More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5634 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_5634  ABC transporter related  100 
 
 		 298 aa  589  1e-167  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5390  ABC transporter related protein  73.31 
 
 		 305 aa  429  1e-119  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0999  ABC transporter related protein  70.79 
 
 		 300 aa  412  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5390  ABC transporter ATP-binding protein  70.31 
 
 		 307 aa  411  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36950  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  71.48 
 
 		 302 aa  411  1e-114  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369481  normal  0.0795079 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2559  ABC transporter related  70.24 
 
 		 309 aa  403  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0537  ABC transporter related  68.21 
 
 		 306 aa  388  1e-107  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3201  ABC transporter-like protein  65.65 
 
 		 309 aa  390  1e-107  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1665  ABC transporter related  68.4 
 
 		 316 aa  383  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148623  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1681  ABC transporter related protein  68.04 
 
 		 305 aa  374  1e-103  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.283313 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25800  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  64.95 
 
 		 312 aa  375  1e-103  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11242  tetronasin ABC transporter ATP-binding protein  62.5 
 
 		 311 aa  377  1e-103  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0309392  normal  0.0409812 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3674  ABC transporter related protein  64.19 
 
 		 309 aa  373  1e-102  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2719  ABC transporter related  65.97 
 
 		 308 aa  373  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2540  ABC transporter related  65.62 
 
 		 308 aa  373  1e-102  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  0.404548 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4603  ABC transporter related protein  65.07 
 
 		 308 aa  370  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2211  ABC transporter related  64.29 
 
 		 312 aa  366  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  61.41 
 
 		 340 aa  361  7.0000000000000005e-99  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0322  ABC transporter related  62.84 
 
 		 302 aa  359  4e-98  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  63.7 
 
 		 308 aa  358  7e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2782  ABC transporter related  61.62 
 
 		 302 aa  355  7.999999999999999e-97  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.561462  decreased coverage  0.00015802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2585  ABC transporter related  61.07 
 
 		 302 aa  351  1e-95  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6149  ABC transporter related  58.41 
 
 		 328 aa  350  2e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0251  ABC transporter related protein  61.82 
 
 		 297 aa  350  2e-95  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1757  ABC transporter related  60.07 
 
 		 306 aa  342  5e-93  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000332956  normal  0.307261 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0101  ABC transporter related protein  61.11 
 
 		 299 aa  339  2.9999999999999998e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2618  ABC transporter related  60.07 
 
 		 317 aa  337  9.999999999999999e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000477395  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  53.74 
 
 		 298 aa  337  9.999999999999999e-92  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2197  ABC transporter related  57.53 
 
 		 300 aa  336  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3755  ABC transporter related  59.45 
 
 		 306 aa  335  3.9999999999999995e-91  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4499  ABC transporter-related protein  57.82 
 
 		 301 aa  330  3e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.151592  normal  0.728129 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  59.86 
 
 		 337 aa  328  7e-89  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.751927  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3997  ABC transporter related  58.45 
 
 		 313 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4071  ABC transporter related  58.45 
 
 		 313 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4011  ABC transporter related  58.45 
 
 		 313 aa  327  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0155501  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  52.92 
 
 		 302 aa  325  7e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22150  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  55.84 
 
 		 324 aa  313  2.9999999999999996e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.228771 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06690  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  58.9 
 
 		 317 aa  312  4.999999999999999e-84  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0014  ABC transporter related  57.04 
 
 		 300 aa  310  2e-83  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.694421 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1051  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  50.18 
 
 		 302 aa  298  5e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3296  ABC transporter related  60.55 
 
 		 247 aa  276  3e-73  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2206  ABC transporter related  49.5 
 
 		 307 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758752  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2252  ABC transporter related  49.5 
 
 		 307 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.951966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2195  ABC transporter related  49.17 
 
 		 307 aa  261  1e-68  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.144611  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2922  ABC transporter related protein  50.17 
 
 		 304 aa  252  6e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4579  ABC transporter related  39.53 
 
 		 300 aa  231  1e-59  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146186  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1774  ABC transporter related protein  40.13 
 
 		 304 aa  223  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3279  ABC transporter related  37.16 
 
 		 297 aa  214  9.999999999999999e-55  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00236807  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3610  ABC transporter, ATP-binding protein  37.54 
 
