More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_2782 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_2782  ABC transporter related  100 
 
 
302 aa  594  1e-169  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.561462  decreased coverage  0.00015802 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2585  ABC transporter related  90.73 
 
 
302 aa  541  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3201  ABC transporter-like protein  68.71 
 
 
309 aa  404  1.0000000000000001e-112  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0999  ABC transporter related protein  67.92 
 
 
300 aa  393  1e-108  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0537  ABC transporter related  65.65 
 
 
306 aa  384  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36950  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  67.45 
 
 
302 aa  385  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369481  normal  0.0795079 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3674  ABC transporter related protein  65.76 
 
 
309 aa  382  1e-105  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  64.45 
 
 
340 aa  376  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5390  ABC transporter related protein  63.49 
 
 
305 aa  376  1e-103  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2211  ABC transporter related  67.01 
 
 
312 aa  375  1e-103  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2540  ABC transporter related  67.01 
 
 
308 aa  376  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  0.404548 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1757  ABC transporter related  63.39 
 
 
306 aa  377  1e-103  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000332956  normal  0.307261 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2719  ABC transporter related  67.01 
 
 
308 aa  374  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3755  ABC transporter related  63.61 
 
 
306 aa  373  1e-102  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4603  ABC transporter related protein  65.89 
 
 
308 aa  368  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2559  ABC transporter related  66.67 
 
 
309 aa  370  1e-101  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11242  tetronasin ABC transporter ATP-binding protein  62 
 
 
311 aa  365  1e-100  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0309392  normal  0.0409812 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5390  ABC transporter ATP-binding protein  64.26 
 
 
307 aa  366  1e-100  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  63.92 
 
 
308 aa  363  3e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1665  ABC transporter related  62.54 
 
 
316 aa  356  2.9999999999999997e-97  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148623  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25800  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  62.46 
 
 
312 aa  356  2.9999999999999997e-97  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5634  ABC transporter related  61.62 
 
 
298 aa  355  7.999999999999999e-97  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0251  ABC transporter related protein  63.61 
 
 
297 aa  353  2e-96  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  54.17 
 
 
298 aa  350  1e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0014  ABC transporter related  65.74 
 
 
300 aa  348  6e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.694421 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  55.4 
 
 
302 aa  344  1e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0322  ABC transporter related  61.64 
 
 
302 aa  343  2.9999999999999997e-93  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1681  ABC transporter related protein  62.89 
 
 
305 aa  340  2e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.283313 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0101  ABC transporter related protein  60.28 
 
 
299 aa  338  5.9999999999999996e-92  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  58.76 
 
 
337 aa  334  9e-91  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.751927  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3997  ABC transporter related  59.59 
 
 
313 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4071  ABC transporter related  59.59 
 
 
313 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146154  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4011  ABC transporter related  59.59 
 
 
313 aa  333  3e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0155501  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4499  ABC transporter-related protein  61.03 
 
 
301 aa  332  7.000000000000001e-90  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.151592  normal  0.728129 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6149  ABC transporter related  56.55 
 
 
328 aa  330  1e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2618  ABC transporter related  58.94 
 
 
317 aa  327  1.0000000000000001e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000477395  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2197  ABC transporter related  58.68 
 
 
300 aa  325  5e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1051  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  49.13 
 
 
302 aa  314  9.999999999999999e-85  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22150  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  55.45 
 
 
324 aa  309  2.9999999999999997e-83  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.228771 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06690  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  58.59 
 
 
317 aa  303  2.0000000000000002e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3296  ABC transporter related  60.34 
 
 
247 aa  290  3e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2206  ABC transporter related  50.51 
 
 
307 aa  265  8e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758752  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2252  ABC transporter related  50.51 
 
 
307 aa  265  8e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.951966  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2195  ABC transporter related  50.17 
 
 
307 aa  262  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.144611  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2922  ABC transporter related protein  50.17 
 
 
304 aa  255  8e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1774  ABC transporter related protein  39.66 
 
 
304 aa  217  2e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5524  ABC transporter related protein  43.34 
 
 
304 aa  211  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4579  ABC transporter related  34.81 
 
 
300 aa  209  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146186  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3610  ABC transporter, ATP-binding protein  36.46 
 
