More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1681 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1681  ABC transporter related protein  100 
 
 		 305 aa  588  1e-167  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5390  ABC transporter ATP-binding protein  74.09 
 
 		 307 aa  440  9.999999999999999e-123  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0999  ABC transporter related protein  69.86 
 
 		 300 aa  417  9.999999999999999e-116  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5390  ABC transporter related protein  73.38 
 
 		 305 aa  415  9.999999999999999e-116  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36950  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  71.92 
 
 		 302 aa  412  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369481  normal  0.0795079 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2211  ABC transporter related  70.69 
 
 		 312 aa  395  1e-109  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25800  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  68.97 
 
 		 312 aa  392  1e-108  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5634  ABC transporter related  68.04 
 
 		 298 aa  390  1e-107  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2559  ABC transporter related  67.12 
 
 		 309 aa  383  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3201  ABC transporter-like protein  65.64 
 
 		 309 aa  379  1e-104  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11242  tetronasin ABC transporter ATP-binding protein  62.85 
 
 		 311 aa  379  1e-104  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0309392  normal  0.0409812 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2540  ABC transporter related  65.53 
 
 		 308 aa  371  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  0.404548 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1665  ABC transporter related  66.67 
 
 		 316 aa  368  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148623  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4603  ABC transporter related protein  64.78 
 
 		 308 aa  367  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0537  ABC transporter related  64.51 
 
 		 306 aa  367  1e-100  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2719  ABC transporter related  64.24 
 
 		 308 aa  366  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0322  ABC transporter related  63.27 
 
 		 302 aa  360  1e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3674  ABC transporter related protein  63.46 
 
 		 309 aa  361  1e-98  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  63.23 
 
 		 308 aa  357  9.999999999999999e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2782  ABC transporter related  62.89 
 
 		 302 aa  355  5e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.561462  decreased coverage  0.00015802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2585  ABC transporter related  60.73 
 
 		 302 aa  353  2e-96  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6149  ABC transporter related  60.25 
 
 		 328 aa  348  6e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0101  ABC transporter related protein  61.82 
 
 		 299 aa  347  1e-94  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  60.07 
 
 		 340 aa  348  1e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1757  ABC transporter related  60.76 
 
 		 306 aa  345  4e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000332956  normal  0.307261 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0251  ABC transporter related protein  63.42 
 
 		 297 aa  343  2e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3755  ABC transporter related  61.11 
 
 		 306 aa  338  5.9999999999999996e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2618  ABC transporter related  62.8 
 
 		 317 aa  338  5.9999999999999996e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000477395  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  59.86 
 
 		 337 aa  334  9e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.751927  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4499  ABC transporter-related protein  58.14 
 
 		 301 aa  331  9e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.151592  normal  0.728129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3997  ABC transporter related  57.29 
 
 		 313 aa  325  6e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4071  ABC transporter related  57.29 
 
 		 313 aa  325  6e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4011  ABC transporter related  57.29 
 
 		 313 aa  325  6e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0155501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2197  ABC transporter related  56.66 
 
 		 300 aa  325  7e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22150  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  58.55 
 
 		 324 aa  324  1e-87  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.228771 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  50 
 
 		 298 aa  324  1e-87  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  50.35 
 
 		 302 aa  317  2e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0014  ABC transporter related  58.08 
 
 		 300 aa  317  2e-85  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.694421 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06690  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  58.31 
 
 		 317 aa  301  6.000000000000001e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1051  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  46.27 
 
 		 302 aa  276  3e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3296  ABC transporter related  57.14 
 
 		 247 aa  264  1e-69  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2206  ABC transporter related  52.2 
 
 		 307 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758752  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2252  ABC transporter related  52.2 
 
 		 307 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.951966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2195  ABC transporter related  51.86 
 
 		 307 aa  258  6e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.144611  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2922  ABC transporter related protein  54.11 
 
 		 304 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4579  ABC transporter related  42.18 
 
 		 300 aa  244  9.999999999999999e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146186  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1774  ABC transporter related protein  44.07 
 
 		 304 aa  237  2e-61  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3279  ABC transporter related  39.53 
 
 		 297 aa  224  1e-57  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00236807  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3610  ABC transporter, ATP-binding protein  39.26 
 
