More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_22150 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_22150  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  100 
 
 
324 aa  636    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.228771 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2618  ABC transporter related  63.44 
 
 
317 aa  379  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000477395  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  60.77 
 
 
308 aa  343  2.9999999999999997e-93  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5390  ABC transporter related protein  59.47 
 
 
305 aa  341  1e-92  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0999  ABC transporter related protein  57.28 
 
 
300 aa  337  1.9999999999999998e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5390  ABC transporter ATP-binding protein  57.81 
 
 
307 aa  325  6e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11242  tetronasin ABC transporter ATP-binding protein  55.05 
 
 
311 aa  324  1e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0309392  normal  0.0409812 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0251  ABC transporter related protein  55.96 
 
 
297 aa  321  9.999999999999999e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36950  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  58.61 
 
 
302 aa  319  3e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369481  normal  0.0795079 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25800  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  56.56 
 
 
312 aa  320  3e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2540  ABC transporter related  56.17 
 
 
308 aa  319  5e-86  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  0.404548 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5634  ABC transporter related  56.82 
 
 
298 aa  316  3e-85  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2559  ABC transporter related  55.96 
 
 
309 aa  316  4e-85  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2719  ABC transporter related  56.39 
 
 
308 aa  316  4e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0537  ABC transporter related  56.91 
 
 
306 aa  315  7e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06690  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  57.61 
 
 
317 aa  315  9e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3201  ABC transporter-like protein  56.15 
 
 
309 aa  314  1.9999999999999998e-84  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  56.21 
 
 
340 aa  313  2.9999999999999996e-84  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2782  ABC transporter related  55.45 
 
 
302 aa  310  2e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.561462  decreased coverage  0.00015802 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1681  ABC transporter related protein  58.55 
 
 
305 aa  310  2e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.283313 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3674  ABC transporter related protein  57.14 
 
 
309 aa  310  2.9999999999999997e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0322  ABC transporter related  55.13 
 
 
302 aa  306  3e-82  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0101  ABC transporter related protein  55.26 
 
 
299 aa  306  3e-82  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3997  ABC transporter related  52.94 
 
 
313 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4071  ABC transporter related  52.94 
 
 
313 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146154  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4011  ABC transporter related  52.94 
 
 
313 aa  306  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0155501  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1665  ABC transporter related  56.25 
 
 
316 aa  305  7e-82  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148623  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2585  ABC transporter related  54.25 
 
 
302 aa  305  9.000000000000001e-82  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4499  ABC transporter-related protein  53.07 
 
 
301 aa  303  3.0000000000000004e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.151592  normal  0.728129 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2211  ABC transporter related  56.62 
 
 
312 aa  302  4.0000000000000003e-81  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2197  ABC transporter related  52.09 
 
 
300 aa  302  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  48.2 
 
 
298 aa  299  4e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6149  ABC transporter related  53.31 
 
 
328 aa  295  7e-79  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4603  ABC transporter related protein  53.62 
 
 
308 aa  295  7e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3755  ABC transporter related  54.79 
 
 
306 aa  292  4e-78  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  47.18 
 
 
302 aa  292  4e-78  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1757  ABC transporter related  52.16 
 
 
306 aa  292  7e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000332956  normal  0.307261 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  52.33 
 
 
337 aa  284  1.0000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.751927  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0014  ABC transporter related  52.44 
 
 
300 aa  282  5.000000000000001e-75  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.694421 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1051  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  50 
 
 
302 aa  276  5e-73  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2922  ABC transporter related protein  50.16 
 
 
304 aa  244  9.999999999999999e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3296  ABC transporter related  53.18 
 
 
247 aa  235  6e-61  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2206  ABC transporter related  47.12 
 
 
307 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758752  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2252  ABC transporter related  47.12 
 
 
307 aa  235  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.951966  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2195  ABC transporter related  46.2 
 
 
307 aa  234  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.144611  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1774  ABC transporter related protein  40.45 
 
 
304 aa  211  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5524  ABC transporter related protein  42.21 
 
 
304 aa  206  3e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4579  ABC transporter related  35.71 
 