 
297 aa  206  5e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000012403  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3620  ABC transporter, ATP-binding protein  36.15 
 
 
297 aa  204  1e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627092  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3351  ABC transporter, ATP-binding protein  36.15 
 
 
297 aa  203  2e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182827  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3702  ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 
297 aa  204  2e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000381067  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1615  ABC transporter, ATP-binding protein  36.49 
 
 
297 aa  203  3e-51  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.002407  hitchhiker  0.000000022556 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3388  ABC transporter ATP-binding protein  36.15 
 
 
297 aa  202  5e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.955224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3300  ABC transporter, ATP-binding protein  36.15 
 
 
297 aa  202  5e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000068812  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3653  ABC transporter ATP-binding protein  36.15 
 
 
297 aa  202  5e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.169658  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3604  ABC transporter, ATP-binding protein  36.15 
 
 
297 aa  202  5e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.12304e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3279  ABC transporter related  36.03 
 
 
297 aa  202  5e-51  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00236807  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4248  ABC transporter related protein  39.6 
 
 
390 aa  201  9.999999999999999e-51  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  40.46 
 
 
307 aa  201  9.999999999999999e-51  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2771  ABC transporter related  38.46 
 
 
307 aa  198  7.999999999999999e-50  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160437 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1634  ABC transporter related  34.02 
 
 
297 aa  197  1.0000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00180587  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  34.26 
 
 
293 aa  192  5e-48  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1987  ABC transporter, ATP-binding protein  41.86 
 
 
314 aa  192  6e-48  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00134078  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  34.26 
 
 
293 aa  191  2e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0022  ABC transporter ATP-binding protein, CesC  33.1 
 
 
291 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0353  ABC transporter related  40 
 
 
303 aa  185  9e-46  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7394  ABC transporter ATP-binding protein  37.95 
 
 
306 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0080  ABC transporter related  35.29 
 
 
305 aa  183  3e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  30.34 
 
 
293 aa  176  6e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1186  ABC transporter related  26.62 
 
 
290 aa  175  9e-43  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  39.32 
 
 
305 aa  175  9.999999999999999e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2171  ABC transporter related  33.22 
 
 
299 aa  171  1e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2644  ABC transporter related  37.97 
 
 
334 aa  170  2e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1839  ABC transporter related  35.83 
 
 
339 aa  169  4e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1245  ABC transporter related protein  34.68 
 
 
313 aa  169  7e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  42.31 
 
 
250 aa  167  1e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1988  ABC transporter, ATP-binding protein  29.93 
 
 
293 aa  165  6.9999999999999995e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000119924  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3144  ABC transporter related  37.67 
 
 
301 aa  165  8e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  39.24 
 
 
256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  35.53 
 
 
310 aa  162  6e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  38.36 
 
 
318 aa  162  6e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  36.42 
 
 
301 aa  162  6e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  37.7 
 
 
332 aa  161  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2940  ABC transporter related  39.39 
 
 
249 aa  159  6e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0660  ABC transporter related  34.48 
 
 
313 aa  158  9e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.946314  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1526  ABC transporter related protein  35.55 
 
 
305 aa  158  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  43.38 
 
 
279 aa  157  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2985  ABC transporter related protein  35.78 
 
 
327 aa  157  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1082  ABC transporter related  32.79 
 
 
309 aa  157  3e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124615  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  33.88 
 
 
309 aa  156  3e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1669  ABC transporter related protein  35.47 
 
 
302 aa  155  8e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0454  ABC transporter related  27.87 
 
 
286 aa  155  1e-36  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  38.01 
 
 
298 aa  154  2e-36  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30210  ABC-type uncharacterized transport system, ATPase component  38.78 
 
 
326 aa  153  2.9999999999999998e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816797  normal  0.132168 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4073  ABC transporter related protein  37.04 
 
 
309 aa  153  2.9999999999999998e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  decreased coverage  0.00347724  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0189  ABC transporter related  35.92 
 
 
313 aa  153  4e-36  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0655  ABC transporter, ATP-binding protein  28.52 
 
 
295 aa  153  4e-36  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  41.63 
 
 
316 aa  153  4e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4231  ABC transporter related  32.23 
 
 
304 aa  152  5.9999999999999996e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>