More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2585 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2585  ABC transporter related  100 
 
 
302 aa  591  1e-168  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.557459 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2782  ABC transporter related  90.73 
 
 
302 aa  541  1e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.561462  decreased coverage  0.00015802 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3201  ABC transporter-like protein  69.39 
 
 
309 aa  403  1e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0999  ABC transporter related protein  65.99 
 
 
300 aa  388  1e-107  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.438735  normal  0.505813 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3674  ABC transporter related protein  67 
 
 
309 aa  387  1e-106  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0537  ABC transporter related  66.33 
 
 
306 aa  387  1e-106  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2211  ABC transporter related  68.37 
 
 
312 aa  383  1e-105  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1757  ABC transporter related  64.16 
 
 
306 aa  378  1e-104  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000332956  normal  0.307261 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5390  ABC transporter ATP-binding protein  66.22 
 
 
307 aa  380  1e-104  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22127  normal  0.430567 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0145  ABC transporter related protein  63.91 
 
 
340 aa  376  1e-103  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36950  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  67.46 
 
 
302 aa  377  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.369481  normal  0.0795079 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3755  ABC transporter related  64.29 
 
 
306 aa  376  1e-103  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2540  ABC transporter related  66.9 
 
 
308 aa  377  1e-103  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.913826  normal  0.404548 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5390  ABC transporter related protein  63.85 
 
 
305 aa  371  1e-102  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.629555  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2719  ABC transporter related  66.2 
 
 
308 aa  370  1e-101  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00204807 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4603  ABC transporter related protein  65.42 
 
 
308 aa  370  1e-101  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2559  ABC transporter related  66.78 
 
 
309 aa  367  1e-100  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3549  ABC transporter related protein  63.23 
 
 
308 aa  363  2e-99  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.156149 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11242  tetronasin ABC transporter ATP-binding protein  62.89 
 
 
311 aa  360  2e-98  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0309392  normal  0.0409812 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0251  ABC transporter related protein  64.05 
 
 
297 aa  358  7e-98  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1665  ABC transporter related  63.1 
 
 
316 aa  357  9.999999999999999e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.148623  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_25800  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  61.82 
 
 
312 aa  353  2e-96  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5634  ABC transporter related  61.07 
 
 
298 aa  351  1e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0393494 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1836  ABC transporter related  54.51 
 
 
298 aa  350  2e-95  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0014  ABC transporter related  64.38 
 
 
300 aa  348  9e-95  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.694421 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0323  ABC transporter related  55.56 
 
 
302 aa  346  4e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.309009 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0322  ABC transporter related  61.3 
 
 
302 aa  345  7e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3997  ABC transporter related  61.03 
 
 
313 aa  338  5e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.453886  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4071  ABC transporter related  61.03 
 
 
313 aa  338  5e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.146154  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4011  ABC transporter related  61.03 
 
 
313 aa  338  5e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0155501  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1681  ABC transporter related protein  60.73 
 
 
305 aa  337  9.999999999999999e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.283313 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16530  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  59.39 
 
 
337 aa  333  3e-90  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.751927  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0101  ABC transporter related protein  59.93 
 
 
299 aa  333  3e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.690768  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6149  ABC transporter related  57.41 
 
 
328 aa  331  8e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.146802 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4499  ABC transporter-related protein  60 
 
 
301 aa  328  5.0000000000000004e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.151592  normal  0.728129 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2618  ABC transporter related  58.75 
 
 
317 aa  326  3e-88  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000477395  normal  0.0769479 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2197  ABC transporter related  57.73 
 
 
300 aa  324  9e-88  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.922489 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1051  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  48.79 
 
 
302 aa  312  4.999999999999999e-84  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06690  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  58.98 
 
 
317 aa  304  1.0000000000000001e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22150  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  54.25 
 
 
324 aa  304  1.0000000000000001e-81  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.228771 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3296  ABC transporter related  59.59 
 
 
247 aa  289  4e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2206  ABC transporter related  50.86 
 
 
307 aa  265  8.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.758752  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2252  ABC transporter related  50.86 
 
 
307 aa  265  8.999999999999999e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.951966  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2195  ABC transporter related  50.52 
 
 
307 aa  262  4.999999999999999e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.144611  normal  0.0488033 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2922  ABC transporter related protein  50.68 
 
 
304 aa  261  1e-68  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1774  ABC transporter related protein  41.28 
 
 
304 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4579  ABC transporter related  35.47 
 
 
300 aa  211  1e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.146186  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3610  ABC transporter, ATP-binding protein  36.36 
 