 		 297 aa  223  2e-57  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000012403  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3351  ABC transporter, ATP-binding protein  39.26 
 
 		 297 aa  223  3e-57  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182827  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3388  ABC transporter ATP-binding protein  39.26 
 
 		 297 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.955224  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3620  ABC transporter, ATP-binding protein  38.93 
 
 		 297 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627092  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3300  ABC transporter, ATP-binding protein  39.26 
 
 		 297 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000068812  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3653  ABC transporter ATP-binding protein  39.26 
 
 		 297 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.169658  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3604  ABC transporter, ATP-binding protein  39.26 
 
 		 297 aa  222  4.9999999999999996e-57  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.12304e-23 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3702  ABC transporter, ATP-binding protein  39.38 
 
 		 297 aa  222  8e-57  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000381067  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0353  ABC transporter related  46.64 
 
 		 303 aa  221  9.999999999999999e-57  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1615  ABC transporter, ATP-binding protein  39.38 
 
 		 297 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.002407  hitchhiker  0.000000022556 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1634  ABC transporter related  36.64 
 
 		 297 aa  209  4e-53  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00180587  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5524  ABC transporter related protein  42.57 
 
 		 304 aa  209  4e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  38.44 
 
 		 293 aa  208  7e-53  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4248  ABC transporter related protein  42.3 
 
 		 390 aa  206  4e-52  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  38.75 
 
 		 293 aa  206  5e-52  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7394  ABC transporter ATP-binding protein  43.92 
 
 		 306 aa  205  8e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  41.22 
 
 		 307 aa  202  5e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1987  ABC transporter, ATP-binding protein  33.77 
 
 		 314 aa  200  3e-50  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00134078  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0022  ABC transporter ATP-binding protein, CesC  33.22 
 
 		 291 aa  198  1.0000000000000001e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0080  ABC transporter related  39.34 
 
 		 305 aa  198  1.0000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1839  ABC transporter related  39.76 
 
 		 339 aa  197  2.0000000000000003e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2771  ABC transporter related  40.13 
 
 		 307 aa  193  3e-48  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160437 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1988  ABC transporter, ATP-binding protein  32.76 
 
 		 293 aa  191  1e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000119924  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  32.76 
 
 		 293 aa  191  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1186  ABC transporter related  28.28 
 
 		 290 aa  189  4e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  42.58 
 
 		 318 aa  188  1e-46  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2171  ABC transporter related  36.07 
 
 		 299 aa  187  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  40.33 
 
 		 305 aa  182  5.0000000000000004e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0454  ABC transporter related  31.36 
 
 		 286 aa  182  6e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0405  ABC transporter related protein  41.16 
 
 		 346 aa  178  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3189  ABC transporter related protein  39.87 
 
 		 316 aa  177  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3201  ABC transporter related  37.79 
 
 		 303 aa  177  2e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.528814  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2985  ABC transporter related protein  39.18 
 
 		 327 aa  176  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  40.38 
 
 		 332 aa  176  3e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  37.29 
 
 		 309 aa  176  6e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2940  ABC transporter related  45.65 
 
 		 249 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2644  ABC transporter related  37.87 
 
 		 334 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  35.95 
 
 		 316 aa  172  6.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  40.67 
 
 		 298 aa  171  1e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0360  ABC transporter related  39.46 
 
 		 300 aa  171  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00137885 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30210  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  38.44 
 
 		 326 aa  168  1e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816797  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  38.36 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0660  ABC transporter related  36.64 
 
 		 313 aa  167  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.946314  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1575  ABC-type transport system, ATPase component  38.1 
 
 		 314 aa  166  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  36.54 
 
 		 310 aa  166  5e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  38.87 
 
 		 316 aa  166  5.9999999999999996e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  38.87 
 
 		 256 aa  166  5.9999999999999996e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0189  ABC transporter related  38.39 
 
 		 313 aa  165  6.9999999999999995e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3951  ABC transporter related  40 
 
 		 300 aa  165  8e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.445411 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2867  ABC transporter related  35.92 
 
 		 318 aa  165  8e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.599491 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5034  ABC transporter related protein  36.25 
 
 		 346 aa  164  1.0000000000000001e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1642  ABC transporter related protein  41.16 
 
 		 323 aa  165  1.0000000000000001e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>