  383  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3674  ABC transporter related protein  67.81 
 
 		 309 aa  382  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5390  ABC transporter ATP-binding protein  67.36 
 
 		 307 aa  381  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0537  ABC transporter related  64.12 
 
 		 306 aa  374  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2211  ABC transporter related  67.01 
 
 		 312 aa  371  1e-102  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  65.05 
 
 		 308 aa  366  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1757  ABC transporter related  64.38 
 
 		 306 aa  366  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000332956  normal  0.307261 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25800  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  65.97 
 
 		 312 aa  365  1e-100  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  64.86 
 
 		 340 aa  367  1e-100  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11242  tetronasin ABC transporter ATP-binding protein  62.19 
 
 		 311 aa  358  8e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0309392  normal  0.0409812 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2585  ABC transporter related  63.1 
 
 		 302 aa  357  9.999999999999999e-98  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2782  ABC transporter related  62.54 
 
 		 302 aa  356  2.9999999999999997e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.561462  decreased coverage  0.00015802 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  55.33 
 
 		 302 aa  355  6.999999999999999e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1681  ABC transporter related protein  66.67 
 
 		 305 aa  354  1e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283313 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0101  ABC transporter related protein  62.37 
 
 		 299 aa  350  2e-95  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  60.68 
 
 		 337 aa  349  4e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.751927  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0322  ABC transporter related  64.93 
 
 		 302 aa  348  6e-95  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3755  ABC transporter related  60.96 
 
 		 306 aa  348  9e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  55.56 
 
 		 298 aa  344  8.999999999999999e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2618  ABC transporter related  62.2 
 
 		 317 aa  343  2e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000477395  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0251  ABC transporter related protein  60.14 
 
 		 297 aa  338  7e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3997  ABC transporter related  60.48 
 
 		 313 aa  335  5.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4071  ABC transporter related  60.48 
 
 		 313 aa  335  5.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4011  ABC transporter related  60.48 
 
 		 313 aa  335  5.999999999999999e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0155501  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4499  ABC transporter-related protein  60.34 
 
 		 301 aa  331  1e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.151592  normal  0.728129 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2197  ABC transporter related  58.62 
 
 		 300 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0014  ABC transporter related  59.86 
 
 		 300 aa  324  1e-87  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.694421 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6149  ABC transporter related  55.99 
 
 		 328 aa  318  7e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06690  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  55.45 
 
 		 317 aa  307  1.0000000000000001e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22150  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  56.25 
 
 		 324 aa  305  8.000000000000001e-82  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.228771 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1051  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.08 
 
 		 302 aa  290  2e-77  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3296  ABC transporter related  60.83 
 
 		 247 aa  275  8e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2206  ABC transporter related  50.52 
 
 		 307 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758752  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2252  ABC transporter related  50.52 
 
 		 307 aa  254  1.0000000000000001e-66  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.951966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2195  ABC transporter related  50.17 
 
 		 307 aa  251  8.000000000000001e-66  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.144611  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2922  ABC transporter related protein  50.51 
 
 		 304 aa  251  1e-65  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1774  ABC transporter related protein  42.76 
 
 		 304 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3610  ABC transporter, ATP-binding protein  38.7 
 
 		 297 aa  224  1e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000012403  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3351  ABC transporter, ATP-binding protein  38.14 
 
 		 297 aa  224  1e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182827  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3604  ABC transporter, ATP-binding protein  38.14 
 
 		 297 aa  223  3e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.12304e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3388  ABC transporter ATP-binding protein  38.14 
 
 		 297 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.955224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3300  ABC transporter, ATP-binding protein  38.14 
 
 		 297 aa  223  3e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000068812  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3653  ABC transporter ATP-binding protein  38.14 
 
 		 297 aa  223  3e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.169658  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3702  ABC transporter, ATP-binding protein  37.8 
 
 		 297 aa  223  3e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000381067  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3620  ABC transporter, ATP-binding protein  37.8 
 
 		 297 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627092  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0080  ABC transporter related  40.96 
 
 		 305 aa  221  9.999999999999999e-57  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4579  ABC transporter related  39.31 
 
 		 300 aa  221  9.999999999999999e-57  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146186  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1987  ABC transporter, ATP-binding protein  37.24 
 
 		 314 aa  219  5e-56  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00134078  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1615  ABC transporter, ATP-binding protein  36.77 
 
 		 297 aa  218  7.999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.002407  hitchhiker  0.000000022556 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3279  ABC transporter related  37.72 
 
 		 297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00236807  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1634  ABC transporter related  35.64 
 
 		 297 aa  212  4.9999999999999996e-54  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00180587  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7394  ABC transporter ATP-binding protein  43.31 
 
 		 306 aa  208  8e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0022  ABC transporter ATP-binding protein, CesC  34.71 
 
 		 291 aa  207  3e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5524  ABC transporter related protein  42.41 
 
 		 304 aa  206  5e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0353  ABC transporter related  43.45 
 
 		 303 aa  205  6e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  42.28 
 
 		 307 aa  204  2e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4248  ABC transporter related protein  40.44 
 
 		 390 aa  201  1.9999999999999998e-50  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  36.11 
 
 		 293 aa  194  2e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  35.42 
 
 		 293 aa  190  2e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1988  ABC transporter, ATP-binding protein  32.88 
 
 		 293 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000119924  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2985  ABC transporter related protein  41.08 
 
 		 327 aa  190  2.9999999999999997e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1839  ABC transporter related  37.11 
 
 		 339 aa  189  4e-47  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2771  ABC transporter related  38.93 
 
 		 307 aa  186  3e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160437 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1186  ABC transporter related  28.92 
 
 		 290 aa  184  2.0000000000000003e-45  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1245  ABC transporter related protein  36.45 
 
 		 313 aa  176  7e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  31.49 
 
 		 293 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  44.39 
 
 		 250 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2171  ABC transporter related  34.48 
 
 		 299 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  40.72 
 
 		 316 aa  169  6e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  40.07 
 
 		 332 aa  169  7e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0655  ABC transporter, ATP-binding protein  28.52 
 
 		 295 aa  167  2e-40  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0454  ABC transporter related  29.27 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0189  ABC transporter related  37.1 
 
 		 313 aa  164  1.0000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  36.48 
 
 		 309 aa  162  8.000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  35.69 
 
 		 305 aa  161  1e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  37.2 
 
 		 300 aa  160  3e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  38.83 
 
 		 301 aa  159  5e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0303  ABC transporter related protein  44.8 
 
 		 244 aa  159  7e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl255  multidrug ABC transporter ATP-binding component  31.6 
 
 		 247 aa  158  1e-37  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000090688  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0021  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  36.39 
 
 		 321 aa  158  1e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2940  ABC transporter related  40.55 
 
 		 249 aa  158  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  35.57 
 
 		 309 aa  158  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0405  ABC transporter related protein  36.67 
 
 		 346 aa  156  4e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  36.88 
 
 		 300 aa  154  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5034  ABC transporter related protein  42.04 
 
 		 346 aa  155  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  36.77 
 
 		 256 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0134  ABC transporter related  38.18 
 
 		 250 aa  154  2e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0136  ABC transporter related  38.18 
 
 		 250 aa  154  2e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1804  ABC transporter, ATP-binding protein  30.46 
 
 		 312 aa  153  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1841  ABC transporter, ATP-binding protein  30.46 
 
 		 312 aa  153  4e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1639  multidrug ABC transporter, ATP-binding protein  30.46 
 
 		 312 aa  153  4e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000283257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>