 
297 aa  207  2e-52  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000012403  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5524  ABC transporter related protein  41.53 
 
 
304 aa  204  1e-51  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3620  ABC transporter, ATP-binding protein  35.47 
 
 
297 aa  204  2e-51  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000627092  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2771  ABC transporter related  39.13 
 
 
307 aa  202  4e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000160437 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3702  ABC transporter, ATP-binding protein  35.76 
 
 
297 aa  202  6e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000381067  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3351  ABC transporter, ATP-binding protein  35.47 
 
 
297 aa  202  8e-51  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000182827  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3388  ABC transporter ATP-binding protein  35.47 
 
 
297 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.955224  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3300  ABC transporter, ATP-binding protein  35.47 
 
 
297 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.00000000068812  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3653  ABC transporter ATP-binding protein  35.47 
 
 
297 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.169658  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3604  ABC transporter, ATP-binding protein  35.47 
 
 
297 aa  201  9.999999999999999e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.12304e-23 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1615  ABC transporter, ATP-binding protein  35.76 
 
 
297 aa  199  3.9999999999999996e-50  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.002407  hitchhiker  0.000000022556 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3279  ABC transporter related  35.14 
 
 
297 aa  198  7e-50  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00236807  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0089  ABC transporter related  40.6 
 
 
307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4248  ABC transporter related protein  39.19 
 
 
390 aa  196  3e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1634  ABC transporter related  35.27 
 
 
297 aa  196  5.000000000000001e-49  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00180587  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7394  ABC transporter ATP-binding protein  39.14 
 
 
306 aa  194  2e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1780  ABC transporter related  34.26 
 
 
293 aa  191  1e-47  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.09165  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0022  ABC transporter ATP-binding protein, CesC  33.1 
 
 
291 aa  190  2.9999999999999997e-47  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1987  ABC transporter, ATP-binding protein  41.86 
 
 
314 aa  189  4e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00134078  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1722  ABC transporter related  34.6 
 
 
293 aa  189  4e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0353  ABC transporter related  40.7 
 
 
303 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0080  ABC transporter related  34.95 
 
 
305 aa  181  1e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2171  ABC transporter related  33.9 
 
 
299 aa  176  3e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2159  ABC transporter related  31.63 
 
 
293 aa  176  5e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.548665  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2567  ABC transporter related protein  38.46 
 
 
305 aa  175  9e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1186  ABC transporter related  27.18 
 
 
290 aa  172  5.999999999999999e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0892  ABC transporter related  39.05 
 
 
332 aa  169  6e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0904315  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1245  ABC transporter related protein  34.01 
 
 
313 aa  168  9e-41  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1988  ABC transporter, ATP-binding protein  30.34 
 
 
293 aa  167  2e-40  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000119924  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2441  ABC transporter related protein  42.31 
 
 
250 aa  167  2e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  37.83 
 
 
301 aa  166  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5365  ABC transporter related protein  39.42 
 
 
256 aa  166  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0832768  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3760  ABC transporter related protein  35.39 
 
 
310 aa  163  4.0000000000000004e-39  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1839  ABC transporter related  34.17 
 
 
339 aa  162  8.000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1082  ABC transporter related  35.46 
 
 
309 aa  160  2e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.124615  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2644  ABC transporter related  37.22 
 
 
334 aa  160  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1526  ABC transporter related protein  37.67 
 
 
305 aa  160  3e-38  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0405  ABC transporter related protein  37.12 
 
 
346 aa  160  3e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0139  ABC transporter related protein  38.87 
 
 
318 aa  159  5e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3144  ABC transporter related  36.43 
 
 
301 aa  159  5e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3196  copper transport ATP-binding protein NosF  38.7 
 
 
298 aa  159  5e-38  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.361058  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2937  ABC transporter related  43.44 
 
 
279 aa  158  1e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2566  ABC transporter related  38.72 
 
 
310 aa  156  3e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.2512  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0660  ABC transporter related  35.86 
 
 
313 aa  157  3e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.946314  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0189  ABC transporter related  31.99 
 
 
313 aa  156  4e-37  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2635  ABC transporter related  35.12 
 
 
303 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304041  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2940  ABC transporter related  39.13 
 
 
249 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0454  ABC transporter related  28.57 
 
 
286 aa  155  6e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  32.79 
 
 
309 aa  154  1e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02610  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  40.49 
 
 
341 aa  154  1e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.737934  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  33.11 
 
 
316 aa  154  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1642  ABC transporter related protein  36.54 
 
 
323 aa  153  2.9999999999999998e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0787  ABC transporter related  41.28 
 
 
316 aa  154  2.9999999999999998e-36  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>