 		 297 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000012403  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3351  ABC transporter, ATP-binding protein  35.37 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182827  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3620  ABC transporter, ATP-binding protein  35.71 
 
 		 297 aa  211  1e-53  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627092  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3604  ABC transporter, ATP-binding protein  35.37 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.12304e-23 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3388  ABC transporter ATP-binding protein  35.37 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.955224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3300  ABC transporter, ATP-binding protein  35.37 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000068812  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3653  ABC transporter ATP-binding protein  35.37 
 
 		 297 aa  210  2e-53  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.169658  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3702  ABC transporter, ATP-binding protein  36.49 
 
 		 297 aa  211  2e-53  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000381067  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1615  ABC transporter, ATP-binding protein  36.43 
 
 		 297 aa  211  2e-53  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.002407  hitchhiker  0.000000022556 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7394  ABC transporter ATP-binding protein  42 
 
 		 306 aa  209  5e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5524  ABC transporter related protein  42.57 
 
 		 304 aa  207  2e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0353  ABC transporter related  41.87 
 
 		 303 aa  206  4e-52  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2171  ABC transporter related  36.21 
 
 		 299 aa  197  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4248  ABC transporter related protein  40.74 
 
 		 390 aa  197  2.0000000000000003e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  38.51 
 
 		 307 aa  195  7e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  34.47 
 
 		 293 aa  195  7e-49  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  35.05 
 
 		 293 aa  193  3e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0080  ABC transporter related  38.41 
 
 		 305 aa  192  5e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1634  ABC transporter related  32.76 
 
 		 297 aa  191  9e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00180587  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1987  ABC transporter, ATP-binding protein  34.23 
 
 		 314 aa  191  2e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00134078  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0022  ABC transporter ATP-binding protein, CesC  32.88 
 
 		 291 aa  190  2e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1186  ABC transporter related  30.21 
 
 		 290 aa  189  5.999999999999999e-47  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1988  ABC transporter, ATP-binding protein  31.72 
 
 		 293 aa  185  8e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000119924  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2771  ABC transporter related  36.33 
 
 		 307 aa  181  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160437 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1839  ABC transporter related  36.62 
 
 		 339 aa  179  4e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  30.64 
 
 		 293 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  40.2 
 
 		 305 aa  178  1e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2940  ABC transporter related  46.4 
 
 		 249 aa  177  2e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0454  ABC transporter related  31.36 
 
 		 286 aa  177  3e-43  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  37.83 
 
 		 332 aa  171  1e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  43.04 
 
 		 250 aa  170  2e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1082  ABC transporter related  35.26 
 
 		 309 aa  167  2e-40  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2985  ABC transporter related protein  37.18 
 
 		 327 aa  166  4e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3189  ABC transporter related protein  38.51 
 
 		 316 aa  166  5.9999999999999996e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0655  ABC transporter, ATP-binding protein  29.83 
 
 		 295 aa  164  1.0000000000000001e-39  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  36.84 
 
 		 303 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  35.86 
 
 		 310 aa  164  2.0000000000000002e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  34.87 
 
 		 309 aa  163  3e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2644  ABC transporter related  37.7 
 
 		 334 aa  162  7e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1245  ABC transporter related protein  35.29 
 
 		 313 aa  162  7e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl255  multidrug ABC transporter ATP-binding component  35.21 
 
 		 247 aa  161  1e-38  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000090688  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3642  ABC transporter related protein  37.13 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1526  ABC transporter related protein  36.7 
 
 		 305 aa  160  3e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0145  ABC transporter related  33.68 
 
 		 295 aa  160  3e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0967597  decreased coverage  0.0026708 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2228  ABC transporter related protein  37.79 
 
 		 310 aa  159  5e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.440209  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  37.15 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  45.25 
 
 		 318 aa  157  3e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  44.6 
 
 		 316 aa  156  3e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  43.89 
 
 		 279 aa  156  4e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0405  ABC transporter related protein  36.03 
 
 		 346 aa  155  7e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1575  ABC-type transport system, ATPase component  35.41 
 
 		 314 aa  155  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0189  ABC transporter related  35.89 
 
 		 313 aa  154  1e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>