 
300 aa  205  1e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146186  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2771  ABC transporter related  40 
 
 
307 aa  201  1.9999999999999998e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160437 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4248  ABC transporter related protein  40.19 
 
 
390 aa  197  1.0000000000000001e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7394  ABC transporter ATP-binding protein  40.51 
 
 
306 aa  196  5.000000000000001e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  40.82 
 
 
307 aa  196  6e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  34.44 
 
 
293 aa  196  7e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  35.43 
 
 
293 aa  194  1e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3702  ABC transporter, ATP-binding protein  36.42 
 
 
297 aa  194  2e-48  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000381067  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3351  ABC transporter, ATP-binding protein  36.09 
 
 
297 aa  193  3e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182827  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3388  ABC transporter ATP-binding protein  36.09 
 
 
297 aa  192  5e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.955224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3300  ABC transporter, ATP-binding protein  36.09 
 
 
297 aa  192  5e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000068812  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3653  ABC transporter ATP-binding protein  36.09 
 
 
297 aa  192  5e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.169658  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3604  ABC transporter, ATP-binding protein  36.09 
 
 
297 aa  192  5e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.12304e-23 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3610  ABC transporter, ATP-binding protein  36.42 
 
 
297 aa  192  9e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000012403  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3620  ABC transporter, ATP-binding protein  40.08 
 
 
297 aa  191  1e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627092  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1615  ABC transporter, ATP-binding protein  35.76 
 
 
297 aa  191  2e-47  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.002407  hitchhiker  0.000000022556 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3279  ABC transporter related  35.76 
 
 
297 aa  189  4e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00236807  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0080  ABC transporter related  36.42 
 
 
305 aa  184  1.0000000000000001e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0353  ABC transporter related  39.68 
 
 
303 aa  182  6e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  31.91 
 
 
293 aa  179  4.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0405  ABC transporter related protein  39.61 
 
 
346 aa  177  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  37.62 
 
 
309 aa  177  3e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1987  ABC transporter, ATP-binding protein  38.14 
 
 
314 aa  175  7e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00134078  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1634  ABC transporter related  33.33 
 
 
297 aa  172  6.999999999999999e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00180587  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2985  ABC transporter related protein  38.44 
 
 
327 aa  172  9e-42  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  40.88 
 
 
318 aa  172  1e-41  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0022  ABC transporter ATP-binding protein, CesC  30.92 
 
 
291 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0454  ABC transporter related  29.14 
 
 
286 aa  170  3e-41  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  39.3 
 
 
332 aa  168  1e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  38.61 
 
 
305 aa  166  4e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2171  ABC transporter related  37.79 
 
 
299 aa  165  9e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  37.93 
 
 
303 aa  165  9e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4078  ABC transporter related  39.94 
 
 
326 aa  165  1.0000000000000001e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1624  ABC transporter related protein  38.17 
 
 
309 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0610867  normal  0.950566 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5034  ABC transporter related protein  43.11 
 
 
346 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1642  ABC transporter related protein  37.66 
 
 
323 aa  164  3e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  45.29 
 
 
316 aa  164  3e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  34.74 
 
 
310 aa  163  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1988  ABC transporter, ATP-binding protein  35.19 
 
 
293 aa  162  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000119924  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  41.89 
 
 
259 aa  162  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  42.37 
 
 
301 aa  162  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3642  ABC transporter related protein  36.53 
 
 
310 aa  162  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  39.19 
 
 
256 aa  160  2e-38  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2940  ABC transporter related  44.91 
 
 
249 aa  160  3e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2644  ABC transporter related  35.46 
 
 
334 aa  160  3e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1186  ABC transporter related  24.43 
 
 
290 aa  159  8e-38  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  43.18 
 
 
250 aa  158  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1245  ABC transporter related protein  34.76 
 
 
313 aa  158  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0227  ABC transporter related protein  38.26 
 
 
304 aa  157  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4093  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.56 
 
 
312 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.132087  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1082  ABC transporter related  36.66 
 
 
309 aa  157  3e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124615  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1526  ABC transporter related protein  42.74 
 
 
305 aa  157  3e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  34.71 
 
 
316 aa  157  3e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>