More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_4071 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3997  ABC transporter related  100 
 
 
313 aa  623  1e-177  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4071  ABC transporter related  100 
 
 
313 aa  623  1e-177  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146154  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4011  ABC transporter related  100 
 
 
313 aa  623  1e-177  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0155501  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4499  ABC transporter-related protein  79.32 
 
 
301 aa  473  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.151592  normal  0.728129 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2197  ABC transporter related  76.51 
 
 
300 aa  454  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0537  ABC transporter related  65.99 
 
 
306 aa  381  1e-104  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2540  ABC transporter related  63.95 
 
 
308 aa  369  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  0.404548 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3674  ABC transporter related protein  66.89 
 
 
309 aa  370  1e-101  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2719  ABC transporter related  63.14 
 
 
308 aa  362  4e-99  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  61.77 
 
 
308 aa  357  9.999999999999999e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  63.18 
 
 
340 aa  357  1.9999999999999998e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3755  ABC transporter related  61.11 
 
 
306 aa  349  3e-95  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1757  ABC transporter related  61.28 
 
 
306 aa  345  5e-94  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000332956  normal  0.307261 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0999  ABC transporter related protein  58.42 
 
 
300 aa  343  2e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11242  tetronasin ABC transporter ATP-binding protein  59.66 
 
 
311 aa  343  2.9999999999999997e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0309392  normal  0.0409812 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3201  ABC transporter-like protein  61.86 
 
 
309 aa  342  4e-93  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2559  ABC transporter related  60.07 
 
 
309 aa  341  1e-92  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2585  ABC transporter related  61.03 
 
 
302 aa  338  5e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1665  ABC transporter related  60.48 
 
 
316 aa  335  5.999999999999999e-91  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148623  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5390  ABC transporter related protein  59.45 
 
 
305 aa  333  2e-90  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  52.04 
 
 
298 aa  333  2e-90  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2782  ABC transporter related  59.59 
 
 
302 aa  333  3e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.561462  decreased coverage  0.00015802 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36950  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  60.48 
 
 
302 aa  330  1e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369481  normal  0.0795079 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5390  ABC transporter ATP-binding protein  59.04 
 
 
307 aa  330  2e-89  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5634  ABC transporter related  58.45 
 
 
298 aa  327  1.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  58.98 
 
 
337 aa  325  6e-88  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.751927  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2211  ABC transporter related  58.98 
 
 
312 aa  322  5e-87  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0251  ABC transporter related protein  60.47 
 
 
297 aa  322  7e-87  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  53.12 
 
 
302 aa  321  9.000000000000001e-87  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4603  ABC transporter related protein  58.62 
 
 
308 aa  318  6e-86  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0101  ABC transporter related protein  56.71 
 
 
299 aa  317  1e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0322  ABC transporter related  58.02 
 
 
302 aa  317  2e-85  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25800  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  54.92 
 
 
312 aa  315  7e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2618  ABC transporter related  57 
 
 
317 aa  313  1.9999999999999998e-84  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000477395  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1681  ABC transporter related protein  57.29 
 
 
305 aa  312  4.999999999999999e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.283313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6149  ABC transporter related  52.4 
 
 
328 aa  302  6.000000000000001e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22150  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  52.01 
 
 
324 aa  301  8.000000000000001e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.228771 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0014  ABC transporter related  56.36 
 
 
300 aa  301  8.000000000000001e-81  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.694421 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1051  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.64 
 
 
302 aa  285  5e-76  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06690  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  53.18 
 
 
317 aa  284  1.0000000000000001e-75  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3296  ABC transporter related  61.82 
 
 
247 aa  283  3.0000000000000004e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2922  ABC transporter related protein  49.48 
 
 
304 aa  240  2.9999999999999997e-62  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2206  ABC transporter related  46.08 
 
 
307 aa  239  4e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758752  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2252  ABC transporter related  46.08 
 
 
307 aa  239  4e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.951966  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2195  ABC transporter related  45.75 
 
 
307 aa  236  3e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.144611  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4579  ABC transporter related  36.39 
 
 
300 aa  210  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146186  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1774  ABC transporter related protein  39.39 
 
 
304 aa  208  8e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4248  ABC transporter related protein  42.07 
 
 
390 aa  208  8e-53  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3610  ABC transporter, ATP-binding protein  34.95 
 
 
297 aa  202  9e-51  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000012403  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1634  ABC transporter related  34.01 
 
 
297 aa  201  1.9999999999999998e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00180587  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3279  ABC transporter related  33.9 
 
 
297 aa  199  5e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00236807  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0080  ABC transporter related  38.78 
 
 
305 aa  199  7e-50  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3351  ABC transporter, ATP-binding protein  34.26 
 
 
297 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182827  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0353  ABC transporter related  40.21 
 
 
303 aa  198  7.999999999999999e-50  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3702  ABC transporter, ATP-binding protein  34.36 
 
 
297 aa  198  7.999999999999999e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000381067  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3388  ABC transporter ATP-binding protein  34.26 
 
 
297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.955224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3300  ABC transporter, ATP-binding protein  34.26 
 
 
297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000068812  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3653  ABC transporter ATP-binding protein  34.26 
 
 
297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.169658  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  38.59 
 
 
307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3620  ABC transporter, ATP-binding protein  34.36 
 
 
297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627092  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3604  ABC transporter, ATP-binding protein  34.26 
 
 
297 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.12304e-23 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1615  ABC transporter, ATP-binding protein  33.68 
 
 
297 aa  195  7e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.002407  hitchhiker  0.000000022556 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  34.83 
 
 
293 aa  193  3e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  35.17 
 
 
293 aa  192  6e-48  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2771  ABC transporter related  38.41 
 
 
307 aa  187  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160437 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1987  ABC transporter, ATP-binding protein  31.77 
 
 
314 aa  183  3e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00134078  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0655  ABC transporter, ATP-binding protein  31.74 
 
 
295 aa  182  7e-45  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2985  ABC transporter related protein  39.68 
 
 
327 aa  178  1e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0993  copper ABC transporter, ATP-binding protein  39.87 
 
 
304 aa  178  1e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193362  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2257  putative copper-related ABC transport system, ATP-binding protein  39.87 
 
 
747 aa  177  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2062  copper ABC transporter, ATP-binding protein  39.87 
 
 
309 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.947517  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2117  copper ABC transporter, ATP-binding protein  39.87 
 
 
304 aa  178  1e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5524  ABC transporter related protein  39.67 
 
 
304 aa  178  1e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0022  ABC transporter ATP-binding protein, CesC  31.74 
 
 
291 aa  176  4e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1245  ABC transporter related protein  34.7 
 
 
313 aa  175  8e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1186  ABC transporter related  28.37 
 
 
290 aa  174  9.999999999999999e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  40.09 
 
 
256 aa  174  9.999999999999999e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0454  ABC transporter related  30.8 
 
 
286 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5742  ABC transporter related protein  38.44 
 
 
319 aa  169  4e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.949335  normal  0.710404 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2171  ABC transporter related  35.56 
 
 
299 aa  169  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2323  copper ABC transporter, ATP-binding protein  38.96 
 
 
304 aa  168  1e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.797197  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  37.29 
 
 
305 aa  168  1e-40  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7394  ABC transporter ATP-binding protein  40.14 
 
 
306 aa  168  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  30.24 
 
 
293 aa  167  2e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  42.48 
 
 
250 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1839  ABC transporter related  36.14 
 
 
339 aa  166  2.9999999999999998e-40  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2859  ABC transporter related  40.93 
 
 
301 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  38.99 
 
 
309 aa  167  2.9999999999999998e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3570  ABC transporter, ATPase subunit  38.94 
 
 
259 aa  166  6.9999999999999995e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.339231  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3402  ABC transporter-related protein  33.22 
 
 
322 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00371017  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0218  ABC transporter related  37.79 
 
 
329 aa  165  8e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.977972  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0189  ABC transporter related  31.29 
 
 
313 aa  165  1.0000000000000001e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5034  ABC transporter related protein  41.48 
 
 
346 aa  163  3e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.199479 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1988  ABC transporter, ATP-binding protein  30.07 
 
 
293 aa  163  4.0000000000000004e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000119924  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  37.58 
 
 
332 aa  163  4.0000000000000004e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  37.5 
 
 
298 aa  162  8.000000000000001e-39  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02610  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  38.76 
 
 
341 aa  161  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.737934  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  35.41 
 
 
303 aa  160  3e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0919  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  35.35 
 
 
342 aa  159  5e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  38.74 
 
 
318 aa  159  5e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>